【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及医学诊断标志物，特别涉及一种用于骨髓增生异常性肿瘤预后的生物标志物及其应用。
技术介绍
1、骨髓增生异常性肿瘤(myelodysplastic neoplasms，mds)，原名称骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes，mds)，是一组起源于造血干细胞的异质性髓系克隆性疾病，其特点是髓系细胞发育异常，表现为无效造血、难治性血细胞减少，高风险向急性髓系白血病(aml)转化。尽管在去甲基化治疗方面取得了相关进展，但mds患者的5年生存率仅为31％，其生存期并未有明显改善。目前，现有的研究表明mds患者分子遗传异常与预后显著相关，为mds的治疗提供了一些新的选择，但由于临床过程的多变性，属于同一组的患者也可能表现出不同的诊疗和预后效果。
2、中国专利cn102621333a、cn102645541a、cn102608334a分别公开了il-15、bdnf、gcp2在骨髓增生异常综合征诊断中的应用。目前还缺少用于骨髓增生异常性肿瘤预后评估的生物标志物。基于机体内免疫反应的发生涉及多种免疫细胞的参与，单个免疫基因或少数免疫细胞对于预后的评估并不完整。因此，迫切需要新的预后生物标志物来实现更好的诊断和治疗，最终改善mds患者的预后。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于克服现有技术的缺点与不足，提供一种用于骨髓增生异常性肿瘤预后的生物标志物。
2、本专利技术的另一目的在于提供上述用于骨髓增生异常性肿瘤预后的生物标志物的应用
3、本专利技术的再一目的在于提供一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型。
4、本专利技术的再一目的在于提供一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的的风险评分系统。
5、本专利技术的再一目的在于提供一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤患者预后的试剂盒。
6、本专利技术的目的通过下述技术方案实现：
7、一种骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物，所述生物标志物包括3个差异基因：mdm2、rrm2或bnip3中的至少一个。
8、一种骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物组合物，包括mdm2、rrm2或bnip3中的至少两个。
9、本专利技术基于geo数据库gse58831、gse19429和gse114922数据集中获取mds病例的基因表达谱及相关的临床信息，数据预处理如下：首先根据注释文件将探针对应到基因上，去掉空载探针，多个探针对应同一个基因选择最大值作为该基因的表达水平。通过统计学分析，得到3个差异基因，分别为mdm2、rrm2、bnip3。
10、其中，mdm2(murine double minute2)基因，编码一个核定位的e3泛素连接酶，编码蛋白可通过靶向肿瘤抑制蛋白(如p53)促进蛋白酶体降解形成肿瘤。rrm2(ribonucleotide reductase m2)为编码核糖核酸还原酶亚基m2的基因，编码核糖核苷酸还原酶的两个不相同亚单位之一，这种还原酶催化核糖核苷酸形成脱氧核糖核苷酸，编码蛋白(m2)的合成以细胞周期依赖性方式调节。bnip3为bcl-2蛋白家族成员bnip3编码基因，属于仅含有bh-3结构域的bh3-only亚族，属于促凋亡蛋白。
11、所述的mdm2基因的ncbi数据库登记号为4193。
12、所述的rrm2基因的ncbi数据库登记号为6241。
13、所述的bnip3基因的ncbi数据库登记号为664。
14、本专利技术还提供上述生物标志物或生物标志物组合物在构建用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型或系统中的应用。
15、本专利技术还提供检测上述生物标志物或生物标志物组合物基因表达水平的试剂在构建用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型或系统中的应用。
16、本专利技术还提供一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型，所述模型通过生物标志物mdm2、rrm2和bnip3的基因表达值与其对应系数的乘积之和作为风险评分，risk score＝(-0.1803133)*mdm2+(-0.3242572)*rrm2+(-0.1265845)*bnip3。
17、本专利技术还提供一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的的风险评分系统，所述系统包括数据输入模块、模型计算模块和结果输出模块，所述的模型计算模块通过评分公式计算标志物mdm2、rrm2和bnip3的基因表达值与其对应系数的乘积之和，来获得肿瘤患者的风险分值，risk score＝(-0.1803133)*mdm2+(-0.3242572)*rrm2+(-0.1265845)*bnip3。
18、进一步地，所述的数据输入模块用于将患者标志物mdm2、rrm2和bnip3的基因表达值输入模型计算模块。
19、进一步地，所述的模型计算模块还包括将所述的模型计算模块中获得的风险值与阈值相比，阈值设定为-6.229788，若分值大于阈值为高风险组，有更短的生存预期；若分值小于阈值为低风险组，有更长的生存预期。
20、本专利技术还提供检测上述生物标志物或生物标志物组合物基因表达水平的试剂在制备用于预测骨髓增生异常性肿瘤患者预后的试剂盒的应用。
21、本专利技术还提供一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤患者预后的试剂盒，所述试剂盒含有检测上述生物标志物或生物标志物组合物基因表达水平的试剂。
22、所述试剂盒中所包含的试剂是本领域已知的任何可用于检测基因表达水平的试剂。
23、本专利技术相对于现有技术具有如下的优点及效果：
24、本专利技术提供了一种骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物，所述生物标志物包括差异基因：mdm2、rrm2或bnip3中的至少一个。本专利技术基于geo数据库(gse58831、gse19429、gse114922)中获取mds病例的基因表达谱及相应的临床信息，将数据库中的患者分为两组并筛选了两组之间的差异表达基因，根据基因表达值得到预测骨髓增生异常性肿瘤预后的上述预后生物标志物；本专利技术的骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物中的3个基因均有良好的诊断效能，auc接近或大于0.8，其建立的预后风险评分模型具有良好诊断效能，能够更加可靠地应用于临床实践，为骨髓增生异常性肿瘤提供疾病诊断及预后的新方法。
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1.一种骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物，其特征在于：
2.一种骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物组合物，其特征在于：
3.权利要求1所述生物标志物或权利要求2所述的生物标志物组合物在构建用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型或系统中的应用。
4.检测权利要求1所述生物标志物或权利要求2所述的生物标志物组合物基因表达水平的试剂在构建用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型或系统中的应用。
5.一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型，其特征在于，通过生物标志物MDM2、RRM2和BNIP3的基因表达值与其对应系数的乘积之和作为风险评分，risk score＝(-0.1803133)*MDM2+(-0.3242572)*RRM2+(-0.1265845)*BNIP3。
6.一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的的风险评分系统，其特征在于，包括数据输入模块、模型计算模块和结果输出模块，所述的模型计算模块通过评分公式计算标志物MDM2、RRM2和BNIP3的基因表达值与其对应系数的乘积之和，来获得肿瘤患者的风险分
7.根据权利要求6所述的系统，其特征在于，所述的数据输入模块用于将患者标志物MDM2、RRM2和BNIP3的基因表达值输入模型计算模块。
8.根据权利要求6所述的系统，其特征在于，所述的模型计算模块还包括将所述的模型计算模块中获得的风险值与阈值相比，阈值设定为-6.229788，若分值大于阈值为高风险组，有更短的生存预期；若分值小于阈值为低风险组，有更长的生存预期。
9.检测权利要求1所述生物标志物或权利要求2所述的生物标志物组合物基因表达水平的试剂在制备用于预测骨髓增生异常性肿瘤患者预后的试剂盒的应用。
10.一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤患者预后的试剂盒，其特征在于，含有检测权利要求1所述生物标志物或权利要求2所述的生物标志物组合物基因表达水平的试剂。
...【技术特征摘要】
1.一种骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物，其特征在于：
2.一种骨髓增生异常性肿瘤预后生物标志物组合物，其特征在于：
3.权利要求1所述生物标志物或权利要求2所述的生物标志物组合物在构建用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型或系统中的应用。
4.检测权利要求1所述生物标志物或权利要求2所述的生物标志物组合物基因表达水平的试剂在构建用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型或系统中的应用。
5.一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的风险评估模型，其特征在于，通过生物标志物mdm2、rrm2和bnip3的基因表达值与其对应系数的乘积之和作为风险评分，risk score＝(-0.1803133)*mdm2+(-0.3242572)*rrm2+(-0.1265845)*bnip3。
6.一种用于预测骨髓增生异常性肿瘤预后的的风险评分系统，其特征在于，包括数据输入模块、模型计算模块和结果输出模块，所述的模型计算模块通过评分公式计算标志物mdm2、rrm...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈晓梅，翁建宇，赖沛龙，杜欣，李超，王玉连，耿素霞，肖茂智，
申请(专利权)人：广东省人民医院，
类型：发明
国别省市：
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