【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，具体涉及一种与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记及应用。
技术介绍
1、烟草蔗糖酯是其叶片表面化学主要成分之一，也是烟草中重要的潜在致香前体物质，其中，栽培烟草中含量较高的为蔗糖四酯(severson r f,arrendale r f,chortyk ot,quantitation of the major cuticular components from green leaf of differenttobacco types.journal of agricultural and food chemistry,1984,(32):566-570.)，其降解可产生小分子挥发性脂肪酸并可极大地提高烟叶的香气品质(severson r f,arrendale r f,chortyk o t,isolation and characterization of the sucroseesters of the cuticular waxes of green tobacco leaf.journal of agriculturaland food chemistry,1985,(33):870-875.leffingwell j c,chemical constituents oftobacco leaf and differences among tobacco types.social science electronicpublishing,2001,1:38-44.)。研究
2、针对栽培烟草叶片中bmvse含量的遗传研究表明，雪茄烟beinhart1000-1中的bmvse基因被定位于ssr标记pt30354和pt52061、pt61362之间约5.2cm区域内，且与ssr标记pt30209和pt20315呈共分离(vontimitta v,danehower d a,steede t,moon h s,lewis rs,analysis of a nicotiana tabacum l.genomic region controlling two leafsurface chemistry traits.journal of agricultural and food chemistry,2010,58:294-300.)。利用上述5个ssr标记对不同遗传背景的烟草材料及192份重组自交系群体进行bmvse筛选验证，结果表明仅2个标记(pt20135和pt30354)有效，但标记的基因型与bmvse表型的一致率仅约92.165％(陈彪，陈铭，李洋洋，屈亚芳，程立锐，杨爱国，胡日生，刘旦，罗成刚，向世鹏，冯全福，常爱霞，烟草蔗糖酯ssr分子标记筛选及辅助育种应用.中国烟草科学,2019,40(3):8-15.)。bmvse基因型与其表型的一致率远未达到分子标记辅助选择(mas)的100％精准度要求，主要原因是：文献的作者错误的将原本分别属于bmvse471(iii型)、bmvse485(iv型)、bmvse499(v型)和bmvse513(vi型)4个不同独立基因视作一个基因(命名为bmvse)进行遗传定位研究，故此，获得的定位结果是不准确的。本项目组的研究表明，iii～vi型bmvse属于典型的数量性状，且受beinhart1000-1基因组内不同染色体或同一染色体上不同位置的qtls控制，这些基因/qtls被暂时命名为qbmvse471、qbmvse513、qbmvse499和qbmvse513。进一步研究表明，文献针对iii～vi型烟草蔗糖酯作为一个基因(bmvse)进行定位的结果是不准确的，该定位结果仅是4种类型bmvse中的一种，故此，在后续的实验验证中出现了5个紧密连锁标记仅有2个可用且无法精准实现标记基因型与bmvse表型一致的情况。此外，目前虽已有针对bmvse中包含的4种类型基因/qtl进行区分并遗传定位的研究，但也仅局限于其中的前3种类型bmvse基因/qtl，即，分别对bmvse471(ⅲ型)、bmvse485(iv型)和bmvse499(v型)3种类型烟草蔗糖酯进行了qtl分析并将此3种类型bmvse基因/qtl两侧紧密连锁标记进行了专利。上述错误(不足)及对bmvse513(vi型)遗传与定位分析的缺乏，严重地制约了利用与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁标记开展高香气烟草新品种的选育进程。
3、鉴于此，本专利技术首次针对bmvse中包含的vi型烟草糖脂bmvse513进行遗传定位研究，利用数量性状连锁分析(qtl)法和硅烷化气相色谱质谱(gc-ms)法，在烟草全基因组范围内筛选获得与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记，以弥补现有技术和已报道文献的不足、加速分子标记辅助选择(mas)在烟草高香气品种选育中的精准、高效利用。
技术实现思路
1、本专利技术正是为了解决上述问题缺陷，提供一种与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记及应用。
2、本专利技术采用如下技术方案实现。
3、一种与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记，本专利技术所述的与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记的编号为tmc43049和tmc42528，其pcr扩增产物核苷酸序列分别为seq id no.1和seq id no.2、seq id no本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与VI型烟草蔗糖酯基因qBMVSE513紧密连锁的共显性SSR标记，其特征在于，所述的与VI型烟草蔗糖酯基因qBMVSE513紧密连锁的共显性SSR标记的编号为TMc43049和TMc42528，其PCR扩增产物核苷酸序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。
2.根据权利要求1所述的与VI型烟草蔗糖酯基因qBMVSE513紧密连锁的共显性SSR标记，其特征在于，所述共显性标记TMc43049和TMc42528位于目的基因qBMVSE513两侧。
3.根据权利要求1所述的与VI型烟草蔗糖酯基因qBMVSE513紧密连锁的共显性SSR标记，其特征在于，所述的分子标记所对应的2个位点的引物序列分别为：
4.权利要求1或2或3所述的与VI型烟草蔗糖酯基因qBMVSE513紧密连锁的共显性SSR标记的应用在于检测烟草基因组DNA中是否存在VI型烟草蔗糖酯基因qBMVSE513。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，该应用的方法为，以TMc43049和TMc42
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，PCR扩增产物中同时含有如SEQ ID No.1和SEQ ID No.3所示序列则表明该待测烟草植株含有高香气品质的VI型烟草蔗糖酯的纯合等位基因，基因型为BMVSE513 BMVSE513。
7.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，PCR扩增产物中同时含有如SEQ ID No.2和SEQ ID No.4所示序列则为待测烟草植株不含VI型烟草蔗糖酯的纯合等位基因，基因型为bmvse513bmvse513。
8.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，PCR扩增产物中同时含有如SEQ ID No.1和SEQ ID No.4所示序列，或同时含有SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示序列则为待测烟草植株含有高香气品质的VI型烟草蔗糖酯的杂合等位基因，基因型为BMVSE513bmvse513。
...【技术特征摘要】
1.一种与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记，其特征在于，所述的与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记的编号为tmc43049和tmc42528，其pcr扩增产物核苷酸序列分别为seq id no.1和seq id no.2、seq id no.3和seq id no.4所示。
2.根据权利要求1所述的与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记，其特征在于，所述共显性标记tmc43049和tmc42528位于目的基因qbmvse513两侧。
3.根据权利要求1所述的与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记，其特征在于，所述的分子标记所对应的2个位点的引物序列分别为：
4.权利要求1或2或3所述的与vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513紧密连锁的共显性ssr标记的应用在于检测烟草基因组dna中是否存在vi型烟草蔗糖酯基因qbmvse513。
5.根据权利要求4...
【专利技术属性】
技术研发人员：肖炳光，童治军，方敦煌，李勇，黄昌军，刘勇，曾建敏，隋学艺，
申请(专利权)人：云南省烟草农业科学研究院，
类型：发明
国别省市：
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