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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及相关生物标志物的应用以及预测模型的构建方法,更具体一点说,涉及胃癌卵巢转移相关生物标志物的应用以及预测模型的构建方法,属于生物医学。
技术介绍
1、胃癌(gc)是世界上最常见的恶性肿瘤之一,高转移率和高复发率是其预后不良的主要原因。胃癌引起的卵巢转移,包括同时性转移及根治性手术后的异时性转移,约占女性胃癌患者的5-10%。与其他消化道肿瘤的转移性卵巢肿瘤相比,来自胃癌的卵巢转移肿瘤预后更差,中位生存时间仅为8-14个月。胃癌卵巢转移的情况复杂,目前对该病的研究仍未达成共识。胃癌是一种异质性疾病,具有独特的基因组学和表型特征,不同个体往往表现出不同的遗传学和分子特征。二代测序(ngs)的出现迅速扩展了对该病遗传基础的认识。一些研究从基因突变和潜在的可操作靶点的角度提供了对gc的新见解。癌症基因组图谱(thecancer genome atlas,tcga)的研究者对gc进行了全面基因组和转录组分析,将gc分为4种不同的亚型,分别为eb病毒感染型(ebv)、微卫星不稳定型(msi)、染色体不稳定型(cin)和基因组稳定型(gs)。近年来,胃癌不同亚型的分子分型也相继被提出。相关分子特征的研究已探索出潜在的预测胃癌预后的生物标志物。然而,胃癌卵巢转移对化疗和放疗敏感性通常较低,且缺乏有效的靶点。因此,阐明该疾病的分子特征的开发迫在眉睫。
2、中国专利文献cn215527029u、cn202632626u构建了胃癌卵巢转移的演示模型,但只展示了胃癌转移到卵巢的现象,并未对此过程的分子机制进行深入的探索。此外,也
技术实现思路
1、为了解决上述现有技术问题,本专利技术提供具有能够明确胃癌卵巢转移相关特征标志物,得到胃癌卵巢转移的分子特异性及同时性与异时性卵巢转移的突变特征,能够确定预测紫杉醇对胃癌卵巢转移患者作用的潜在生物标志物等技术特点的胃癌卵巢转移相关生物标志物的应用以及预测模型的构建方法。
2、为了实现上述目的,本专利技术是通过以下技术方案实现的:
3、本专利技术检测相关生物标志物的试剂在用于制备评估胃癌卵巢转移试剂中的应用。
4、优选的,所述分子标志物包含fus基因、etv4基因、cbfb基因、pdgfrb基因、ntrk1基因、rad51基因及融合基因,所述融合基因包含cldn18-arhgap26、cldn18-arhgap42、tcf3-mbd3。
5、本专利技术检测相关生物标志物的试剂在评估同时性及异时性胃癌卵巢转移中的应用。
6、优选的,所述分子标志物包括pik3ca基因、erbb3基因;当pik3ca基因突变时能够提示异时性胃癌卵巢转移;当erbb3基因突变时能够提示同时性胃癌卵巢转移。
7、本专利技术检测相关生物标志物的试剂在评估紫杉醇作用胃癌卵巢转移疗效中的应用。
8、优选的,所述生物标志物包括rhoa基因、aff2基因、pik3cd基因、taf1l基因、sall4基因、ccdc105基因、cldn18基因、cldn18-arhgap26/42融合基因,其中,所述rhoa基因、aff2基因、pik3cd基因、taf1l基因发生突变与紫杉醇作用的无效相关,所述sall4基因、ccdc105基因、cldn18基因突变与紫杉醇作用的反应相关,所述cldn18-arhgap26/42融合基因能够促进紫杉醇功效。
9、本专利技术一种用于胃癌卵巢转移预测的模型的构建方法,其特征在于该构建方法包括如下步骤:
10、步骤1):分别对于卵巢转移组样本和非卵巢转移组样本,进行相关标志物的检测,相关标志物包括fus基因、etv4基因、cbfb基因、pdgfrb基因、ntrk1基因、rad51基因及融合基因;
11、步骤2):将获得的结果按照线性模型进行拟合,获得判定风险评分模型。
12、本专利技术一种用于紫杉醇作用胃癌卵巢转移疗效预测模型的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
13、步骤1):分别对于紫杉醇作用有效组样本和紫杉醇作用无效组样本进行相关标志物的检测,相关标志物包括rhoa基因、aff2基因、pik3cd基因、taf1l基因、sall4基因、ccdc105基因、cldn18基因及cldn18-arhgap26/42融合基因;
14、步骤2):将获得的结果按照线性模型进行拟合,获得判定疗效预后评分模型。
15、本专利技术一种筛选紫杉醇作用获益胃癌卵巢转移人群的方法,以相关生物标志物检测筛选胃癌卵巢转移患者作为紫杉醇作用获益人群。
16、有益效果:本专利技术既得到了胃癌卵巢转移的分子特异性及同时性与异时性卵巢转移的突变特征,还确定了预测紫杉醇作用胃癌卵巢转移患者疗效的潜在生物标志物。
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1.检测相关生物标志物的试剂在用于制备评估胃癌卵巢转移试剂中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述分子标志物包含FUS基因、ETV4基因、CBFB基因、PDGFRB基因、NTRK1基因、RAD51基因及融合基因,所述融合基因包含CLDN18-ARHGAP26、CLDN18-ARHGAP42、TCF3-MBD3。
3.检测相关生物标志物的试剂在评估同时性及异时性胃癌卵巢转移中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述分子标志物包括PIK3CA基因、ERBB3基因;当PIK3CA基因突变时能够提示异时性胃癌卵巢转移;当ERBB3基因突变时能够提示同时性胃癌卵巢转移。
5.检测相关生物标志物的试剂在评估紫杉醇作用胃癌卵巢转移疗效中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述生物标志物包括RHOA基因、AFF2基因、PIK3CD基因、TAF1L基因、SALL4基因、CCDC105基因、CLDN18基因、CLDN18-ARHGAP26/42融合基因,其中,所述RHOA基因、AFF2基因、
7.一种用于胃癌卵巢转移预测的模型的构建方法,其特征在于该构建方法包括如下步骤:
8.一种用于紫杉醇作用胃癌卵巢转移疗效预测模型的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
9.一种筛选紫杉醇作用获益胃癌卵巢转移人群的方法,其特征在于,以权利要求5或8中所述相关生物标志物检测筛选胃癌卵巢转移患者作为紫杉醇作用获益人群。
...【技术特征摘要】
1.检测相关生物标志物的试剂在用于制备评估胃癌卵巢转移试剂中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述分子标志物包含fus基因、etv4基因、cbfb基因、pdgfrb基因、ntrk1基因、rad51基因及融合基因,所述融合基因包含cldn18-arhgap26、cldn18-arhgap42、tcf3-mbd3。
3.检测相关生物标志物的试剂在评估同时性及异时性胃癌卵巢转移中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述分子标志物包括pik3ca基因、erbb3基因;当pik3ca基因突变时能够提示异时性胃癌卵巢转移;当erbb3基因突变时能够提示同时性胃癌卵巢转移。
5.检测相关生物标志物的试剂在评估紫杉醇作用胃癌卵巢转移疗效中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述生...
【专利技术属性】
技术研发人员:俞鹏飞,程向东,方井泉,黄兴茂,杜义安,黄灵,
申请(专利权)人:浙江省肿瘤医院,
类型:发明
国别省市:
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