一种分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法技术

本发明专利技术涉及生物技术领域，尤其涉及一种分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，1.所述方法包括如下步骤：S1.获取样本信息；S2.Watch‑PAT检测；S3.ceRNA表达谱构建；S4.OSA组和正常组差异表达lncRNA和mRNA的鉴定；S5.差异表达miRNA的靶基因预测；S6.OSA相关的lncRNA‑miRNA‑mRNA网络的构建；S7.GO和KEGG功能富集分析；S8.蛋白与蛋白相互作用网络的构建与枢纽基因的鉴定；S9.枢纽基因的表达水平及相关性分析；S10.枢纽基因表达水平的验证；S11.基于预测因子选择的基因组模型的构建；S12.列线图的验证；S13.构建关键基因的核心ceRNA子网络。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物，尤其涉及一种分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法。

技术介绍

1、阻塞性睡眠呼吸暂停(osa)是睡眠期间反复出现部分或完全上呼吸道塌陷，从而导致间歇性低氧血症，进而影响疾病的发生发展。随着时间的推移，osa可能会合并高血压、冠心病、2型糖尿病、脑梗塞、阿尔茨海默病、帕金森病和非酒精性脂肪肝等多系统疾病。osa影响到至少2-4％的成年人口，并且在65岁及以上的患者中，osa的患病率超过30％。在临床上，目前常用减肥治疗、气道内正压通气治疗、外科手术治疗、口腔矫治器及药物治疗等方式，但是效果都不理想。高的患病率及治疗效果的欠佳，都会严重的影响到患者生活质量。因此，这迫切需要寻找对osa的诊断和治疗更有效的新生物标志物和靶点。

2、非编码rna(ncrna)是一种不被翻译成蛋白质的功能性rna分子，包括微小rna(mirna)、长非编码rna(lncrna)、环状rna(circrna)、内含子rna、小干扰rna(sirna)、小核仁rna(snorna)、piwi相互作用rna(pirna)等。长链非编码rna (lncrna)是一类本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述Watch-PAT检测记录PAT、心率、血氧饱和度、鼾声、体位的睡眠或清醒阶段参数。

3.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述ceRNA表达谱构建包括分离总RNA并纯化定量、检查总RNA的片段分布、生成生物素化的cRNA目标并与芯片杂交。

4.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述OSA组和正常组差异表达lncRNA和mRNA的鉴定包括使用“Limma”...

【技术特征摘要】

1.一种分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述watch-pat检测记录pat、心率、血氧饱和度、鼾声、体位的睡眠或清醒阶段参数。

3.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述cerna表达谱构建包括分离总rna并纯化定量、检查总rna的片段分布、生成生物素化的crna目标并与芯片杂交。

4.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述osa组和正常组差异表达lncrna和mrna的鉴定包括使用“limma”包分别识别osa与正常组的差异表达lncrna和mrna。

5.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述差异表达mirna的靶基因预测使用mircode数据库来预测delncrna的靶向mirna，并使用mirtarbase，mirdb和targetscan数据库来预测差异表达的mirna的靶基因。

6.根据权利要求1所述的分析阻塞性睡眠呼吸暂停的方法，其特征在于，所述osa相关的lncrna-mirna-mrna网络的构建与mirna竞争结合的lncrna、共同靶基因的mirna及差异的mrna整合到cerna网络中，然后使用cytoscape软件对其进行可视化，...

【专利技术属性】
技术研发人员：成俊芬，孙锡仕，刘旺，
申请(专利权)人：广东医科大学附属第二医院，
类型：发明
国别省市：