一种基于TRP评分系统的胃癌免疫治疗反应预测方法技术方案

技术编号:41450663 阅读:29 留言:0更新日期:2024-05-28 20:39
本发明专利技术公开了一种基于TRP评分系统的胃癌免疫治疗反应预测方法,属于计算医学和肿瘤临床技术领域。本发明专利技术合并从公共数据库收集的胃癌数据,结合瞬时受体电位通道家族基因的表达,通过共识聚类分析确定了两个TRP胃癌亚型;分析了亚型之间生存、免疫浸润和通路的差异;采用差异表达分析,得到亚型之间的差异表达基因;使用WGCNA分析,从差异表达基因中筛选出与生存显著相关的基因,进一步再筛选出与胃癌亚型显著相关的基因;根据前面获得的基因进行PCA分析,构建TRP评分系统;通过对TRP评分进行一系列评估分析,发现它可以很好地预测胃癌患者的预后状况和PD‑1阻断剂治疗反应,筛选出更适合免疫治疗的患者,协助临床决策。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种基于trp评分系统的胃癌免疫治疗反应预测方法,属于计算医学和肿瘤临床。


技术介绍

1、胃癌是全球第五大常见的癌症类型,也是癌症相关死亡的第三主要原因。由于肿瘤的异质性,化疗和联合治疗等方法并不能始终取得理想的疗效,而且晚期胃癌患者的预后也较差。虽然靶向治疗和免疫治疗等新疗法逐渐被应用,但在临床应用上存在个体疗效差异较大的问题,因此如何给胃癌患者提供更精准和个性化的治疗是目前研究的方向。

2、瞬时受体电位通道(transient receptor potential channel,trp)在肿瘤发生发展中起到关键作用,甚至被称为癌通道。trp通道调节因子的表达或功能改变可以通过干扰关键的癌症信号传导途径中的ca2+信号传导功能来影响癌细胞的增殖、凋亡、基因转录和血管生成等过程。目前研究发现包括trpc6、trpm2、trpm5、trpm7、trpv4和trpv6等在内的trp调节因子在胃癌的发生和发展中发挥着重要作用。虽然pd-1/pd-l1免疫检查点抑制剂是胃癌免疫治疗的主要手段之一,但存在疗效个体差异较大的问题,无法提前预本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种胃癌免疫治疗反应的预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤一中确定了22个TRP调节因子,一致性聚类分析后获得了两种胃癌亚型。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤三中采用差异基因分析获得胃癌亚型之间的差异表达基因。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤四包括:对所述步骤三得到的差异表达基因进行WGCNA分析,以p值<0.05为阈值获得与生存显著相关的模块基因,然后对所述与生存显著相关的基因再次进行WGCNA分析,以p值<0.05为阈值获得与胃癌亚型最显著相...

【技术特征摘要】

1.一种胃癌免疫治疗反应的预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤一中确定了22个trp调节因子,一致性聚类分析后获得了两种胃癌亚型。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤三中采用差异基因分析获得胃癌亚型之间的差异表达基因。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤四包括:对所述步骤三得到的差异表达基因进行wgcna分析,以p值<0.05为阈值获得与生存显著相关的模块基因,然后对所述与生存显著相关的基因再次进行wgcna分析,以p值<0.05为阈值获得与胃癌亚型最显著相关的模块基因。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤一中收集的胃癌队列数据包括:基因芯片数据、测序数据...

【专利技术属性】
技术研发人员:王克伟李子喜李玲君
申请(专利权)人:江南大学附属医院
类型:发明
国别省市:

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