System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种纯化分离寡核苷酸的方法技术_技高网

一种纯化分离寡核苷酸的方法技术

技术编号:40900997 阅读:3 留言:0更新日期:2024-04-18 11:18
本发明专利技术公开了一种纯化分离寡核苷酸的方法,采用以亲水化改性聚苯乙烯/二乙烯基苯(PS/DVB)为基球且表面键合N,N‑二甲基苄胺基团填料的混合模式强阴离子交换层析法,主要包含以下步骤:平衡层析柱、上样、后平衡、洗杂和洗脱等步骤,仅通过复合模式一步层析法,可对多种寡核苷酸样品进行纯化,整个体系采用低压环境,降低成本,操作流程简单,纯化的产品纯度高、回收率高。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生化纯化领域,具体涉及一种纯化分离寡核苷酸的方法


技术介绍

1、寡核苷酸(oligonucleotide)是一类短链核苷酸化合物的总称,通常由20或更多个核苷酸组成。按其结构功能的不同,分为反义核酸(aso)、小干扰rna(sirna)、微小rna(mirna)、核酸适配体等。因其研发周期短、特异性强、毒副作用低等优势,其市场需求、市场规模不断扩大。目前全球共有14款已上市的寡核苷酸药物,用于治疗杜氏肌营养不良症、脊髓性肌萎缩症、家族性淀粉样多发性神经病变等疾病。

2、寡核苷酸合成的主要方法为亚磷酰胺固相合成法,通过多次循环,合成指定核苷酸序列。每次循环按顺序分为脱保护、偶联、氧化、封闭四个路径,每步均可能产生相应杂质,如脱保护时间过长,可能产生脱嘌呤杂质,脱保护时间过短可能产生n-1杂质,反应过程中可能产生修饰副产物单p-o等杂质,此类杂质由于与目标物性质过于接近,从而给下游层析带来极大难度与挑战。因此,寡核苷酸的下游层析显得尤为重要。

3、寡核苷酸样品中所含杂质较多,主要为n-,n+,p-o,脱嘌呤等杂质,给下游工艺带来较大挑战。目前,其下游常用方法为凝胶电泳法、层析法等,凝胶电泳适用小规模纯化,无法放大,实用性较差。层析法因其载量高、可工业放大、超高分辨率等优势在寡核苷酸纯化领域被广泛应用。现有层析工艺分为两种思路,一种为保留5端dmt残基,采用疏水或反相方法纯化,洗脱后进行脱保护操作,再用小粒径阴离子填料精纯。另一种方法可直接对样品脱保护,使用阴离子填料粗纯后再采用反相填料精纯。两种方法均采用两步层析工艺,产物纯度虽然达到标准,但两步层析会严重影响目标物回收率,并增加下游工艺时间与难度。同时两步层析的方法需使用两种填料,使下游成本变高。因此,目前急需开发一种一步层析的方法,达到阴离子+反相两步层析的纯化效果。


技术实现思路

1、为了实现上述目的,本专利技术通过赛分科技的复合模式层析介质proteomix por30-mq,开发了在该介质上纯化分离寡核苷酸样品的应用方法,仅通过一步层析,达到了阴离子配合疏水的两步层析效果,极大提高了目标物纯度与收率,并降低了下游层析成本与生产时间。

2、本专利技术采用如下技术方案:

3、采用以亲水化改性聚苯乙烯/二乙烯基苯(ps/dvb)为基球且表面键合n,n-二甲基苄胺基团填料的混合模式强阴离子交换层析法,主要包含以下步骤:

4、s1、平衡:用平衡液a平衡层析柱,当样品为小干扰rna(sirna)时,所述平衡液a为naoh溶液;当样品为反义核酸(aso)时,所述平衡液a为na3po4溶液;

5、s2、进样:上样小干扰rna(sirna)或反义核酸(aso)粗品;

6、s3、后平衡:用所述平衡液a进行除杂;

7、s4、洗杂:用平衡液b线性升高梯度再保持来洗杂,当样品为sirna时,所述平衡液b为naoh+nacl+acn(乙腈);当样品为aso时,所述平衡液b为na3po4+nabr+acn;

8、s5、洗脱:用所述平衡液b,线性升高梯度再保持的方法进行洗脱。

9、进一步地,所述平衡液a为20mm naoh溶液或20mm na3po4溶液。

10、进一步地,在进样前需将所述sirna或aso粗品用所述平衡液a进行稀释。

11、进一步地,所述进样方法具体为:将固相合成的sirna或aso粗品用所述平衡液a稀释3倍,进样体积2ml,进样流速120cm/h。

12、进一步地,所述平衡和后平衡方法具体均为:5cv,驻留时间6min。

13、进一步地,所述平衡液b为20mm naoh+2m nacl+20%acn或20mm na3po4+2mnabr+5%acn。

14、进一步地,所述洗杂方法具体为:0-30%所述平衡液b线性洗杂2cv,30%所述平衡液b保持3cv。

15、进一步地,所述洗脱方法具体为:30-100%所述平衡液b线性洗脱25cv,50%所述平衡液b保持3cv。

16、进一步地,在所述平衡步骤前还包括消毒处理,所述消毒处理方法为用0.5m naoh溶液浸泡管路和层析柱。

17、进一步地,所述填料为赛分科技proteomix por30-mq,基球为亲水化改性聚苯乙烯/二乙烯基苯(ps/dvb)微球,平均粒径30um,键合混合模式强阴离子交换基团n,n-二甲基苄胺。

18、进一步地,在所述洗脱步骤后还包括再生和清洗处理,所述再生选择100%所述平衡液b清洗5cv,所述清洗使用0.5m naoh溶液清洗5cv,该步骤主要是为了使层析柱可重复使用。

19、本专利技术采用以中低压高载proteomix por30-mq为填料的混合模式强阴离子交换色谱法,proteomix por30-mq基质为亲水化改性聚苯乙烯/二乙烯基苯(ps/dvb)微球,平均粒径30um,键合混合模式强阴离子交换基团n,n-二甲基苄胺(cas:103-83-3),具有高度的生物相容性和物理化学稳定性,尤其适用于寡聚核苷酸的分离纯化,该层析介质的结构式如下:

20、

21、其中为基球,r为间隔臂,r右端接n,n-二甲基苄胺。

22、由于固相合成后的寡核苷酸杂质含量较多,除了常见的n-x(主链缺失x个核苷酸)、n+y(主链增加y个核苷酸)杂质外,仍有大量的脱嘌呤、修饰副产物等杂质,因而对介质性质及工艺方法有极高要求。寡核苷酸自身具有极强的亲水性,但通过甲基化等方法修饰过后,会极大程度地增强核酸链的疏水性,需要对介质有一定的疏水性能的需求。proteomix por30-mq填料基球表面键合混合模式强阴离子交换基团,以强阴离子交换模式为主去除大量杂质,以填料自身疏水性为辅,去除分离难度较大的n-1、p-o等杂质。纯化工艺中,添加低浓度的有机溶剂乙腈,实现电荷+疏水的双梯度分离模式,极大程度地提升纯化产物纯度与回收率,实现两步层析至一步层析的工艺替换。

23、乙腈是有机溶剂,具有一定的极性。乙腈分子中的碳氢键相对较弱,而氰基(cn)部分具有较强的极性。通过添加乙腈,可以在溶剂中引入一定的极性,这对于增加溶剂的整体极性和溶解性是有益的。这种极性效应可以影响溶剂中电荷分布,有助于形成电荷梯度。另外,通过添加乙腈,可以引入疏水性,影响溶剂中的疏水相互作用。这种疏水效应有助于形成疏水性梯度,促使疏水性物质在溶剂中聚集。

24、有益效果:本专利技术与现有技术相比,本专利技术的特点是:1、相比较现有的寡核苷酸高压色谱纯化技术,本专利技术中的层析方法在低压条件下进行,避免使用价格昂贵的高压层析系统,能够降低生产投入成本;2、本专利技术通过一步混合模式强阴离子交换层析,实现了阴离子+反相的两步层析效果,节约成本并缩短工艺时间,提升生产效率;3、现有技术通常采用阴离子粗纯与rp反相层析两步技术,严重影响产物回收率,本专利技术仅通过一步层析,避免了反本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,采用以亲水化改性聚苯乙烯/二乙烯基苯(PS/DVB)为基球且表面键合N,N-二甲基苄胺基团填料的混合模式强阴离子交换层析法,主要包含以下步骤:

2.根据权利要求1所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,在进样前需将所述siRNA或ASO粗品用所述平衡液A进行稀释。

3.根据权利要求1所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述平衡液A为20mMNaOH溶液或20mM Na3PO4溶液。

4.根据权利要求3所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述进样方法具体为:将固相合成的siRNA或ASO粗品用所述平衡液A稀释3倍,进样体积2mL,进样流速120cm/h。

5.根据权利要求3所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述平衡和后平衡方法具体均为:5cv,驻留时间6min。

6.根据权利要求3所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述平衡液B为20mMNaOH+2M NaCl+20%ACN或20mM Na3PO4+2M NaBr+5%ACN。

7.根据权利要求6所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述洗杂方法具体为:

8.根据权利要求7所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述洗脱方法具体为:

9.根据权利要求1所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,在所述平衡步骤前还包括消毒处理,所述消毒处理方法为用0.5M NaOH溶液浸泡管路和层析柱。

10.根据权利要求1所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述填料为赛分科技Proteomix POR30-MQ,基球为亲水化改性聚苯乙烯/二乙烯基苯(PS/DVB)微球,平均粒径30um,键合混合模式强阴离子交换基团N,N-二甲基苄胺。

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【技术特征摘要】

1.一种纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,采用以亲水化改性聚苯乙烯/二乙烯基苯(ps/dvb)为基球且表面键合n,n-二甲基苄胺基团填料的混合模式强阴离子交换层析法,主要包含以下步骤:

2.根据权利要求1所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,在进样前需将所述sirna或aso粗品用所述平衡液a进行稀释。

3.根据权利要求1所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述平衡液a为20mmnaoh溶液或20mm na3po4溶液。

4.根据权利要求3所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述进样方法具体为:将固相合成的sirna或aso粗品用所述平衡液a稀释3倍,进样体积2ml,进样流速120cm/h。

5.根据权利要求3所述的纯化分离寡核苷酸的方法,其特征在于,所述平衡和后平衡方法具体均为:5cv,驻留时间6min。

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【专利技术属性】
技术研发人员:佟潇禹吕小林霍栋栋
申请(专利权)人:苏州赛分科技股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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