一种山羊肌肉发育关键基因PPARGC1A新剪切体检测方法技术

本发明专利技术公开一种山羊肌肉发育关键基因PPARGC1A新剪切体PPARGC1A‑sv1检测方法，剪切体PPARGC1A‑sv1的CDS序列如SEQ ID NO.1所示。本发明专利技术提供了剪切体PPARGC1A‑sv1的扩增引物对和相对表达水平检测引物对。相对表达水平检测结果显示，剪切体PPARGC1A‑sv1在福清山羊和努比亚山羊各组织中表达存在显著差异，福清山羊中PPARGC1A‑sv1主要在心、腰大肌、冈上肌、冈下肌、肱三头肌、背最长肌、臀股二头肌、股四头肌、半腱肌、内收肌、颈斜方肌和半棘肌等12个肌肉组织中表达，而努比亚山羊中该剪切体只在心、冈上肌、肱三头肌、股四头肌、半腱肌、内收肌和半棘肌等7个肌肉组织中表达。上述结果说明，剪切体PPARGC1A‑sv1对于山羊肌肉生长发育具有重要作用，可作为山羊肉质性状的分子标记，加快山羊肉质性状选育的遗传进展。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及山羊分子生物学领域，具体涉及一种山羊肌肉发育关键基因ppargc1a新剪切体ppargc1a-sv1检测方法。

技术介绍

1、肌间脂含量(inter-muscularfatcontent，imfc)是目前衡量畜禽肉质性状高低的最重要指标。福清山羊拥有较高的肉质性状，例如其肌间脂含量极显著高于努比亚山羊(刘远,李文杨,吴贤锋,等.福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌比较转录组分析[j].中国农业科学,2019,52(14),2525-2537.)。通过前期对两品种的转录组比对测序分析，筛选出了山羊肌肉生长发育关键基因——ppargc1a基因，该基因全称为过氧化物酶体增殖激活受体γ共激活因子1α。ppargc1a基因是明星因子，其作为转录共激活因子可以与一系列的转录因子相互作用，参与多种代谢途径，如适应性产热、线粒体的生物合成、葡萄糖代谢、肝脏糖异生、脂肪酸β氧化、脂肪细胞分化、肌肉类型转换等。在动物遗传育种中，由于参与机体能量平衡和脂肪代谢调控的相关过程，ppargc1a基因被作为影响动物产乳特性、肉质品质和动物生长的侯选基因加以研究。

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【技术保护点】

1.山羊肌肉发育关键基因PPARGC1A剪切体PPARGC1A-sv1，其特征在于：CDS序列如SEQID NO.1所示。

2.用于扩增如权利要求1所述剪切体PPARGC1A-sv1的CDS序列的引物对，其特征在于：所述引物对序列如下：

3.如权利要求1所述的剪切体PPARGC1A-sv1的CDS序列的扩增方法，其特征在于：提取样品总RNA，反转录为cDNA作为模板，利用上游引物PPARGC1A-sv1 clone-F和下游引物PPARGC1A-sv1 clone-R进行PCR扩增反应，PCR扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳检测并送测序公司进行测序，得到剪切体PPARG...

【技术特征摘要】

1.山羊肌肉发育关键基因ppargc1a剪切体ppargc1a-sv1，其特征在于：cds序列如seqid no.1所示。

2.用于扩增如权利要求1所述剪切体ppargc1a-sv1的cds序列的引物对，其特征在于：所述引物对序列如下：

3.如权利要求1所述的剪切体ppargc1a-sv1的cds序列的扩增方法，其特征在于：提取样品总rna，反转录为cdna作为模板，利用上游引物ppargc1a-sv1 clone-f和下游引物ppargc1a-sv1 clone-r进行pcr扩增反应，pcr扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳检测并送测序公司进行测序，得到剪切体ppargc1a-sv1的cds序列；

4.根据权利要求3所述的扩增方法，其特征在于：所述pcr扩增反应的体系为30μl：100ng/μl的模板cdna 0.8μl，10pmol的上、下游引物各0.3μl，2×premix taq mix 15μl，去离子水13.6μl。

5.根据权利要求3所述的扩增方法，其特征在于：所述pcr扩增反应的程序为：95℃预变性3min；95℃变性30s，60℃退火30s，72℃延伸150s，45个循环；72℃延伸...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴贤锋，徐倩，刘远，李文杨，
申请(专利权)人：福建省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：