【技术实现步骤摘要】
本申请属于基因检测,更具体地说,是涉及一种突变位点富集式叠瓦探针、试剂盒、设计方法及应用。
技术介绍
1、肿瘤二代测序基因检测中,需要对靶向基因区域进行富集。靶向富集主要实现方式有两种,一是通过多重pcr直接扩增靶区域,二是通过寡核苷酸探针,对预文库杂交捕获实现。由于多重pcr存在交叉扩增和扩增效率不均一等原因,适用场景有限。基于探针(probe&panel)的杂交富集方式,既兼容多种变异类型检测,也易于优化,获得较佳的测序均一性,因而得到了广泛应用。针对通用需求,已有多家公司提供目录化panel及杂交捕获方案,例如全外显子和泛癌种应用。直接购买商品化panel比从头设计更加值得推荐,因为这些panel通常已经过验证和优化。但当某些实验或者检测需要针对特定基因、固定疾病或者特殊信号通路时,则需要定制panel的设计合成。定制panel设计需要考虑到靶区域的选择、探针位置和方式,这些因素都与捕获效果直接相关。
2、egfr g719s位点在结直肠癌、肺癌中经常出现,临床对应的推荐用药是西妥昔单抗、厄洛替尼、吉非替尼,在
...【技术保护点】
1.一种突变位点富集式叠瓦探针的设计方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.一种突变位点富集式叠瓦探针,其特征在于,采用权利要求1所述的设计方法得到。
3.一种试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述的一种突变位点富集式叠瓦探针。
4.如权利要求2所述的一种突变位点富集式叠瓦探针在检测EGFR基因中的应用。
5.如权利要求4所述的一种突变位点富集式叠瓦探针在检测EGFR基因中的应用,其特征在于,采用的叠瓦探针的序列如SEQ ID NO:1~56所示。
6.如权利要求3所述的一种试剂盒在检测EGFR基因中的应用。<
...【技术特征摘要】
1.一种突变位点富集式叠瓦探针的设计方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.一种突变位点富集式叠瓦探针,其特征在于,采用权利要求1所述的设计方法得到。
3.一种试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述的一种突变位点富集式叠瓦探针。
4.如权利要求2所述的一种突变位点富集式叠瓦探针在检测egfr基因中的应用。
5.如权利要求4所述的一种突变位点富集式叠瓦探针在检测egfr基因中的应用,其特征在于,采用的叠瓦探针的序列如seq id no...
【专利技术属性】
技术研发人员:李彬,郭琼钰,何彬,周雪,王蓉,李拼,范渊,曹现涛,魏光,陆亚平,
申请(专利权)人:国药武汉精准医疗科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。