System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒的PCR检测引物、探针及其应用制造技术_技高网

犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒的PCR检测引物、探针及其应用制造技术

技术编号:41248207 阅读:2 留言:0更新日期:2024-05-09 23:57
本发明专利技术公开了犬瘟热病毒(CDV)、犬细小病毒(CPV)和犬冠状病毒(CCoV)的PCR检测引物、探针及其应用。本发明专利技术的引物及探针组合由序列表中序列1‑9所示的引物和探针组成,本发明专利技术的特异性引物和Taq Man探针,可以快速、准确和灵敏检测CDV、CPV和CCoV的三重荧光定量PCR方法,该方法可以用于临床样品的检测以及实验室病原检测,为CDV、CPV和CCoV的防控和研究提供一个有效技术方法,为临床上犬科动物疫病诊断和防控提供了可靠技术手段。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物免疫,涉及犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒的pcr检测引物、探针及其应用,特别涉及一种用于犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒的三重实时荧光定量pcr检测的引物探针组合物及其检测方法和应用。


技术介绍

1、犬瘟热病毒(cdv)及犬细小病毒(cpv)是目前危害犬的2种主要病原体,二者具有高度接触传播性。cdv属于副黏病毒科、麻疹病毒属,为单股负链不分节的rna病毒,主要引起发病犬出现双相热、结膜炎、白细胞减少、支气管及肺炎、中枢神经系统损害等临床表现。犬细小病毒为单链dna病毒,在全球范围内广泛分布,能够引起典型出血性肠炎,在犬中传染性及致病性较强。犬冠状病毒(ccov)属于尼多病毒目、冠状病毒科、a-冠状病毒属为单股正链rna病毒,在犬群中具有发病率高、病死率低的特点,但幼犬感染后病死率较高。临床腹泻病例中常发生cpv与ccov混合感染,同时,cdv感染犬时会引起全身性的免疫抑制现象,犬只在发生3种病毒混合感染时的存活率较低。临床上,常规的诊断方法如病毒分离、血清学诊断方法等存在着耗时长、敏感度低的缺点,已不能满足现实临床诊断需要。目前兽医诊所使用的胶体金快速诊断盒,生产厂家众多,产品质量参差不齐,敏感性和准确性均不确实。pcr是目前使用最多且可靠性较强的实验室诊断检测方法,通过设计引物对病毒核酸进行检测从而确定有无病毒感染,但是传统的pcr方法检测灵敏度较低,为了弥补这一缺陷,后续又出现了荧光定量pcr技术。荧光定量pcr具有快速、敏感、特异等优点,在病原的特异性检测方面表现出明显的优势。近年来虽然也有一些关于cdv、cpv和ccov的荧光定量pcr检测方法报道,但大都是针对一个病原的单重检测,这就无法满足临床上对多种临床症状相似且经常混合感染的病例进行准确快速诊断的实际需求。


技术实现思路

1、基于此,本研究针对cdv、cpv和ccov设计多对特异性引物和taq man探针,建立一种可以同时鉴别和检测三种病毒的三重荧光定量pcr方法,为临床上犬科动物疫病诊断和防控提供了可靠技术手段。

2、基于上述研究,本专利技术的目的在于提供一种用于犬瘟热病毒(cdv)、犬细小病毒(cpv)和犬冠状病毒(ccov)三重荧光定量pcr检测的引物探针组合物及其检测方法和应用。

3、本专利技术的目的可以通过以下技术方案实现:

4、一种用于cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的引物及探针组合物,由下述1)-3)所示的引物和探针组成:

5、1)检测犬瘟热病毒的引物和探针:

6、a1.引物序列:

7、上游引物cdv-f:5′-tagatccaggactcggcgat-3′(序列1);

8、下游引物cdv-r:5′-gtagtgcgcccaacacctaa-3′(序列2);

9、b1.探针序列:

10、探针cdv-p:5′-atcgaaaagatgaatgtttcatgt-3′(序列3);

11、2)检测犬细小病毒的引物和探针:

12、a2.引物序列:

13、上游引物cpv-f:5′-tggaaaggatgttcgctgga-3′(序列4);

14、下游引物cpv-r:5′-gcgaggctatcaacttccga-3′(序列5);

15、b2.探针序列:

16、探针cpv-p:5′-aacaactataccaaaccaattca-3′(序列6);

17、3)检测犬冠状病毒的引物和探针:

18、a3.引物序列:

19、上游引物ccov-f:5′-gctatcgcatggtgaagggt-3′(序列7);

20、下游引物ccov-r:5′-ggcaacccagacaactccat-3′(序列8);

21、b3.探针序列:

22、探针ccov-p:5′-tcagcgtaaagagcttcctgaaaggt-3′(序列9)。

23、其中,所述组合物中,探针的5′端和/或3′端携带有荧光标记,所述应该标记为fam,bhq1,tamra,bhq2或vic,bhq1。

24、上述的引物及探针组合物在cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测或制备用于cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒中的应用也属于本专利技术的保护范围。

25、本专利技术还提供一种cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒,该试剂盒包含上述的引物及探针组合物。

26、优选的,该试剂盒中还含有pcr技术常用试剂。

27、在本专利技术的一个实施方式中,所述试剂盒包括tagman 2×qpcr-mix预混液10μl、浓度为10μmol/l的上游引物cdv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cdv-r各0.4μl,浓度为10μmol/l的上游引物cpv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cpv-r、浓度为10μmol/l的上游引物ccov-f、浓度为10μmol/l的下游引物ccov-r各0.6μl;浓度为10μmol/l的探针cdv-p、浓度为10μmol/l的探针cpv-p、浓度为10μmol/l的探针ccov-p各0.3μl;rox reference dye ii(50×)0.4μl;模板2μl;rnase-free水3.5μl;其中,浓度为10μmol/l的上游引物cdv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cdv-r、浓度为10μmol/l的上游引物cpv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cpv-r、浓度为10μmol/l的上游引物ccov-p-f、浓度为10μmol/l的下游引物ccov-p-r、浓度为10μmol/l的探针cdv-p、浓度为10μmol/l的探针cpv-p、浓度为10μmol/l的探针ccov-p的体积比例为4:4:6:6:6:6:3:3:3。

28、上述的试剂盒在cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测中的应用也属于本专利技术的保护范围。

29、更进一步的,本专利技术提供一种cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测方法,以待测样品的dna或cdna为模板,采用上述的引物及探针组合物进行cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr扩增,根据ct值判断cdv、cpv和ccov的检测结果。

30、作为一种优选技术方案,所述cdv的ct值≤37为阳性,37<ct值<38为可疑,ct值≥38为阴性;cpv的ct值≤36为阳性,36<ct值<38为可疑,ct值≥38为阴性;ccov的ct值≤37为阳性,37<ct值<38为可疑,ct值≥38为阴性。

31、作为一种优选技术方案,所述cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr扩增的反应条件为:预变性95℃2min;变性95℃10s,退火和延伸60℃30s,40个循环。

32、作为一种优选技术方案,所述cdv本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒三重荧光定量PCR检测的引物及探针组合物,其特征在于,引物及探针组合物由下述1)-3)所示的引物和探针组成:

2.根据权利要求1所述的引物及探针组合物,其特征在于,所述组合物中,探针的5′端和/或3′端携带有荧光标记,所述荧光标记为FAM,BHQ1,TAMRA,BHQ2,VIC或BHQ1。

3.权利要求1或所述的引物及探针组合物在CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测或制备用于CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测的试剂盒中的应用。

4.一种CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含权利要求1或2所述的引物及探针组合物。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中还含有PCR技术常用试剂。

6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括Tag Man 2×qPCR-Mix预混液10μL、浓度为10μmol/L的上游引物CDV-F、浓度为10μmol/L的下游引物CDV-R各0.4μL,浓度为10μmol/L的上游引物CPV-F、浓度为10μmol/L的下游引物CPV-R、浓度为10μmol/L的上游引物CCoV-F、浓度为10μmol/L的下游引物CCoV-R各0.6μL;浓度为10μmol/L的探针CDV-P、浓度为10μmol/L的探针CPV-P、浓度为10μmol/L的探针CCoV-P各0.3μL;ROXReference Dye II(50×)0.4μL;模板2μL;RNase-free水3.5μL;其中,浓度为10μmol/L的上游引物CDV-F、浓度为10μmol/L的下游引物CDV-R、浓度为10μmol/L的上游引物CPV-F、浓度为10μmol/L的下游引物CPV-R、浓度为10μmol/L的上游引物CCoV-P-F、浓度为10ρmol/L的下游引物CCoV-P-R、浓度为10μmol/L的探针CDV-P、浓度为10μmol/L的探针CPV-P、浓度为10μmol/L的探针CCoV-P的体积比例为4∶4∶6∶6∶6∶6∶3∶3∶3。

7.权利要求4-6中任意一项所述的试剂盒在CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测中的应用。

8.一种CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR检测方法,其特征在于,以待测样品的DNA或cDNA为模板,采用权利要求1或2所述的引物及探针组合物进行CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR扩增,根据Ct值判断CDV、CPV和CCoV的检测结果。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,CDV的Ct值≤37为阳性,37<Ct值<38为可疑,Ct值≥38为阴性;CPV的Ct值≤36为阳性,36<Ct值<38为可疑,Ct值≥38为阴性;CCoV的Ct值≤37为阳性,37<Ct值<38为可疑,Ct值≥38为阴性。

10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述CDV、CPV和CCoV三重荧光定量PCR扩增的反应条件为:预变性95℃2min;变性95℃10s,退火和延伸60℃30s,40个循环;

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【技术特征摘要】

1.一种用于犬瘟热病毒、犬细小病毒和犬冠状病毒三重荧光定量pcr检测的引物及探针组合物,其特征在于,引物及探针组合物由下述1)-3)所示的引物和探针组成:

2.根据权利要求1所述的引物及探针组合物,其特征在于,所述组合物中,探针的5′端和/或3′端携带有荧光标记,所述荧光标记为fam,bhq1,tamra,bhq2,vic或bhq1。

3.权利要求1或所述的引物及探针组合物在cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测或制备用于cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒中的应用。

4.一种cdv、cpv和ccov三重荧光定量pcr检测的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包含权利要求1或2所述的引物及探针组合物。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中还含有pcr技术常用试剂。

6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括tag man 2×qpcr-mix预混液10μl、浓度为10μmol/l的上游引物cdv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cdv-r各0.4μl,浓度为10μmol/l的上游引物cpv-f、浓度为10μmol/l的下游引物cpv-r、浓度为10μmol/l的上游引物ccov-f、浓度为10μmol/l的下游引物ccov-r各0.6μl;浓度为10μmol/l的探针cdv-p、浓度为10μmol/l的探针cpv-p、浓度为10μmol/l的探针ccov-p各0.3μl;roxreference dye ii(50×)0....

【专利技术属性】
技术研发人员:陈登金张蕾吕云杨宋芳董春娜张漫肖进
申请(专利权)人:中牧实业股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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