【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于微生物检测，尤其涉及一种pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法。
技术介绍
1、目前，果胶杆菌属(pectobacterium spp.)是一种植物坏死性细菌病原体，可导致极具破坏性的植物病害，包括常见的软腐病、黑腿病、枯萎病和气腐病(czajkowski etal.,2011；davidsson et al.,2013)。该属的菌株可在全球范围内造成大田作物、各种蔬菜、水果和观赏植物的严重损失(toth et al.,2003；ma et al.,2007)。由于其在农业生产和储运过程中的破坏性影响，果胶杆菌被认为是十大最危险的植物致病菌之一(mansfieldet al.,2012)。据报道，果胶杆菌属主要包括10个种，分别为：p.carotovorum，p.wasabiae，p.betavasculorum，p.cacticida，p.aroidearum，p.peruviense，p.atrosepticum，p.parmentieri，p.polaris和candidatus p.maceratum。其...
【技术保护点】
1.一种Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，所述Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，包括以下步骤：
2.如权利要求1所述的Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，所述第一步，具体包括：参照SPIN Kit for SoilDNA提取试剂盒的步骤对魔芋组织样本的总DNA进行提取，DNA浓度和纯度利用NanoDrop2000进行检测，利用1％琼脂糖凝胶电泳检测DNA提取质量。
3.如权利要求2所述的Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，采用通用引物TS1 F(5’...
【技术特征摘要】
1.一种pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，所述pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，包括以下步骤：
2.如权利要求1所述的pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，所述第一步，具体包括：参照spin kit for soildna提取试剂盒的步骤对魔芋组织样本的总dna进行提取，dna浓度和纯度利用nanodrop2000进行检测，利用1％琼脂糖凝胶电泳检测dna提取质量。
3.如权利要求2所述的pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，采用通用引物ts1 f(5’-acttggtcatttagaggaagtaa-3’)和its2 r(5’-bgctgcgttcttcatcgatgc-3’)对魔芋各组织的内生真菌多样性进行分析；pcr扩增采用protaq,20μl反应体系：10μl 2*pro taq；0.8μlforward primer(5μm)；0.8μl reverse primer(5μm)；10ng template dna；最后加ddh2o至20μl。扩增程序为：95℃预变性3min，35个循环(95℃变性30s，55℃退火30s,72℃延伸45s)，最后72℃延伸10min。
4.如权利要求3所述的pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，在分析内生细菌群落时，共进行两步pcr扩增：16s rrna基因的第一次pcr扩增采用细菌引物799f(5'-aacmggattagataccckg-3')和1392r(5'-acgggcggtgtgtrc-3')进行；扩增体系transgenap221-02：transstart fastpfu dnapolymerase，20μl反应体系：4μl 5*fastpfu buffer；2μl2.5mm dntps；0.8μl forward primer(5μm)；0.8μl reverse primer(5μm)；0.4μl fastpfu polymerase；0.2μl bsa；10ng template dna；最后加ddh2o至20μl。扩增程序为：95℃预变性3min，27个循环，95℃变性30s，55℃退火30s,72℃延伸45s，最后72℃延伸10min；第二次pcr扩增采用的引物是799f(5'-aacmggattagataccckg-3')和1193r(5'-acgtcatccccaccttcc-3')(yang et al,2022)，pcr步骤的所有条件和第一次相同...
【专利技术属性】
技术研发人员：余磊，黄飞燕，郭建伟，齐颖，赵永腾，高鹏华，李丽芳，杨敏，刘佳妮，陈泽斌，余亚军，林登智，寸德馨，
申请(专利权)人：昆明学院，
类型：发明
国别省市：
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