【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于菠萝杂交育种，具体涉及一种鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记、引物组及其应用。
技术介绍
1、菠萝是世界三大热带果树之一，我国是菠萝十大主产国之一，主要分布在广东、海南、云南、广西和福建等省区，是热区的支柱产业。但菠萝生产中主要的栽培品种为‘巴厘’，已有将近100年的历史，品种单一、退化导致采收期集中、品质下降等问题日渐突出，成为产业迫切需要解决的问题之一。新品种的选育与推广是品种结构调整、产业提质增效的有效手段。目前，人工杂交是菠萝新品种选育的主要方法。但其育种周期长，且由于开放授粉，容易产生假杂种。而杂交后代根据田间表型性状进行杂种真实性的鉴定费时费力，且易受环境和人为因素的影响，随着亲本的集中使用，杂交子代的形态学差异越来越小，利用形态学特征进行真假杂种的鉴定越来越难。
2、dna分子标记鉴定品种身份，具有准确可靠、简单快速、易于操作、时效性好等优点。广泛应用于柑橘、苹果、葡萄、樱桃、桃、猕猴桃等多种果树的品种真伪鉴定。国际植物新品种保护联盟(upov)在bmt分子测试指南中，已将ssr标记技术和单核苷酸多态性技术(snp)推荐为品种鉴定或种子纯度鉴定的两种技术。但ssr技术存在检测位点较少、通量低、结果代表性差、不易实现数据共享等缺陷。snp标记在基因组中分布密度高且均匀，可以实现高通量检测，更适合数据库的整合和共享。因此被认为是最具有应用前景的分子标记技术。
3、目前菠萝杂交后代的鉴定主要是通过对品种进行多年多点的形态学特征观察，尚未有利用分子标记对f1代杂交群
技术实现思路
1、针对以上问题，本专利技术提供了一种可用于‘josapine’和‘md2’的杂交后代真实性鉴定的snp标记，对‘josapine’和‘md2’为亲本的f1群体进行杂种真实性鉴定，为提高菠萝杂交育种效率及进一步开展遗传研究奠定基础。
2、为了达到上述目的，本专利技术可以采用以下技术方案：
3、本专利技术一方面提供一种鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记，包括以下snp标记中的一组或两组：(a)位于lg6染色体的3376404，基因型为g/c；(b)位于lg18染色体的5578047，基因型为a/g。
4、本专利技术另一方面提供一种扩增上述的鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记的引物组，扩增上述snp标记(a)的引物组包括如seq id no.1、seq id no.2和seq idno.3所示序列；扩增上述snp标记(a)的引物组包括如seq id no.4、seq id no.5和seq idno.6所示序列。
5、本专利技术再一方面提供一种鉴定上述的鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记的检测试剂，其特征在于，包括上述的引物组。
6、本专利技术再一方面提供一种鉴定上述的鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记的检测试剂盒，其包括上述的引物组或以上任一所述的检测试剂。
7、本专利技术再一方面提供一种上述的鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记或上述的引物组或以上任一所述的检测试剂或以上任一所述的检测试剂盒在菠萝遗传育种中的应用。
8、本专利技术有益效果至少包括：基于本专利技术提供的鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记设计的引物组可以快速有效的鉴定菠萝josapine和md2杂种的真实性，鉴定结果准确可靠，有利于菠萝的遗传育种。
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1.一种鉴定菠萝Josapine和MD2杂种真实性的SNP标记，其特征在于，包括以下SNP标记中的一组或两组：(a)位于LG6染色体的3376404，基因型为G/C；(b)位于LG18染色体的5578047，基因型为A/G。
2.扩增权利要求1所述的鉴定菠萝Josapine和MD2杂种真实性的SNP标记的引物组，其特征在于，扩增上述SNP标记(a)的引物组包括如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示序列；扩增上述SNP标记(b)的引物组包括如SEQ ID No.4、SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示序列。
3.鉴定权利要求1所述的鉴定菠萝Josapine和MD2杂种真实性的SNP标记的检测试剂，其特征在于，包括权利要求2所述的引物组。
4.鉴定权利要求1所述的鉴定菠萝Josapine和MD2杂种真实性的SNP标记的检测试剂盒，其特征在于，包括权利要求2所述的引物组或权利要求3所述的检测试剂。
5.权利要求1所述的鉴定菠萝Josapine和MD2杂种真实性的SNP标记或权利要求2所述
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，应用包括：SNP标记或引物组或检测试剂或检测试剂盒在鉴定菠萝Josapine和MD2杂种真实性中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，当待测样本的基因型为纯合基因型，则为假杂种；当待测样本基因型为杂合基因型，则为真杂种。
...【技术特征摘要】
1.一种鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记，其特征在于，包括以下snp标记中的一组或两组：(a)位于lg6染色体的3376404，基因型为g/c；(b)位于lg18染色体的5578047，基因型为a/g。
2.扩增权利要求1所述的鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记的引物组，其特征在于，扩增上述snp标记(a)的引物组包括如seq id no.1、seq id no.2和seq id no.3所示序列；扩增上述snp标记(b)的引物组包括如seq id no.4、seq id no.5和seq id no.6所示序列。
3.鉴定权利要求1所述的鉴定菠萝josapine和md2杂种真实性的snp标记的检测试剂，其特征在于，包括...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘胜辉，林文秋，吴青松，贾盼盼，余虹霖，
申请(专利权)人：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所，
类型：发明
国别省市：
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