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【技术实现步骤摘要】
本专利技术公开了唾液肿瘤标记物及其在制备胃癌诊断产品中的应用,属于微生物及肿瘤学领域。
技术介绍
1、胃癌(gastric cancer,gc)是一种重要的全球疾病,每年新增病例数超过100万例。由于其高死亡率,使得其已经成为癌症相关死亡的第三大常见原因,及时的诊断是gc的治疗及预后的关键。现有技术中常以激素、酶类、蛋白质等细胞分泌物,例如癌胚抗原(cea)、甲胎抗原(afp)作为胃癌诊断的标记物。目前这一类肿瘤标记物虽然临床仍在用,但其敏感性与准确性已难以满足临床需求。
2、口腔作为细菌群落最大的聚集地之一,每天会分泌大约1000ml的唾液。微生物会随着唾液从口腔进入到胃肠道,并定植在相应部位引起胃肠道疾病。同时,其产生的游离毒素等也可迁移到全身各处,从而引起炎症反应。现有研究报道称,口腔微生物群的改变与胃癌发生相关。例如,wu等人报道(tongue coating microbiota community and riskeffect on gastric cancer)舌苔微生物群中链球菌含量的提升会增加患gc的风险,huang等人(salivary microbiota for gastric cancer prediction:an exploratory study)发现患gc的人群的唾液微生物中,棒状杆菌和链球菌的含量显著高于萎缩性浅表性胃炎人群。但是,目前尚无以口腔微生物作为肿瘤标志物以评估gc的研究。
技术实现思路
1、为了解决现有技术存在的问题,本专
2、本专利技术提供了一种胃癌标志物,其特征在于,所述标志物包括:菌种allisonellapneumosintes、prevotellaloescheii、tannerella sp003033925、prevotellaconceptionensis、neisseriasp002237445、fusobacterium polymorphum、prevotellamelaninogenica、neisseria elongata、neisseriasubflava c、ottowiasp001262075、bergeyella a cardium、gn02-873sp003260345、streptococcusparasanguinis和rothiaaeria
3、本专利技术还提供了所述胃癌标志物在制备用于检测或评估胃癌的产品中的应用。
4、在一种实施方式中,所述产品通过检测所述标志物的微生物丰度来检测或评估胃癌。
5、在一种实施方式中,所述产品包括检测或评估胃癌的生物芯片、试剂盒、或装置。
6、在一种实施方式中,所述生物芯片包括固相载体以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针特异性地对应于所述胃癌标志物。
7、在一种实施方式中,所述试剂盒包括如下任意一种或多种:pcr反应相关试剂、引物、唾液采集器以及提取所述唾液中dna的相关试剂。
8、在一种实施方式中,所述装置包括:
9、收集器,收集待测样本;
10、处理器,处理样本,获得样本中的dna;
11、分析器,用于执行可执行程序,执行所述可执行程序包括完成如下步骤:
12、(a)分析样本中的dna,确定样本中的所述胃癌标志物中的微生物丰度信息;
13、(b)依据(a)中获得的微生物丰度信息,确定待测个体是否为胃癌患者,或确定待测个体的胃癌分期。
14、在一种实施方式中,所述检测或评估包括诊断检测、进展监测及预后检测中的一种或多种。
15、在一种实施方式中,所述的样本包括离体的口腔唾液样本。
16、在一种实施方式中,所述采用荧光定量pcr或高通量测序进行所述步骤(a)中的分析。
17、在一种实施方式中,所述高通量测序为2brad-m高通量测序。
18、在一种实施方式中,通过以下公式判断待测个体是否患有胃癌:
19、
20、n=2.341+847.318x1-4591.977x2-2198.262x3+282.277x4-2561.410x5+4239.796x6-46.643x7-40
21、7.878x8+120.576x9-1699.635x10-1370.430x11-376.445x12-1263.401x13+636.839x14
22、x1~x14分别为allisonellapneumosintes、prevotellaloescheii、tannerellasp003033925、prevotellaconceptionensis、neisseriasp002237445、fusobacteriumpolymorphum、prevotellamelaninogenica、neisseria elongata、neisseriasubflava c、ottowia sp001262075、bergeyella a cardium、gn02-873 sp003260345、streptococcusparasanguinis和rothiaaeria的相对丰度;
23、当p1>0.873时,确定待测个体为胃癌患者。
24、在一种实施方式中,通过以下公式判断待测个体的胃癌分期:
25、
26、m=-23.421+740.293x1+116.094x2+168.368x3+689.936x4+4836.183x5
27、x1~x5分别为tannerella sp003033925、prevotellaconceptionensis、prevotellamelaninogenica、neisseria elongata和bergeyella a cardium的相对丰度;
28、当p2>0.875时,确定待测个体的胃癌分期为高分期。
29、本专利技术还提供了一种检测或评估胃癌的产品,所述产品中包括检测所述胃癌标志物中的微生物的试剂或装置。
30、在一种实施方式中,所述检测或评估所使用的样品为离体的口腔唾液。
31、在一种实施方式中,使用所述产品通过检测待测样品中微生物的相对丰度,检测或诊断胃癌。
32、在一种实施方式中,根据下述方式来评估或诊断样品:
33、
34、n=2.341+847.318x1-4591.977x2-2198.262x3+282.277x4-2561.410x5+4239.796x6-46.643x7-40
35、7.878x8+120.576x9-1699.635x10-1370.4本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种胃癌标志物,其特征在于,所述标志物包括:
2.权利要求1所述胃癌标志物在制备用于检测或评估胃癌的产品中的应用;所述产品通过检测所述标志物的微生物丰度来检测或评估胃癌。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述产品包括检测或评估胃癌的生物芯片、试剂盒、或装置。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述生物芯片包括固相载体以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针特异性地对应于所述胃癌标志物。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂盒包括如下任意一种或多种:PCR反应相关试剂、引物、唾液采集器以及提取所述唾液中DNA的相关试剂。
6.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述装置包括:
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述的样本包括离体的口腔唾液样本。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,采用荧光定量PCR或高通量测序进行所述步骤(a)中的分析。
9.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,通过以下公式判断待测个体是否为胃癌患
10.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,通过以下公式判断待测个体的胃癌分期:
...【技术特征摘要】
1.一种胃癌标志物,其特征在于,所述标志物包括:
2.权利要求1所述胃癌标志物在制备用于检测或评估胃癌的产品中的应用;所述产品通过检测所述标志物的微生物丰度来检测或评估胃癌。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述产品包括检测或评估胃癌的生物芯片、试剂盒、或装置。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述生物芯片包括固相载体以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针特异性地对应于所述胃癌标志物。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂盒包括如下任意一...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈建欢,鲍传庆,冯俊杰,金云云,郭涛,
申请(专利权)人:江南大学,
类型:发明
国别省市:
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