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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及人乳头瘤病毒检测,尤其涉及一种检测人乳头瘤病毒16型、18型的引物探针组合及试剂盒。
技术介绍
1、宫颈癌是我国女性第二常见的恶性肿瘤,全世界每年约有47万新发宫颈癌病例,其中,我国每年新发宫颈癌病例数约占世界总发病例数的28%。研究发现,人乳头瘤病毒(hpv)是引发宫颈癌的重要因素,全世界99%的宫颈癌中均有hpv的感染,而高达80%女性在其一生中可能感染hpv。hpv16型和hpv18型是最常见的导致宫颈癌的高危亚型,位于14种hpv高危型的首位,其中宫颈鳞癌中约76.58%可检测出hpvl6,7.51%可检测出hpv18型。hpv检测方法主要有核酸pcr检测、核酸原位杂交法、液体基础细胞学检测和免疫组织化学检测等方法。其中,hpv分子检测是宫颈癌筛查的重要方法之一,可有效对感染hpv的女性进行筛查,可以显著提高肿瘤及其癌前病变的早期发现,有利于降低宫颈癌发病风险,降低患者病死率。who也曾提出hpv dna检测可作为宫颈癌早期筛查方法,并建议对hpv检测为16、18型的患者需转诊阴道镜,其他亚型感染患者不需转诊,只需定期复查。
2、大多数的hpv检测方法均基于pcr技术原理,该技术具有较高的灵敏度和特异度且高效,但是需要精密的仪器设备进行反复热变性,也需要经过培训的专业人员进行操作,成本高,操作复杂,耗时长,容易污染,不利于在医疗资源匮乏的地区使用,也不利于快速检测和现场检测。
3、目前已公开的hpv检测方法cn107557492a,基于lamp技术,20-30分钟可完成检测,对hpv
4、随着生物技术的不断发展,又鉴于我国人口规模较大的,简单快速、低成本和能够实现现场检测的恒温扩增技术应运而生。与pcr技术相比,恒温扩增技术不需要借助昂贵的精密仪器设备,具有快速、高效、恒温、高特异度、低成本等特点,而且该技术还能将样本处理和检测一体化,可以很好的实现“样本进、结果出”。因此,开发出一款可用于恒温扩增的hpv检测试剂盒,应用于宫颈癌的早期筛查,能够节省一定的医疗资源,有望早日实现消除宫颈癌的目标。
技术实现思路
1、为了解决上述问题中的一种,本专利技术提供了一种检测hpv16型、18型的引物探针组合及试剂盒。该引物探针组合及试剂盒可以在恒温条件下,对人乳头瘤病毒16、18型进行分型检测。
2、为了达到上述目的,本专利技术采用了如下技术手段:
3、本专利技术的第一方面提供了一种检测hpv16型、18型的引物探针组合,包括:
4、用于扩增hpv16 l1基因的引物对:正向引物序列为seq id no.3、seq id no.5、seq id no.7中的一种,反向引物序列为seq id no.4、seq id no.6、seq id no.8中的一种;hpv16 l1基因的序列如seq id no.1所示;
5、用于扩增hpv18 l1基因的引物对:正向引物序列为seq id no.9、seq id no.11、seq id no.13中的一种,反向引物序列为seq id no.10、seq id no.12、seq id no.14中的一种;hpv18 l1基因的序列如seq id no.2所示;
6、用于检测hpv16 l1基因的探针,探针序列为seq id no.15、seq id no.16、seq idno.17中的一种;
7、用于检测hpv18 l1基因的探针,探针序列为seq id no.18、seq id no.19、seq idno.20中的一种。
8、在本专利技术的一些实施方案中,用于扩增hpv16 l1基因的正向引物序列为seq idno.3或seq id no.7,反向引物序列为seq id no.4或seq id no.8,序列号相邻的两个引物序列组成引物对;用于检测hpv16 l1基因的探针序列为seq id no.16;用于扩增hpv18 l1基因的正向引物序列为seq id no.11,反向引物序列为seq id no.12,用于检测hpv18 l1基因的探针序列为seq id no.18。
9、在本专利技术的一些实施方案中,所述反向引物序列的5’端标记一个荧光基团。
10、在本专利技术的一些实施方案中,所述探针序列距离5’端30~35个碱基双“t”位置处用thf替换一个碱基,双t之间有1~3个碱基,thf位点上游位置的“t”用一个荧光基团标记,thf位点下游位置的“t”用一个猝灭基团标记,3’端用c3-spacer阻断。
11、本专利技术的第二方面提供了本专利技术第一方面所述的一种检测hpv16型、18型的引物探针组合在制备hpv检测试剂盒中的应用。
12、本专利技术的第三方面提供了一种hpv检测试剂盒,所述试剂盒包括权利要求1-4任一项所述的引物探针组合。
13、在本专利技术的一些实施方案中,所述试剂盒还包括反应冻干粉、第一稀释液和第二稀释液。
14、在本专利技术的一些实施方案中,所述反应冻干粉组分包括引物重组蛋白、结合蛋白、聚合酶、核酸内切酶、聚乙烯醇、聚焦糖,二硫苏糖醇,三磷酸腺苷,磷酸肌酶8,脱氧核糖核苷三磷酸。所述反应冻干粉中引物重组蛋白浓度为100~180ng/μl;所述结合蛋白浓度为80~120ng/μl;所述聚合酶浓度为20~60ng/μl;所述核酸内切酶浓度为250~450ng/μl;所述聚乙烯醇浓度为10%~40%;所述聚焦糖浓度为1%~3%;所述二硫苏糖醇浓度为2~6mm;所述三磷酸腺苷浓度为6~10mm,所述磷酸肌酶浓度为60~100ng/μl,所述脱氧核糖核苷三磷酸浓度为400~800μm。
15、在本专利技术的一些优选实施方案中,引物重组蛋白浓度140ng/μl、结合蛋白浓度100ng/μl、聚合酶浓度40ng/μl、核酸内切酶浓度300ng/μl、聚乙烯醇浓度20%、聚焦糖浓度2%,二硫苏糖醇浓度为4mm,三磷酸腺苷浓度为8mm,磷酸肌酶浓度为80ng/μl,脱氧核糖核苷三磷酸浓度为600μm。所述引物重组蛋白为sc-reca重组酶蛋白;所述结合蛋白为ssb蛋白;所述聚合酶为bst聚合酶;所述核酸内切酶为大肠杆菌e.coli核酸内切酶ⅳ;所述聚乙烯醇为pva1788。
16、在一些具体实施方案中,所述反应冻干粉的制备方法如下:取反应冻干粉各组分,-80℃条件下储存1~3h,随后在-20℃条件下储存5~10h,再于20℃条件下干燥1~3h即可。
17、在一些具体实施方案中,所述第一稀释液包括聚本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种检测HPV16型、18型的引物探针组合,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的一种检测HPV16型、18型的引物探针组合,其特征在于:
3.根据权利要求1或2所述的一种检测HPV16型、18型的引物探针组合,其特征在于:所述反向引物序列的5’端标记一个荧光基团。
4.根据权利要求1或2所述的一种检测HPV16型、18型的引物探针组合,其特征在于:所述探针序列距离5’端30~35个碱基双“T”位置处用THF替换一个碱基,双T之间有1~3个碱基,THF位点上游位置的“T”用一个荧光基团标记,THF位点下游位置的“T”用一个猝灭基团标记,3’端用C3-spacer阻断。
5.权利要求1-4任一项所述的一种检测HPV16型、18型的引物探针组合在制备HPV检测试剂盒中的应用。
6.一种HPV检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括权利要求1-4任一项所述的引物探针组合。
7.根据权利要求6所述的HPV检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括反应冻干粉、第一稀释液和第二稀释液。
8.根据权利要求
9.根据权利要求8所述的HPV检测试剂盒,其特征在于:引物探针组合包括正向引物、反向引物、探针,正向引物、反向引物用量比为1:1,引物与探针用量比为(6-7):1。
...【技术特征摘要】
1.一种检测hpv16型、18型的引物探针组合,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的一种检测hpv16型、18型的引物探针组合,其特征在于:
3.根据权利要求1或2所述的一种检测hpv16型、18型的引物探针组合,其特征在于:所述反向引物序列的5’端标记一个荧光基团。
4.根据权利要求1或2所述的一种检测hpv16型、18型的引物探针组合,其特征在于:所述探针序列距离5’端30~35个碱基双“t”位置处用thf替换一个碱基,双t之间有1~3个碱基,thf位点上游位置的“t”用一个荧光基团标记,thf位点下游位置的“t”用一个猝灭基团标记,3’端用c3-spacer阻断。
5.权利要求1-4任一项所述的一种检测hpv16型、18型的引物探针组合在制备hpv...
【专利技术属性】
技术研发人员:杨笑笑,王景,
申请(专利权)人:昂凯生命科技苏州有限公司,
类型:发明
国别省市:
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