一种蛋白质酸碱稳定性预测方法、电子设备及存储介质技术

技术编号:41427322 阅读:24 留言:0更新日期:2024-05-28 20:25
本发明专利技术公开了一种蛋白质酸碱稳定性预测方法、电子设备及存储介质。所述方法包括(1)收集细菌及其生存耐受的耐受pH值、以及相应细菌的外泌蛋白质序列;(2)将细菌耐受pH值作为所述细菌的外泌蛋白质的耐受pH值,获得蛋白质序列及其耐受pH值数据;(3)以蛋白质序列及其耐受pH值数据作为训练样本,训练分类模型或回归模型,得到训练好的蛋白质酸碱稳定性预测模型;(4)将待预测酸碱稳定性的蛋白质序列,输入到步骤(3)获得的蛋白质酸碱稳定性预测模型中,获得蛋白质酸碱稳定性预测结果。本发明专利技术通过将细菌耐受pH值作为所述细菌的外泌蛋白质的耐受pH值,获得蛋白质序列及其耐受pH值数据,用于包括外泌蛋白和胞内蛋白的酸碱稳定性预测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物信息学领域,更具体地,涉及一种蛋白质酸碱稳定性预测方法、电子设备及存储介质


技术介绍

1、在蛋白质设计领域,往往重点关注蛋白质的结构和功能活性,但在实际生产应用中,还要求蛋白质具备一定的稳定性,其中就包括酸碱稳定性。如何从大量经过设计的候选活性蛋白质中,快速准确地筛选出满足生产需要的稳定蛋白质,也逐渐成为蛋白质设计领域中的重要环节。

2、对于蛋白质酸碱稳定性分析,目前没有可供直接使用的公共数据库,导致蛋白质酸碱稳定性研究由于数据局限而不能产出满足应用需求的研究成果。


技术实现思路

1、针对现有技术的以上缺陷或改进需求,本专利技术提供了一种蛋白质酸碱稳定性预测方法、电子设备及存储介质,其目的在于将细菌耐受ph值作为所述细菌的外泌蛋白质的耐受ph值,从而从现有细菌生存数据库中收集到蛋白质耐受ph值信息,用于预测算法,由此解决由于没有蛋白质酸碱稳定性数据库导致的数据局限性的技术问题。

2、为实现上述目的,按照本专利技术的一个方面,提供了一种蛋白质酸碱稳定性预测方法,包括以本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.如权利要求1所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,步骤(1)按照如下方法判断蛋白质是否为外泌蛋白质:

3.如权利要求1所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,步骤(1)将去除信号肽的序列作为外泌蛋白质序列。

4.如权利要求3所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,采用信号肽预测工具预测信号肽位点,将信号肽位点下游的序列作为去除信号肽的序列。

5.如权利要求1所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,步骤(3)当所述蛋白质酸碱稳定性预测模型,为分类模型时,将所述...

【技术特征摘要】

1.一种蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.如权利要求1所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,步骤(1)按照如下方法判断蛋白质是否为外泌蛋白质:

3.如权利要求1所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,步骤(1)将去除信号肽的序列作为外泌蛋白质序列。

4.如权利要求3所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,采用信号肽预测工具预测信号肽位点,将信号肽位点下游的序列作为去除信号肽的序列。

5.如权利要求1所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特征在于,步骤(3)当所述蛋白质酸碱稳定性预测模型,为分类模型时,将所述蛋白质按照耐受ph值范围进行分类,获得分类标签;将所述蛋白质序列以及其分类标签作为训练样本;

6.如权利要求1所述的蛋白质酸碱稳定性预测方法,其特...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈亮邓楠胡志鹏梁国龙
申请(专利权)人:深圳太力生物技术有限责任公司
类型:发明
国别省市:

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