汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组及其应用制造技术

本发明专利技术涉及病毒高通量测序，具体涉及汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组及其应用。所述引物组包括如SEQ ID No.1‑SEQ ID No.20所示的10对叠瓦式PCR扩增引物。通过使用该引物组进行PCR靶向捕获汉滩病毒全基因组，经捕获后的PCR产物可直接对接二代和三代测序平台进行文库构建和基因组序列测定，获得高质量的汉滩病毒全基因组序列。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及病毒高通量测序，具体涉及汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组及其应用。

技术介绍

1、汉滩病毒（orthohantaan viurs，htnv）可引起肾综合征出血热，是导致重症、危重症肾综合征出血热的主要病原，主要存在于啮齿类动物中。htnv基因组为分节段的rna病毒，基因组分为大（l）、中（m）、小（s）三个片段，大小分别约为6.3kb、3.6kb、1.7kb。分节段的rna病毒在自然界易变异和重组，近年来啮齿类动物中新基因亚型的htnv不断被发现，对人类生命安全产生严重威胁，因此需要建立一套快速、方便、经济、有效的获取汉滩病毒基因组的方法来监测病毒的变异情况。

2、病原宏基因组测序以及探针捕获测序是目前针对病原最常用的基因测序方法，这些方法可一次性完成包括htnv在内的细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原体检测，但是操作过程复杂、引物数量多、检测时间长、背景信号高、测序深度低、成本高，对于未经培养的样本很难获得全基因组的序列，无法实现大量样本的检测以及大规模的应用。

技术实现思路

1、基本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组，其特征在于，包括如SEQ ID No. 1- SEQID No. 20所示的10对叠瓦式PCR扩增引物。

2.根据权利要求1所述汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组在汉滩病毒靶向基因组高通量测序中的应用。

3.一种汉滩病毒靶向基因组高通量测序方法，其特征在于，包括以下步骤：

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述将权利要求1所述汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组和所述待测序核酸加入至PCR扩增体系具体为：将权利要求1所述汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组分为pool1、pool2和pool3三组，分别加入至PCR扩增体...

【技术特征摘要】

1.一种汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组，其特征在于，包括如seq id no. 1- seqid no. 20所示的10对叠瓦式pcr扩增引物。

2.根据权利要求1所述汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组在汉滩病毒靶向基因组高通量测序中的应用。

3.一种汉滩病毒靶向基因组高通量测序方法，其特征在于，包括以下步骤：

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述将权利要求1所述汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组和所述待测序核酸加入至pcr扩增体系具体为：将权利要求1所述汉滩病毒全基因组靶向捕获引物组分为pool1、pool...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘师文，龙中儿，
申请(专利权)人：江西师范大学，
类型：发明
国别省市：