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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于辣椒雄性不育遗传育种领域,具体地说是辣椒核雄性不育基因的snp分子标记及其获得方法和应用。
技术介绍
1、雄性不育是高等植物存在的一种自然现象,从发现雄性不育现象以来,多种作物已利用雄性不育生产了杂交种,并取得了显著的成就;近年来,随着辣椒高产、优质、抗逆等目标育种难度的增加,利用杂种互补效应实现辣椒产量、抗性、品质等性状的同步突破,已成为辣椒育种研究的一个重要发展方向。目前辣椒雄性不育系在生产上利用尚存在一定困难,市场大面积推广的辣椒杂交种,仍然以人工去雄为主,制种成本过高仍是辣椒杂种优势利用的主要限制因素之一;辣椒杂交种的大规模推广利用仍有待于高效率、低投入的制种方法的突破。
2、分子标记是分析种质资源遗传多样性的有效工具;近年来,随着dna分子标记的发展,以分子杂交为基础的第一代分子标记rflp、rapd、aflp、srfa标记应用较早,应用范围较为广泛;以pcr技术为基础的第二代分子标记ssr、scar、issr标记随后开始应用,精准度有所提高;以单核苷酸多态性为基础的第三代标记snp标记基数取得了一定进展,snp是指在基因组上由单个核苷酸变异所引起的dna序列多态性,具有密度高、分布范围广、分型简单等优点;随着全基因组序列鉴定技术的发展,snp分子标记越来越受到重视和应用;另外,由于分子标记技术使用成本较高、不易操作、很难获得有效地分子标记,虽然分子标记辅助选择被认为是辣椒性状改良表型选择最有效的替代手段,在寻找与性状连锁的分子标记方面也耗费了大量的人力物力,但是迄今为止分子标记辅助选择还没有
技术实现思路
1、为了解决上述技术问题,本专利技术提供辣椒核雄性不育基因的snp分子标记及其获得方法和应用,以解决现有技术中辣椒雄性不育两系育种过程中工作量大、费时费力问题。
2、辣椒核雄性不育基因的snp分子标记及其获得方法,包括辣椒雄性不育基因紧密连锁的分子标记的方法和鉴定或辅助鉴定待测辣椒是否为雄性不育类型的方法。
3、优选的,所述辣椒雄性不育基因紧密连锁的分子标记的方法,包括以下步骤:
4、s1:以辣椒雄性不育系pby-1为母本,雄性可育系pby-1为父本,构建f2遗传群体;
5、s2:提取辣椒亲本及其f2代单株的基因组dna,构建不育基因池和可育基因池;
6、s3:采用bsa重测序,通过关联分析,获得具有多态性snp位点的dna片段序列;再利用此dna片段序列,设计特异引物:上游引物:上游引物:5’-ttcttcggattgtccatggt-3’;下游引物5’-caccaatgctatgtgccaaa-3’。
7、优选的,所述鉴定或辅助鉴定待测辣椒是否为雄性不育类型的方法,包括以下步骤:
8、s1:检测待测辣椒基因组pbysnp位点基因型为a/a纯合、t/t纯合或a/t杂合;
9、s2:若所述待测辣椒基因组pbysnp位点基因型为t/t纯合,则待测辣椒基因组含有纯合的雄性不育基因,表型为雄性不育;
10、s3:若待测辣椒基因组上的pbysnp位点基因型为a/a或a/t,则待测辣椒基因组不含雄性不育基因或含有杂合型的雄性不育基因,表型均为雄性可育。
11、优选的,所述检测待测辣椒基因组pbysnp位点基因型为a/a纯合、t/t纯合或a/t杂合的方法为:
12、(1)利用特异引物进行pcr扩增;
13、(2)将扩增产物测序
14、与现有技术相比,本专利技术具有如下有益效果:
15、本专利技术使用的pcr扩增及测序体系,不需要特殊的pcr和测序仪器,普通的实验室均能达到要求,可以减少工作量,省时省力,容易操作;本专利技术获得与辣椒雄性不育基因紧密连锁的snp位点及标记,是在对辣椒雄性不育种质pby-1、可育种质pby-1及其f2遗传群体分析而获得的新标记,该标记与雄性不育基因紧密连锁,pcr扩增重复性好,稳定性强,可以用于辣椒雄性不育品种鉴定和辣椒雄性不育后代的分子辅助选择,进而加快雄性不育品种的育种进程,为克隆辣椒雄性不育基因、基因序列分析以及转雄性不育基因的辣椒研究奠定了良好的基础。
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1.辣椒核雄性不育基因的SNP分子标记及其获得方法,其特征在于:包括辣椒雄性不育基因紧密连锁的分子标记的方法和鉴定或辅助鉴定待测辣椒是否为雄性不育类型的方法。
2.如权利要求1所述辣椒核雄性不育基因的SNP分子标记及其获得方法,其特征在于:所述辣椒雄性不育基因紧密连锁的分子标记的方法,包括以下步骤:
3.如权利要求1所述辣椒核雄性不育基因的SNP分子标记及其获得方法,其特征在于:所述鉴定或辅助鉴定待测辣椒是否为雄性不育类型的方法,包括以下步骤:
4.如权利要求3所述辣椒核雄性不育基因的SNP分子标记及其获得方法,其特征在于:所述检测待测辣椒基因组pbySNP位点基因型为A/A纯合、T/T纯合或A/T杂合的方法为:
【技术特征摘要】
1.辣椒核雄性不育基因的snp分子标记及其获得方法,其特征在于:包括辣椒雄性不育基因紧密连锁的分子标记的方法和鉴定或辅助鉴定待测辣椒是否为雄性不育类型的方法。
2.如权利要求1所述辣椒核雄性不育基因的snp分子标记及其获得方法,其特征在于:所述辣椒雄性不育基因紧密连锁的分子标记的方法,包括以下步骤:
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【专利技术属性】
技术研发人员:裴红霞,高晶霞,冯海萍,李生梅,耿世伟,秦小军,桑婷,李慧,沈甜,倪静,陈洁,
申请(专利权)人:宁夏农林科学院园艺研究所宁夏设施农业工程技术研究中心,
类型:发明
国别省市:
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