基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法技术

技术编号:41676735 阅读:43 留言:0更新日期:2024-06-14 15:31
本发明专利技术公开了基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,涉及药物研究技术领域,该基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法包括以下步骤:利用卷积模块提取蛋白质序列特征及蛋白质2‑mer序列特征;利用卷积模块并结合图神经网络提取药物SMILES特征及药物分子图特征;对蛋白质序列特征、蛋白质2‑mer序列特征、药物SMILES特征及药物分子图特征进行多模态特征融合;将药物靶点对特征向量作为分类器的输入进行DTI预测。本发明专利技术综合了SMILES、药物分子图、蛋白质序列和2‑mer序列等多模态数据以帮助模型更好地理解和刻画药物和蛋白质的特征和相互作用关系。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及药物研究,具体来说,涉及基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法。


技术介绍

1、药物-靶点相互作用(drug-target interactions,dtis)预测是药物研发过程中的关键步骤,传统的筛选实验需要耗费大量的人力物力,导致药物研发成本高昂,随着化合物库和靶点库的日益增长,利用计算方法预测dti已成为一种切实可行的方法,可以有效地提高药物研发效率,降低研发成本。基于计算方法预测dti主要分为两类:基于机器学习的dti预测和基于深度学习的dti预测;基于机器学习的dti预测方法利用随机森林、支持向量机和逻辑回归等算法在已知的药物-靶点相互作用数据集进行训练,学习药物和靶点之间的关联规律。

2、基于深度学习的dti预测方法将dti预测建模成二分类任务,此类方法采用深度学习模型自动学习药物和靶点的特征表示,并捕捉它们之间的复杂关系,随着深度学习技术的快速发展,已有大量的模型被提出用于dti预测。例如,将分子特征和反应特征作为模型输入,引入特征核函数,通过计算特征空间中的相似度来进行dti预测,以及提出deepdta模本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,其特征在于,该基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块提取蛋白质序列特征及蛋白质2-mer序列特征包括以下步骤:

3.根据权利要求2所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块并结合图神经网络提取药物SMILES特征及药物分子图特征包括以下步骤:

4.根据权利要求3所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的DTI预测方法,其特征在于,所述...

【技术特征摘要】

1.基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,该基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块提取蛋白质序列特征及蛋白质2-mer序列特征包括以下步骤:

3.根据权利要求2所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述利用卷积模块并结合图神经网络提取药物smiles特征及药物分子图特征包括以下步骤:

4.根据权利要求3所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述基于节点的初始特征及边的初始特征,利用有向消息传递网络提取药物分子图特征包括以下步骤:

5.根据权利要求4所述的基于等级多模态自注意力图神经网络的dti预测方法,其特征在于,所述对蛋白质序列特征、蛋白质2-mer序列特征、药物smiles特征及药物分子图特征进行多模态特征融合包括以下步骤:

6.根据权利要求5所述的基于等级多模态自注意力图神经网络...

【专利技术属性】
技术研发人员:边继龙卢昊
申请(专利权)人:东北林业大学
类型:发明
国别省市:

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