一种Hi-C文库构建方法技术

本发明专利技术提供一种Hi‑C文库构建方法，该方法包括：交联样本细胞内的DNA与蛋白质，酶切交联体中的DNA，加测序接头，重连DNA片段，解交联，加文库接头，和文库扩增的步骤。通过采用本发明专利技术的Hi‑C文库构建方法，可以实现建库时间短，成本低，便于实验操作和有效数据比例高的Hi‑C文库。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种hi-c文库构建方法，属于基因测序。

技术介绍

1、染色质构象捕获(chromatin conformation capture)是一种分子生物学技术，用于研究染色体内部三维结构的空间组织。它在揭示基因组三维结构、理解基因调控机制、研究疾病发生机制以及推动药物研发等方面具有重要的意义。从2002年deker提出3c，随着研究水平的提升逐渐衍生出4c、5c、chia-pet、hi-c、capture hi-c等技术。这些方法都在不同程度上揭示了染色体内部的三维结构和相互作用，为研究基因调控、基因组稳定性和疾病发生提供了重要的工具。

2、在这些方法中，hi-c技术应用最为广泛，并衍生出in situ hi-c，micro-c，pore-c等不同分支。hi-c是基于3c原理发展而来。它通过交联染色质、切割dna并将相互作用的dna片段连接起来，使用生物素标记和调取重连片段，然后对重连片段进行高通量测序从而获得用于研究染色体内部三维结构的测序数据。hi-c测序生成的数据能够提供全基因组范围内的染色体相互作用图谱，并用于分析染色质的空间本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种Hi-C文库构建方法，该方法包括下述步骤

2.根据权利要求1所述Hi-C文库构建方法，所述加测序接头的DNA片段通过其带有的测序接头重新连接，所述重连DNA片段内部包括两个测序接头。

3.根据权利要求1所述Hi-C文库构建方法，所述测序接头的长度为10-40bp。

4.根据权利要求1所述Hi-C文库构建方法，所述测序接头由两条DNA单链组成，所述测序引物序列设置在3'端与所述交联的DNA片段相连接的单链上，所述测序引物序列设置在其所在单链的3'端。

5.根据根据权利要求4所述Hi-C文库构建方法，所述设置测序引物序列的单链的5'端为...

【技术特征摘要】

1.一种hi-c文库构建方法，该方法包括下述步骤

2.根据权利要求1所述hi-c文库构建方法，所述加测序接头的dna片段通过其带有的测序接头重新连接，所述重连dna片段内部包括两个测序接头。

3.根据权利要求1所述hi-c文库构建方法，所述测序接头的长度为10-40bp。

4.根据权利要求1所述hi-c文库构建方法，所述测序接头由两条dna单链组成，所述测序引物序列设置在3'端与所述交联的dna片段相连接的单链上，所述测序引物序列设置在其所在单链的3'端。

5.根据根据权利要求4所述hi-c文库构建方法，所述设置测序引物序列的单链的5'端为突出的seq id no：1所示核苷酸序列，或，未设置测序引物序列的单链...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋健，李小林，韦所苏，
申请(专利权)人：广西壮族自治区人民医院，
类型：发明
国别省市：