【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及药物研究,具体来说,涉及基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法。
技术介绍
1、药物-靶点相互作用(drug-target interactions,dtis)预测是药物研发过程中的关键步骤,传统的筛选实验需要耗费大量的人力物力,导致药物研发成本高昂,随着化合物库和靶点库的日益增长,利用计算方法预测dti已成为一种切实可行的方法,可以有效地提高药物研发效率,降低研发成本。基于计算方法预测dti主要分为两类:基于机器学习的dti预测和基于深度学习的dti预测;基于机器学习的dti预测方法利用随机森林、支持向量机和逻辑回归等算法在已知的药物-靶点相互作用数据集进行训练,学习药物和靶点之间的关联规律。
2、基于深度学习的dti预测方法将dti预测建模成二分类任务,此类方法采用深度学习模型自动学习药物和靶点的特征表示,并捕捉它们之间的复杂关系,随着深度学习技术的快速发展,已有大量的模型被提出用于dti预测。例如,将分子特征和反应特征作为模型输入,引入特征核函数,通过计算特征空间中的相似度来进行dti预测,以及
...【技术保护点】
1.基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,其特征在于,该基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块提取蛋白质序列特征及蛋白质2-mer序列特征包括以下步骤:
3.根据权利要求2所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块并结合图神经网络提取药物SMILES特征及药物分子图特征包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方
...【技术特征摘要】
1.基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,该基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块提取蛋白质序列特征及蛋白质2-mer序列特征包括以下步骤:
3.根据权利要求2所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块并结合图神经网络提取药物smiles特征及药物分子图特征包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述基于节点的初始特征及边的初始特征,利用有向消息传递网络提取药物分子图特征包括以下步骤:
5.根据权利要求4所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述对蛋白质序列特征、蛋白质2-mer序列特征、药物smiles特征及药物分子图特征进行多模态特征融合包括以下步骤:
6.根据权利要求5所述的基于等级多模态自注意力图神经网络...
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