System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 阿克曼菌作为新型布尼亚病毒感染性疾病预后标志物的应用制造技术_技高网

阿克曼菌作为新型布尼亚病毒感染性疾病预后标志物的应用制造技术

技术编号:40902663 阅读:4 留言:0更新日期:2024-04-18 14:34
本发明专利技术公开了阿克曼菌作为新型布尼亚病毒感染性疾病预后标志物的应用。发明专利技术人在实验中发现,新型布尼亚病毒感染性疾病患者的粪便样本中,康复病人粪便样本中阿克曼菌属的相对丰度与死亡病人相比存在显著的上调,通过对阿克曼菌属的相对丰度水平的检测,可以有效地预测新型布尼亚病毒感染性疾病患的病情发展方向,具有良好的预后价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及疾病诊断,具体而言,涉及阿克曼菌作为新型布尼亚病毒感染性疾病预后标志物的应用,更具体涉及粪便中阿克曼菌的相对丰度作为新型布尼亚病毒感染性疾病预后标志物的应用。


技术介绍

1、新型布尼亚病毒病(发热伴血小板减少综合征,severe fever withthrombocytopenia syndrome,sfts))于2009年首次被报道,病例主要分布在山区和丘陵地带的农村,病例高度散发,但在地域分布上又相对集中。新型布尼亚病毒经带毒蜱虫(主要是长角血蜱)叮咬是其感染的主要途径。病毒还可通过直接接触患者血液或其污染物等传播,从而造成医护、探视或殓殡人员感染。

2、新型布尼亚病毒感染人体的潜伏期尚不十分明确,可能为1-2周,在人-人传播病例中,潜伏期多在6~9天。临床症状表现为血小板降低、白细胞计数降低、发热、乏力、全身不适、肌肉酸痛及纳差、恶心、呕吐、腹泻等消化道症状。

3、现今对于新型布尼亚病毒的诊断和预后主要通过病原学检查和血清学检查来检测,脑脊液及影像学检查也可辅助治疗,但目前无用于判断病人预后的生物标志物。在治疗过程中发现,病原学检测结果落后于病情的发展,血清学指标会因为病人输入血浆和血小板产生变化,导致无法检测到病人的真实情况,而脑脊液很难获取,影像学检查同样存在落后于病程的问题。

4、嗜黏蛋白阿克曼菌(akkermansia muciniphila,简称akk菌),它是人类肠道重要的共生菌属。这种革兰氏阴性厌氧菌约占健康人体肠道菌群的3%,它们依靠肠粘液层的黏蛋白生存。阿克曼菌在维持健康免疫过程中发挥着关键作用。此前广泛的研究表明,阿克曼菌的丰度与炎症性肠病、肥胖和2型糖尿病呈负相关;与癌症免疫治疗中程序性细胞死亡蛋白1(pd-1)或细胞程序性死亡配体1(pd-l1)检查点抑制剂的反应呈正相关;在t细胞亚群内稳态期间诱导肠道适应性免疫反应。作为一种重要的益生菌,阿克曼菌在新型布尼亚病毒感染性疾病预后中的应用未见报道。


技术实现思路

1、本专利技术提出一种具有良好的诊断价值的新型布尼亚病毒感染性疾病的预后标记物—阿克曼菌属,检测阿克曼菌属相对丰度的试剂能够用于新型布尼亚病毒感染性疾病的预后判断。

2、第一方面,本专利技术提供检测样本中阿克曼菌属相对丰度的试剂在制备用于新型布尼亚病毒感染性疾病预后的产品中的应用,

3、所述阿克曼菌属为akkermansia。

4、所述样本为受试者的肠道内容物样本,具体可为粪便样本。

5、所述受试者为确诊患有新型布尼亚病毒感染性疾病正在接受治疗的人或其他动物。

6、所述试剂通过提取、pcr、测序等对阿克曼菌属进行相对丰度检测。

7、第二方面,本专利技术提供新型布尼亚病毒感染性疾病预后的试剂盒,该试剂盒包括检测样本中阿克曼菌属相对丰度的试剂,

8、在本专利技术的一些实施方式中,试剂盒为粪便检测试剂盒。

9、在本专利技术的一些实施方式中,试剂盒包括粪便基因组dna的提取试剂、pcr扩增试剂、测序试剂等。

10、本专利技术的第三方面,提供计算机可读存储介质,计算机可读存储介质存储有计算机可执行指令,所述计算机可执行指令用于使计算机执行以下操作:

11、将来自受试者的样本中的阿克曼菌属的相对丰度值与设定值比较,根据比较结果对受试者进行新型布尼亚病毒感染性疾病的预后判断。

12、在本申请的一些实施方式中,通过收集粪便,依次执行提取dna、pcr扩增、建库、测序和数据分析步骤,得到受试者的样本中的阿克曼菌属的相对丰度,

13、其中,所述测序利用illumina novaseq平台测序,

14、数据分析包括如下步骤:通过flash软件进行拼接,使用qiime软件对获得的数据进行筛选,使用qiim软件计算alpha多样性,使用qiime softwar软件计算beta多样性;

15、所述设定值为用作对照的健康人的粪便样本中阿克曼菌属的相对丰度值水平。

16、当受试者的阿克曼菌属的相对丰度值水平为健康人的相应水平的11.3倍以上时,则判定受试者有良好的预后;当受试者的阿克曼菌属的相对丰度值水平为健康人的相应水平的1倍以内时,则判定受试者的预后较差。

17、本专利技术的第四方面,提供电子设备,该电子设备包括处理器和存储器,存储器上存储有可在处理器上运行的计算机程序,处理器在运行计算机程序时实现以下操作:

18、将来自受试者的样本中的阿克曼菌属的相对丰度值与设定值比较,根据比较结果对受试者进行新型布尼亚病毒感染性疾病的预后判断。

19、其中,存储器作为一种非暂态计算机可读存储介质,可用于存储非暂态软件程序以及非暂态性计算机可执行程序,如前述的对受试者进行新型布尼亚病毒感染性疾病的预后判断。处理器通过运行存储在存储器中的非暂态软件程序以及指令,从而实现上述对受试者进行新型布尼亚病毒感染性疾病的预后判断。

20、存储器可以包括存储程序区和存储数据区,其中,存储程序区可存储操作系统、至少一个功能所需要的应用程序;存储数据区可存储执行上述步骤。此外,存储器可以包括高速随机存取存储器,还可以包括非暂态存储器,比如至少一个磁盘存储器件、闪存器件、或其他非暂态固态存储器件。例如,存储器可选包括相对于处理器远程设置的存储器,这些远程存储器可以通过网络连接至该处理器。上述网络的实例包括但不限于互联网、企业内部网、局域网、移动通信网及其组合。

21、实现上述步骤所需的非暂态软件程序以及指令存储在存储器中,当被一个或者多个处理器执行时,执行上述步骤。

22、以上所描述的装置实施例仅仅是示意性的,其中作为分离部件说明的单元可以是或者也可以不是物理上分开的,即可以位于一个地方,或者也可以分布到多个网络单元上。可以根据实际的需要选择其中的部分或者全部模块来实现本实施例方案的目的。

23、另外,上文中所公开的系统可以被实施为软件、固件、硬件及其适当的组合。某些物理组件或所有物理组件可以被实施为由处理器,如中央处理器、数字信号处理器或微处理器执行的软件,或者被实施为硬件,或者被实施为集成电路,如专用集成电路。这样的软件可以分布在计算机可读介质上,计算机可读介质可以包括计算机存储介质(或非暂时性介质)和通信介质(或暂时性介质)。如本领域普通技术人员公知的,术语计算机存储介质包括在用于存储信息(诸如计算机可读指令、数据结构、程序模块或其他数据)的任何方法或技术中实施的易失性和非易失性、可移除和不可移除介质。计算机存储介质包括但不限于ram、rom、eeprom、闪存或其他存储器技术、cd-rom、数字多功能盘(dvd)或其他光盘存储、磁盒、磁带、磁盘存储或其他磁存储装置、或者可以用于存储期望的信息并且可以被计算机访问的任何其他的介质。此外,通信介质通常包含计算机可读指令、数据结构、程序模块或者诸如载波或其他传输机制之类的调制数据信号中的其他数据,并且可包本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.检测样本中阿克曼菌属相对丰度的试剂在制备用于新型布尼亚病毒感染性疾病预后的产品中的应用。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述阿克曼菌属为Akkermansia。

3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于:所述样本为受试者的肠道内容物,具体为粪便样本。

4.新型布尼亚病毒感染性疾病预后的试剂盒,包括检测样本中阿克曼菌属相对丰度的试剂。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:试剂盒包括粪便基因组DNA的提取试剂、PCR扩增试剂、测序试剂。

6.计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机可执行指令,所述计算机可执行指令用于使计算机执行以下操作:

7.根据权利要求6所述的计算机可读存储介质,其特征在于:所述设定值为用作对照的健康人的粪便样本中阿克曼菌属的相对丰度值水平;

8.根据权利要求7所述的计算机可读存储介质,其特征在于:所述测序利用IlluminaNovaSeq平台测序,

9.电子设备,包括处理器和存储器,所述存储器上存储有可在处理器上运行的计算机程序,处理器在运行计算机程序时实现以下操作:

10.根据权利要求9所述的电子设备,其特征在于:所述设定值为用作对照的健康人的粪便样本中阿克曼菌属的相对丰度值水平;当受试者的阿克曼菌属的相对丰度值水平为健康人的相应水平的11.3倍以上时,则判定受试者有良好的预后;当受试者的阿克曼菌属的相对丰度值水平为健康人的相应水平的1倍以内时,则判定受试者的预后较差。

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【技术特征摘要】

1.检测样本中阿克曼菌属相对丰度的试剂在制备用于新型布尼亚病毒感染性疾病预后的产品中的应用。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述阿克曼菌属为akkermansia。

3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于:所述样本为受试者的肠道内容物,具体为粪便样本。

4.新型布尼亚病毒感染性疾病预后的试剂盒,包括检测样本中阿克曼菌属相对丰度的试剂。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:试剂盒包括粪便基因组dna的提取试剂、pcr扩增试剂、测序试剂。

6.计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机可执行指令,所述计算机可执行指令用于使计算机执行以下操作:

7.根据权利要求6所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员:张小爱黎浩刘玮朱书谢金炎杨童
申请(专利权)人:中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
类型:发明
国别省市:

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