【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及细胞间通讯预测，更具体地说，它涉及一种基于单细胞转录组数据预测细胞外囊泡mirna介导的细胞间通讯的方法。
技术介绍
1、单细胞转录组测序(single-cell rna-seq,scrna-seq)技术实现了在每个单细胞中对所有基因表达的测定，已被广泛用于系统预测细胞间通讯。细胞间通讯，指的是一个细胞发出信号，作用在另一个细胞并产生一系列生物学效应的过程。细胞间通讯按照通讯介质可以分为三种。第一种是通过物理接触的方式，即细胞与细胞之间通过直接的物理接触来传递信号，实现细胞间通讯。第二种方式是通过化学信号，如细胞因子等配体，即细胞通过分泌一个配体蛋白，与另一个细胞的膜表面受体蛋白进行结合，激活下游通路，实现细胞间通讯。第三种是通过细胞外囊泡(extracellular vesicle)，如外泌体(exosome)，即细胞通过分泌含有mirna、蛋白的细胞外囊泡，通过膜融合进入另一个细胞内并释放囊泡中的mirna、蛋白等信号分子，调控靶细胞内的信号通路，实现细胞间通讯。
2、目前，利用scrna-seq数据来预测...
【技术保护点】
1.一种基于单细胞转录组数据预测细胞外囊泡miRNA介导的细胞间通讯的方法，其特征是：包括以下3个步骤，
2.根据权利要求1所述的一种基于单细胞转录组数据预测细胞外囊泡miRNA介导的细胞间通讯的方法，其特征是：所述miRTalkDB包含细胞外囊泡中存在的所有miRNA和它们的靶基因，具体包含了2567个人类细胞外囊泡miRNA、935个小鼠细胞外囊泡miRNA和179个大鼠的细胞外囊泡miRNA，以及495217对人类细胞外囊泡miRNA-靶点相互作用、48480对小鼠细胞外囊泡miRNA-靶点相互作用和632对大鼠的细胞外囊泡miRNA-靶点相互作用。
3.根...
【技术特征摘要】
1.一种基于单细胞转录组数据预测细胞外囊泡mirna介导的细胞间通讯的方法，其特征是：包括以下3个步骤，
2.根据权利要求1所述的一种基于单细胞转录组数据预测细胞外囊泡mirna介导的细胞间通讯的方法，其特征是：所述mirtalkdb包含细胞外囊泡中存在的所有mirna和它们的靶基因，具体包含了2567个人类细胞外囊泡mirna、935个小鼠细胞外囊泡mirna和179个大鼠的细胞外囊泡mirna，以及495217对人类细胞外囊泡mirna-靶点相互作用、48480对小鼠细胞...
【专利技术属性】
技术研发人员：范骁辉，邵鑫，廖杰，
申请(专利权)人：浙江大学长三角智慧绿洲创新中心，
类型：发明
国别省市：
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