用于高通量测序的GII组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组、试剂盒及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种用于高通量测序的GII组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组、试剂盒及其应用，属于生物技术领域。本发明专利技术具有如下技术效果：1.试剂成本低，单个标本总体的试剂成本仅几十元。2.操作简便易行，常规PCR扩增仪器、通用RT‑PCR试剂加上本发明专利技术的引物组工作液即可上机扩增富集，即便基层单位也可开展。3.广谱扩增，可扩增目前国内所有常见的GII组诺如病毒的全基因组。因为GII组诺如病毒基因序列变异度高，通常用于全基因组扩增富集的引物组仅能扩增某一种特定型别的诺如病毒，很难设计广谱的扩增引物，本发明专利技术依据GII组诺如病毒系统发育关系将其分为六个分支，针对每个分支分别设计特异性引物，最终组合为可广谱扩增的全基因组引物组。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种用于高通量测序的gii组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组、试剂盒及其应用，属于生物。

技术介绍

1、诺如病毒(norovirus,nov)是引起急性肠胃炎散发和暴发的重要病原体，通过粪口途径在人与人之间传播，感染后可出现严重的腹泻和呕吐症状。诺如病毒每年在全世界造成大约20万人死亡，其中发展中国家的儿童将近7万多例，造成了巨大的经济负担和社会负担。

2、全基因组测序(whole genome sequencing,wgs)数据可详细阐明系统进化关系，监测病原体的传播和进化，其越来越多地被用于与病原体相关的疫情溯源调查。对于诺如病毒来说，全基因组测序能够成功区分各种诺如病毒基因型别，并可在暴发后进行回顾性分析，以确认病毒各基因进化速率，并通过鉴定特异性的突变来预测新变异株的流行和传播。

3、传统的诺如病毒全基因组测序主要有两种方式，一种是宏基因组测序，无需pcr扩增，但对标本病毒载量要求较高，且费用昂贵，一般用于未知病原体的检测。另一种是通过设计特异性叠瓦式引物对，通过rt-pcr扩增多个片段，纯化后进行测序，最后将本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.用于高通量测序的GII组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组，其特征在于，包括第1管引物组和第2管引物组，核苷酸序列分别如下表所示：

2.用于高通量测序的GII组诺如病毒全基因组扩增富集的RT-PCR试剂盒，其特征在于，包括如权利要求1所述的用于高通量测序的GII组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组。

3.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，还包括RT-PCR试剂。

4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述的RT-PCR试剂为诺唯赞的One StepRT-PCRKit试剂。

5.如权利要求1所述的用于高通量测序的GII组诺如病毒全...

【技术特征摘要】

1.用于高通量测序的gii组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组，其特征在于，包括第1管引物组和第2管引物组，核苷酸序列分别如下表所示：

2.用于高通量测序的gii组诺如病毒全基因组扩增富集的rt-pcr试剂盒，其特征在于，包括如权利要求1所述的用于高通量测序的gii组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组。

3.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，还包括rt-pcr试剂。

4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述的rt-pcr试剂为诺唯赞的one steprt-pcrkit试剂。

5.如权利要求1所述的用于高通量测序的gii组诺如病毒全基因组扩增富集的引物组...

【专利技术属性】
技术研发人员：付建光，李楚楚，秦圆方，艾静，邓斐，樊欢，王慎骄，余慧燕，鲍倡俊，朱立国，
申请(专利权)人：江苏省疾病预防控制中心江苏省公共卫生研究院，
类型：发明
国别省市：