【技术实现步骤摘要】
本申请涉及基因检测，具体而言，涉及一种子宫内膜细胞定量模型的构建方法和子宫内膜细胞定量方法。
技术介绍
1、生育期妇女的月经周期一般为28-30天，在特定的时间段内子宫内膜允许胚胎植入，一般认为是月经周期的分泌中期(d20-24，即排卵后+7-+11)，称为植入窗(window ofimplantation，woi)。在卵巢激素的调节下，子宫内膜从增殖期到分泌期经历了一系列形态学和细胞组成的变化。增殖期子宫内膜上皮、腺体、间质和血管都呈现增殖性变化，腺体细胞的重要变化表现为纤毛细胞和微绒毛细胞的增加。进入分泌期之后腺体更加弯曲，出现分泌现象，血管迅速增加并更加弯曲，间质疏松水肿。除此之外内膜中还存在发挥重要作用的免疫细胞，包括nk细胞、t细胞、髓系等，整体免疫细胞也随着月经周期呈现逐渐升高的趋势在月经前期达到高峰。
2、然而如何分析内膜免疫细胞数量和比例变化是研究子宫内膜细胞的难点。
技术实现思路
1、为了解决上述问题，对子宫内膜组织中不同种类的子宫内膜细胞进行定量分析，本申请的第一目的在于提供一种子宫内膜细胞定量的构建方法，方法包括：
2、获取子宫内膜细胞集的单细胞表达数据，子宫内膜细胞集包括来自子宫内膜组织的基质细胞、上皮细胞、内皮细胞、t细胞、nk细胞、b细胞和髓性细胞；
3、根据子宫内膜细胞集的单细胞表达数据确定目标细胞特征基因集以及目标细胞特征基因集中每个特征基因在每种细胞中的平均表达量；
4、根据目标细胞特征集中每个特征基
5、其中，所述目标细胞特征基因集包括目标细胞集中每种细胞的特征基因；
6、所述目标细胞集包括子宫内膜细胞集和子宫内膜免疫细胞集中的任意一种。
7、本申请利用子宫内膜组织不同类型细胞在单细胞水平的基因表达谱，筛选出针对子宫内膜细胞的特征基因组合，构建了子宫内膜细胞定量模型，开发了一种利用转录组测序数据检测子宫内膜组织中基质细胞、上皮细胞、内皮细胞、t细胞、nk细胞、b细胞和髓性细胞的细胞比例的方法。
8、在其中一个实施例中，根据子宫内膜细胞集的单细胞表达数据确定目标细胞特征基因集包括：
9、对子宫内膜细胞集的单细胞表达数据进行差异性分析，确定每种子宫内膜细胞的特异性表达基因；
10、将每种子宫内膜细胞的特异性表达基因按照表达量差异倍数从高到低进行排序，将前30个基因作为该种子宫内膜细胞的特征基因；
11、根据目标细胞集中每种细胞的特征基因确定目标细胞特征基因集；
12、可选地，每种子宫内膜细胞的特异性表达基因是指表达量差异倍数大于0.25，矫正后p值小于0.05以及在该种细胞中的表达比例大于10％的基因。
13、在其中一个实施例中，子宫内膜免疫细胞集包括来自子宫内膜组织的t细胞、nk细胞、b细胞和髓性细胞。
14、在其中一个实施例中，根据目标细胞特征集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量构建目标细胞定量模型包括：
15、根据目标细胞特征集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量构建目标细胞特征基因表达量矩阵；
16、根据目标细胞特征基因集中每个特征基因在子宫内膜组织中的表达量构建子宫内膜组织特征基因表达量矩阵；
17、基于目标细胞特征基因表达量矩阵和子宫内膜组织特征基因表达量矩阵之间的线性关系构建目标细胞定量模型。
18、本申请的第二目的在于提供一种子宫内膜细胞定量方法，包括：
19、获取待测子宫内膜组织样本的转录组数据；
20、根据待测子宫内膜组织样本的转录组数据和目标细胞定量模型，确定待测子宫内膜组织样本的目标细胞集中每种细胞的比例。
21、在其中一个实施例中，根据待测子宫内膜组织样本的转录组数据和目标细胞定量模型，确定待测子宫内膜组织样本的目标细胞集中每种细胞的比例包括：
22、根据待测子宫内膜组织样本的转录组数据对目标细胞定量模型求最优解；
23、根据最优解确定待测子宫内膜组织样本的目标细胞集中每种细胞的比例。
24、在其中一个实施例中，最优解采用的优化算法选自支持向量回归、二次规划和最小二乘回归中的任意一种。
25、本申请的第三目的在于提供一种计算机设备，包括存储器和处理器，存储器存储有计算机程序，处理器用于执行存储器中存储的计算机程序时实现上述子宫内膜细胞定量的构建方法或者上述子宫内膜细胞定量方法。
26、本申请的第四目的在于提供一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，计算机程序被处理器执行时实现上述子宫内膜细胞定量的构建方法或者上述子宫内膜细胞定量方法。
27、本申请的第五目的在于提供一种计算机程序产品，包含指令，当指令被计算机执行时，指令使得计算机执行上述子宫内膜细胞定量的构建方法或者上述子宫内膜细胞定量方法。
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1.一种子宫内膜细胞定量模型的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：
2.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，根据子宫内膜细胞集的单细胞表达数据确定目标细胞特征基因集包括：
3.根据权利要求1或2所述的构建方法，其特征在于，子宫内膜免疫细胞集包括来自子宫内膜组织的T细胞、NK细胞、B细胞和髓性细胞。
4.根据权利要求3所述的构建方法，其特征在于，根据目标细胞特征集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量构建目标细胞定量模型包括：
5.一种子宫内膜细胞定量方法，其特征在于，包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，根据待测子宫内膜组织样本的转录组数据和目标细胞定量模型，确定待测子宫内膜组织样本的目标细胞集中每种细胞的比例包括：
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述最优解采用的优化算法选自支持向量回归、二次规划和最小二乘回归中的任意一种。
8.一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，所计算机设备包括处理器，所述处理器用于执行存储器中
9.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至4中任意一项所述子宫内膜细胞定量的构建方法或者权利要求5至7中任意一项所述的子宫内膜细胞定量方法。
10.一种计算机程序产品，包含指令，其特征在于，当所述指令被计算机执行时，所述指令使得所述计算机执行如权利要求1至4中任意一项所述子宫内膜细胞定量的构建方法或者权利要求5至7中任意一项所述的子宫内膜细胞定量方法。
...【技术特征摘要】
1.一种子宫内膜细胞定量模型的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：
2.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，根据子宫内膜细胞集的单细胞表达数据确定目标细胞特征基因集包括：
3.根据权利要求1或2所述的构建方法，其特征在于，子宫内膜免疫细胞集包括来自子宫内膜组织的t细胞、nk细胞、b细胞和髓性细胞。
4.根据权利要求3所述的构建方法，其特征在于，根据目标细胞特征集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量构建目标细胞定量模型包括：
5.一种子宫内膜细胞定量方法，其特征在于，包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，根据待测子宫内膜组织样本的转录组数据和目标细胞定量模型，确定待测子宫内膜组织样本的目标细胞集中每种细胞的比例包括：
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述最优解采用的...
【专利技术属性】
技术研发人员：龚斐，李元，樊香秀，陈秭宜，孟飞，胡亮，
申请(专利权)人：中信湘雅生殖与遗传专科医院有限公司，
类型：发明
国别省市：
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