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【技术实现步骤摘要】
本申请涉及一种用于基于群体分析的质量控制(qc)自动设门的系统或方法。该系统或方法特别可用于样本处理仪(例如,流式细胞分选仪或分析仪)。
技术介绍
1、本部分的内容仅提供了与本公开相关的背景信息,其不一定构成现有技术。
2、样本处理仪通常用于对包括悬浮粒子(例如,诸如生物粒子、非生物粒子)或细胞的液体样本进行分析和/或用于将其中的悬浮粒子或细胞进行分选。qc实验一般用于测试此类仪器的性能指标,其包括收集qc球、设置门以及标记qc球等过程。其中,采集参数可以调整,以保证由qc球中采集的数据分布在有效范围内。但是,在某些情况下,qc实验会因为qc杂质或噪声的影响而失败,从而导致自动设门的位置错误。为了提高qc实验的通过率,需要一种新的方法来进行qc实验并正确计算qc球的门位置。
3、现有技术中,可将一维数据分析用于绘制qc球fsc分布的直方图,分析该一维直方图的最高峰,并识别出qc球组群的最高峰。然而,这种qc方法需要一些条件,包括qc球样品的高纯度、qc球分布集中而不分散、以及设备清洁而没有任何其他样品残留。如果不满足这些条件,qc实验很容易失败。在这种情况下,用户必须重新调整设备参数、多次清洗,并再次进行qc实验。这将对用户的体验产生不利影响。因此,需要开发一种新的工艺,以提供一种用于基于群体分析的qc自动设门的更稳健的系统或方法。
技术实现思路
1、在本部分中提供本公开的总概要,而不是本公开完全范围或本公开所有特征的全面公开。
2、本申请的一个
3、i)提供用于测试目的设备性能指标的qc球;
4、ii)将所述设备设置成采集所述qc球的数据;
5、iii)对所采集的数据进行分析,并根据所采集的数据计算所述qc球的设门位置;以及
6、vi)根据所计算出的门位置调整所述设备的采集参数。
7、根据本公开的一个方面,所述qc球为相同的尺寸。
8、在根据本公开的一些示例中,所述qc球的尺寸为40nm至10μm。
9、在根据本公开的一些示例中,所述qc球的尺寸为500nm、3μm、6μm或10μm。
10、在根据本公开的一些示例中,所述qc球为与荧光剂缀合的球。在根据本公开的一些示例中,所述荧光剂设置为在一个或更多个荧光通道中产生荧光数据。
11、在根据本公开的一些示例中,步骤ii)还包括收集所述qc球的前向散射(fsc)数据,并且其中所述fsc数据由所述qc球的尺寸确定。
12、在根据本公开的一些示例中,步骤ii)还包括收集所述qc球的侧向散射(ssc)数据,并且其中所述ssc数据由所述qc球的表面光滑度确定。
13、在根据本公开的一些示例中,步骤ii)还包括收集所述qc球在每个通道中的荧光强度数据。根据本公开的一些示例中,qc球在每个通道中的荧光强度在集中范围内,并且采用对数轴坐标系,以使得荧光通道数据分布在所述对数轴坐标系中的集中区域内。根据本公开的一些示例中,qc球包括八峰球,所述八峰球分布在fsc和ssc的一个峰中,并且分布在荧光通道中的八个峰中,并且第八峰的球分布在所有荧光通道中的第八峰上或荧光值最强的峰上。
14、在根据本公开的一些示例中,步骤iii)包括通过以下步骤进行qc球群体分析:
15、1)将总qc球过滤结果设置为所有细胞;
16、2)对一个或更多个荧光通道中的每一个循环进行最高峰分析;
17、3)基于所述qc球的最高峰分析的过滤结果分析fsc或ssc信号的峰;以及
18、4)根据对fsc或ssc自动设门的过滤结果分析特定荧光通道数据的峰。
19、在根据本公开的一些示例中,步骤2)还包括:
20、a)获取荧光通道数据范围;
21、b)根据所述荧光通道数据范围创建荧光通道坐标变换;
22、c)对荧光通道数据进行坐标变换,以获得模型数据;
23、d)根据所述获得的统计学模型数据创建荧光直方图;
24、e)对所述荧光直方图进行多峰数据分析,以获得最高峰数据范围分析;
25、f)根据所述最高峰数据范围过滤所述模型数据,以获得包括所述qc球过滤结果的荧光通道的最高峰;以及
26、g)对整体qc球过滤结果和所述荧光通道的过滤结果进行逻辑运算,并将其设置为整体qc球过滤结果。
27、在根据本公开的一些示例中,对于e)的多峰数据分析,从高到低检索峰信息,其中如果所搜索的峰中的球总数占<5%,则将该数据段作为干扰信号丢弃,并在低值空间继续检索峰信息。
28、在根据本公开的一些示例中,在对所述荧光通道进行多次过滤和合并操作之后,所述整体qc球过滤结果代表所有经计算的荧光通道中具有最高峰的qc球群体。
29、在根据本公开的一些示例中,步骤3)还包括:
30、a)获得fsc或ssc通道数据范围;
31、b)根据所述通道数据范围创建通道坐标变换;
32、c)对所述通道数据进行坐标变换,以获得模型数据;
33、d)根据最高荧光峰的过滤结果和fsc或ssc的统计学模型数据创建直方图;
34、e)根据所述直方图分析峰,以获得最大峰数据范围;
35、f)获得所述fsc或ssc最大峰的边沿,并将其转换为世界坐标值,以作为自动设门位置;以及
36、g)使用所述最大峰范围对所有fsc或ssc数据进行过滤计算,以获得fsc和/或ssc图的过滤结果。
37、在根据本公开的一些示例中,步骤4)还包括:
38、a)获取荧光通道数据范围;
39、b)根据所述通道数据范围创建通道坐标变换;
40、c)对所述通道数据进行通道坐标变换,以获得模型数据;
41、d)根据fsc或ssc过滤结果的统计学模型数据创建荧光直方图;
42、e)根据所述直方图分析峰;
43、f)获得每个峰的边沿范围;以及
44、g)将每个峰的边沿范围转换为世界坐标位置,以作为qc荧光通道的多峰自动绘图位置。
45、在根据本公开的另一方面,qc球包含具有相同尺寸和不同荧光强度的球。在根据本公开的另一方面,具有相同尺寸和不同荧光强度的球为八峰球。
46、根据本公开的又一方面,当在获得qc球的fsc位置后对过滤球范围进行补偿时,利用经过滤的球数据绘制荧光通道中球分布,并且通过多峰识别方法对多个峰进行识别。
47、在根据本公开的一些示例中,所述目的设备是流式细胞分选仪。
48、通过下文中给出的详细描述和仅以说明的方式给出并且因此并不认为是限制本公开的附图,将更充分地理解本公开的上述及其他目的、特征和优点。
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1.基于群体分析的质量控制(QC)自动设门方法,所述方法包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述QC球为相同的尺寸。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述QC球的尺寸为40nm至10μm。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述QC球的尺寸为500nm、3μm、6μm或10μm。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述QC球为与荧光剂缀合的球。
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述荧光剂设置为在一个或更多个荧光通道中产生荧光数据。
7.根据权利要求1所述的方法,其中步骤II)还包括收集所述QC球的前向散射(FSC)数据,并且其中所述FSC数据由所述QC球的尺寸确定。
8.根据权利要求1所述的方法,其中步骤II)还包括收集所述QC球的侧向散射(SSC)数据,并且其中所述SSC数据由所述QC球的表面光滑度确定。
9.根据权利要求1所述的方法,其中步骤II)还包括收集所述QC球在每个通道中的荧光强度数据。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述QC球在每个通道
11.根据权利要求9所述的方法,其中所述QC球包括八峰球,所述八峰球分布在FSC和SSC的一个峰中,并且分布在荧光通道中的八个峰中,并且第八峰的球分布在所有荧光通道中的第八峰上或荧光值最强的峰上。
12.根据权利要求1所述的方法,其中步骤III)包括通过以下步骤进行QC球群体分析:
13.根据权利要求12所述的方法,其中步骤2)还包括:
14.根据权利要求13所述的方法,其中对于e)的多峰数据分析,从高到低检索峰信息,其中如果所搜索的峰中的球总数占<5%,则将该数据段作为干扰信号丢弃,并在低值空间继续检索峰信息。
15.根据权利要求13所述的方法,其中在对所述荧光通道进行多次过滤和合并操作之后,所述整体QC球过滤结果代表所有经计算的荧光通道中具有最高峰的QC球群体。
16.根据权利要求12所述的方法,其中步骤3)还包括:
17.根据权利要求12所述的方法,其中步骤4)还包括:
18.根据权利要求17所述的方法,其中所述QC球包含具有相同尺寸和不同荧光强度的球。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述具有相同尺寸和不同荧光强度的球为八峰球。
20.根据权利要求17所述的方法,其中当在获得QC球的FSC位置后对过滤球范围进行补偿时,利用经过滤的球数据绘制荧光通道中球分布,并且通过多峰识别方法对多个峰进行识别。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的方法,其中所述目的设备是流式细胞分选仪。
...【技术特征摘要】
1.基于群体分析的质量控制(qc)自动设门方法,所述方法包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述qc球为相同的尺寸。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述qc球的尺寸为40nm至10μm。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述qc球的尺寸为500nm、3μm、6μm或10μm。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述qc球为与荧光剂缀合的球。
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述荧光剂设置为在一个或更多个荧光通道中产生荧光数据。
7.根据权利要求1所述的方法,其中步骤ii)还包括收集所述qc球的前向散射(fsc)数据,并且其中所述fsc数据由所述qc球的尺寸确定。
8.根据权利要求1所述的方法,其中步骤ii)还包括收集所述qc球的侧向散射(ssc)数据,并且其中所述ssc数据由所述qc球的表面光滑度确定。
9.根据权利要求1所述的方法,其中步骤ii)还包括收集所述qc球在每个通道中的荧光强度数据。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述qc球在每个通道中的荧光强度在集中范围内,并且采用对数轴坐标系,以使得荧光通道数据分布在所述对数轴坐标系中的集中区域内。
11.根据权利要求9所述的方法,其中所述qc球包括八峰球,所述八峰球分布在fsc和ssc的一个峰中,并且分布在荧...
【专利技术属性】
技术研发人员:刁建祥,蔡晓楠,
申请(专利权)人:贝克曼库尔特生物科技苏州有限公司,
类型:发明
国别省市:
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