基于CRISPR/Cas12a-RPA快速检测水稻细菌性条斑病菌的序列组合及应用制造技术

技术编号:40388613 阅读:43 留言:0更新日期:2024-02-20 22:21
本发明专利技术提供一种基于CRISPR/Cas12a‑RPA快速检测水稻细菌性条斑病菌的序列组合及应用,属于病原微生物检测技术领域,提供了一种检测水稻细菌性条斑病菌的RPA引物对和特异性crRNA序列的序列组合,还提供了一种基于CRISPR/Cas12a‑RPA快速检测水稻细菌性条斑病菌的检测试剂盒、检测方法和应用。本发明专利技术的检测方法将RPA扩增方法与CRISPR/Cas12a的检测方法结合来检测水稻细菌性条斑病菌,通过蓝光切胶仪和侧流层析试纸条实现了可视化检测;本发明专利技术的检测方法具有良好的特异性和敏感性,只需要简单的仪器便可以进行检测,具有在现场和田间快速对水稻细菌性条斑病菌核酸进行检测的优势。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于病原微生物检测,尤其涉及一种基于crispr/cas12a-rpa快速检测水稻细菌性条斑病菌的序列组合及应用,具体地是一种基于crispr/cas12a-rpa快速检测水稻细菌性条斑病菌的序列组合、检测试剂盒、检测方法和应用。


技术介绍

1、水稻细菌性条斑病是一种由水稻黄单胞菌引起的细菌性病害,严重破坏水稻产量。水稻细菌性条斑病分布于亚洲的热带和亚热带,西非和东非地区;在我国,主要分布于华中、华南和西南地区。水稻细菌性条斑病在我国南方已经多次被报道,其导致水稻产量损失10%-20%,有时甚至损失高达40%,甚至绝收,严重威胁水稻生产安全。在出现明显的症状之前,早期感染水稻细菌性条斑病菌的水稻,难以通过非专业知识进行物理诊断,导致水稻细菌性条斑病的爆发引起水稻作物的大量死亡。因此,通过分子技术在水稻种子带菌阶段或者在水稻幼苗期检测到这种病害,对于水稻的生产,农民的增收有着重要的意义。

2、目前,检测水稻细菌性条斑病的方法主要是传统的检测方法和近些年发展的分子检测技术等。传统的检测方法主要有噬菌体检测法、育苗生长观察法、致病性测定、直本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于CRISPR/Cas12a-RPA快速检测水稻细菌性条斑病菌的序列组合,其特征在于,包括根据avrRxo1基因设计的RPA引物对序列、crRNA序列和ssDNA探针序列;

2.一种快速检测水稻细菌性条斑病菌的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的RPA引物对序列、crRNA序列和ssDNA探针序列。

3.根据权利要求2所述的一种快速检测水稻细菌性条斑病菌的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含Rehydration Buffer、MgOAC、酶干粉、LbCas12a酶和ddH2O;

4.根据权利要求2或3所述的一种快速检测...

【技术特征摘要】

1.一种基于crispr/cas12a-rpa快速检测水稻细菌性条斑病菌的序列组合,其特征在于,包括根据avrrxo1基因设计的rpa引物对序列、crrna序列和ssdna探针序列;

2.一种快速检测水稻细菌性条斑病菌的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的rpa引物对序列、crrna序列和ssdna探针序列。

3.根据权利要求2所述的一种快速检测水稻细菌性条斑病菌的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含rehydration buffer、mgoac、酶干粉、lbcas12a酶和ddh2o;

4.根据权利要求2或3所述的一种快速检测水稻细菌性条斑病菌的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括用于进行rpa扩增反应的反应体系和用于进行crispr/cas12a反应的体系。

5.根据权利要求4所...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵辉张海敏杜晓希胡帅张金鑫纪长绵夏启玉郭安平
申请(专利权)人:中国热带农业科学院三亚研究院
类型:发明
国别省市:

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