基于靶向NGS技术对脑炎病原微生物进行精准检测和分类的方法技术

本发明专利技术涉及微生物检测技术领域，具体涉及基于靶向NGS技术对病毒性脑炎病原微生物进行精准检测和分类的方法。本发明专利技术公开了一种基于tNGS技术提高脑炎病毒检测和精准分类的方法。该方法从数据库构建到检出结果输出，建立了完整的tNGS测序数据鉴定与质控的分析方案，与传统分析方法相比，增加了tNGS数据多种过滤和质控方式，去除非特异性扩增序列比对结果，提高检出灵敏性和特异性。本发明专利技术能够实现病毒的高效检出和分类准确性，同时有效地减少结果核查中人力资源的消耗。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及微生物检测，具体涉及基于靶向ngs技术对脑炎病原微生物进行精准检测和分类的方法。

技术介绍

1、脑炎(encephalitis)是一种与神经功能障碍相关的脑实质炎症。中枢神经系统功能障碍包括癫痫发作、局灶性神经系统表现和精神状态改变等，影响正常行为与生活。脑炎疾病根据常见病因可以分为自身免疫性脑炎和感染型脑炎，其中感染型脑炎主要是由不同病毒或细菌等病原微生物感染所引起。因此，为加速脑炎临床诊断和用药指导，开发精确且快速的病毒检测方法是非常必要的。

2、目前传统的病原微生物检测的方法，包含有形态学、细胞培养法、抗体检测，以及传统pcr检测方法等。随着高通量测序技术(next-generation sequencing,ngs)的快速发展，推动了其在病原微生物诊断与筛查方向的广泛应用。相较于传统的检测方法，ngs技术在短时间内可实现对多种病毒的广泛检测和鉴定，从而加速临床治疗过程。据以往研究报道，用于微生物检测的ngs技术又可分为宏基因组测序技术(mngs)和靶向高通量测序技术(tngs)。其中，mngs技术可对样本中所有微生物和病毒本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.脑炎病原微生物的检测和分类方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，

3.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，

4.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，

5.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，与引物序列库比对的参数设置为：短序列比对模式；-evalue为1000；-word_size为10；多线程比对模式。

6.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，所述与病原和宿主数据库比对的参数设置为：比对上的序列长度大于80％，identity大...

【技术特征摘要】

1.脑炎病原微生物的检测和分类方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，

3.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，

4.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，

5.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，与引物序列库比对的参数设置为：短序列比对模式；-evalue为1000；-word_size为10；多线程比对模式。

6.根据权利要求1所述的检测和分类方法，其特征在于，所述与病原和宿主数据库比对的参数设置为：比对...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘静，王佳，余伟师，梁萌萌，
申请(专利权)人：赛福解码北京基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：