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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物免疫,涉及犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒的pcr检测引物、探针及其应用,特别涉及一种用于犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒的三重实时荧光定量pcr检测的引物探针组合物及其检测方法和应用。
技术介绍
1、犬瘟热病毒(cdv)及犬细小病毒(cpv)是目前危害犬的2种主要病原体,二者具有高度接触传播性。cdv属于副黏病毒科、麻疹病毒属,为单股负链不分节的rna病毒,主要引起发病犬出现双相热、结膜炎、白细胞减少、支气管及肺炎、中枢神经系统损害等临床表现。犬细小病毒为单链dna病毒,在全球范围内广泛分布,能够引起典型出血性肠炎,在犬中传染性及致病性较强。犬冠状病毒(ccov)属于尼多病毒目、冠状病毒科、a-冠状病毒属为单股正链rna病毒,在犬群中具有发病率高、病死率低的特点,但幼犬感染后病死率较高。临床腹泻病例中常发生cpv与ccov混合感染,同时,cdv感染犬时会引起全身性的免疫抑制现象,犬只在发生3种病毒混合感染时的存活率较低。临床上,常规的诊断方法如病毒分离、血清学诊断方法等存在着耗时长、敏感度低的缺点,已不能满足现实临床诊断需要。目前兽医诊所使用的胶体金快速诊断盒,生产厂家众多,产品质量参差不齐,敏感性和准确性均不确实。pcr是目前使用最多且可靠性较强的实验室诊断检测方法,通过设计引物对病毒核酸进行检测从而确定有无病毒感染,但是传统的pcr方法检测灵敏度较低,为了弥补这一缺陷,后续又出现了荧光定量pcr技术。荧光定量pcr具有快速、敏感、特异等优点,在病原的特异性检测方面表现出明显的优势。近年来虽然也有一些关
技术实现思路
1、基于此,本研究针对cdv、cpv和ccov设计多对特异性引物和taq man探针,建立一种可以同时鉴别和检测三种病毒的三重荧光定量pcr方法,为临床上犬科动物疫病诊断和防控提供了可靠技术手段。
2、基于上述研究,本专利技术的目的在于提供一种用于犬瘟热病毒(cdv)、犬细小病毒(cpv)和犬冠状病毒(ccov)三重荧光定量pcr检测的引物探针组合物及其检测方法和应用。
3、本专利技术的目的可以通过以下技术方案实现:
4、一种用于cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的引物及探针组合物,由下述1)-3)所示的引物和探针组成:
5、1)检测犬瘟热病毒的引物和探针:
6、a1.引物序列:
7、上游引物cdv-f:5′-tagatccaggactcggcgat-3′(序列1);
8、下游引物cdv-r:5′-gtagtgcgcccaacacctaa-3′(序列2);
9、b1.探针序列:
10、探针cdv-p:5′-atcgaaaagatgaatgtttcatgt-3′(序列3);
11、2)检测犬细小病毒的引物和探针:
12、a2.引物序列:
13、上游引物cpv-f:5′-tggaaaggatgttcgctgga-3′(序列4);
14、下游引物cpv-r:5′-gcgaggctatcaacttccga-3′(序列5);
15、b2.探针序列:
16、探针cpv-p:5′-aacaactataccaaaccaattca-3′(序列6);
17、3)检测犬冠状病毒的引物和探针:
18、a3.引物序列:
19、上游引物ccov-f:5′-gctatcgcatggtgaagggt-3′(序列7);
20、下游引物ccov-r:5′-ggcaacccagacaactccat-3′(序列8);
21、b3.探针序列:
22、探针ccov-p:5′-tcagcgtaaagagcttcctgaaaggt-3′(序列9)。
23、其中,所述组合物中,探针的5′端和/或3′端携带有荧光标记,所述应该标记为fam,bhq1,tamra,bhq2或vic,bhq1。
24、上述的引物及探针组合物在cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测或制备用于cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒中的应用也属于本专利技术的保护范围。
25、本专利技术还提供一种cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒,该试剂盒包含上述的引物及探针组合物。
26、优选的,该试剂盒中还含有pcr技术常用试剂。
27、在本专利技术的一个实施方式中,所述试剂盒包括tagman 2×qpcr-mix预混液10μl、浓度为10μmol/l的上游引物cdv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cdv-r各0.4μl,浓度为10μmol/l的上游引物cpv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cpv-r、浓度为10μmol/l的上游引物ccov-f、浓度为10μmol/l的下游引物ccov-r各0.6μl;浓度为10μmol/l的探针cdv-p、浓度为10μmol/l的探针cpv-p、浓度为10μmol/l的探针ccov-p各0.3μl;rox reference dye ii(50×)0.4μl;模板2μl;rnase-free水3.5μl;其中,浓度为10μmol/l的上游引物cdv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cdv-r、浓度为10μmol/l的上游引物cpv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cpv-r、浓度为10μmol/l的上游引物ccov-p-f、浓度为10μmol/l的下游引物ccov-p-r、浓度为10μmol/l的探针cdv-p、浓度为10μmol/l的探针cpv-p、浓度为10μmol/l的探针ccov-p的体积比例为4:4:6:6:6:6:3:3:3。
28、上述的试剂盒在cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测中的应用也属于本专利技术的保护范围。
29、更进一步的,本专利技术提供一种cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测方法,以待测样品的dna或cdna为模板,采用上述的引物及探针组合物进行cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr扩增,根据ct值判断cdv、cpv和ccov的检测结果。
30、作为一种优选技术方案,所述cdv的ct值≤37为阳性,37<ct值<38为可疑,ct值≥38为阴性;cpv的ct值≤36为阳性,36<ct值<38为可疑,ct值≥38为阴性;ccov的ct值≤37为阳性,37<ct值<38为可疑,ct值≥38为阴性。
31、作为一种优选技术方案,所述cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr扩增的反应条件为:预变性95℃2min;变性95℃10s,退火和延伸60℃30s,40个循环。
32、作为一种优选技术方案,所述cdv本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒三重荧光定量PCR检测的引物及探针组合物,其特征在于,引物及探针组合物由下述1)-3)所示的引物和探针组成:
2.根据权利要求1所述的引物及探针组合物,其特征在于,所述组合物中,探针的5′端和/或3′端携带有荧光标记,所述荧光标记为FAM,BHQ1,TAMRA,BHQ2,VIC或BHQ1。
3.权利要求1或所述的引物及探针组合物在CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测或制备用于CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测的试剂盒中的应用。
4.一种CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含权利要求1或2所述的引物及探针组合物。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中还含有PCR技术常用试剂。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括Tag Man 2×qPCR-Mix预混液10μL、浓度为10μmol/L的上游引物CDV-F、浓度为10μmol/L的下游引物CDV-R各0.4μL,浓度为10μm
7.权利要求4-6中任意一项所述的试剂盒在CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测中的应用。
8.一种CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测方法,其特征在于,以待测样品的DNA或cDNA为模板,采用权利要求1或2所述的引物及探针组合物进行CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR扩增,根据Ct值判断CDV、CPV和CCoV的检测结果。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,CDV的Ct值≤37为阳性,37<Ct值<38为可疑,Ct值≥38为阴性;CPV的Ct值≤36为阳性,36<Ct值<38为可疑,Ct值≥38为阴性;CCoV的Ct值≤37为阳性,37<Ct值<38为可疑,Ct值≥38为阴性。
10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR扩增的反应条件为:预变性95℃2min;变性95℃10s,退火和延伸60℃30s,40个循环;
...【技术特征摘要】
1.一种用于犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒三重荧光定量pcr检测的引物及探针组合物,其特征在于,引物及探针组合物由下述1)-3)所示的引物和探针组成:
2.根据权利要求1所述的引物及探针组合物,其特征在于,所述组合物中,探针的5′端和/或3′端携带有荧光标记,所述荧光标记为fam,bhq1,tamra,bhq2,vic或bhq1。
3.权利要求1或所述的引物及探针组合物在cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测或制备用于cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒中的应用。
4.一种cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含权利要求1或2所述的引物及探针组合物。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中还含有pcr技术常用试剂。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括tag man 2×qpcr-mix预混液10μl、浓度为10μmol/l的上游引物cdv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cdv-r各0.4μl,浓度为10μmol/l的上游引物cpv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cpv-r、浓度为10μmol/l的上游引物ccov-f、浓度为10μmol/l的下游引物ccov-r各0.6μl;浓度为10μmol/l的探针cdv-p、浓度为10μmol/l的探针cpv-p、浓度为10μmol/l的探针ccov-p各0.3μl;roxreference dye ii(50×)0....
【专利技术属性】
技术研发人员:陈登金,张蕾,吕云杨,宋芳,董春娜,张漫,肖进,
申请(专利权)人:中牧实业股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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