【技术实现步骤摘要】
本申请涉及生物，尤其涉及一种用于结直肠癌筛查的标志物、探针组合物及其应用。
技术介绍
1、结直肠癌(colorectal cancer，crc)是常见的恶性肿瘤，发病率和死亡率均呈上升趋势，由2016年的40.1万宗确诊病例增加至2020年的45.6万宗确诊病例，复合年增长率为3.3％。预计结直肠癌的发病数将于2022年达到48.4万宗确诊病例。2020年，结直肠癌的发病数于中国在所有癌症中排名第二，同年中国结直肠癌的死亡人数达到28.6万例。根据疾病的发展阶段，结直肠癌被分为i-iv期。对于iv期结直肠癌患者，总体生存率非常低，5年生存率不足10％。而i期的患者能达到90％以上的生存率。因此，为了改善肠癌的整体预后，早期诊治显得至关重要。现阶段，中国的大肠癌筛查技术主要包括粪便隐血试验、肿瘤标记物检测和肠镜检查。目前结肠镜仍然是确诊肠癌的根本方法，但其高昂的费用、较差的可依从性以及可能的致伤性使得结肠镜难以大规模应用于无症状人群的筛查。粪便隐血试验(fobt)和外周血癌胚抗原(cea)虽然易被接受，但其较差的灵敏度和特异度也给肠癌早期诊治带来了挑战。
技术实现思路
1、本申请的目的在于提供了一种检测结直肠癌的标志物以及探针组合物，可以用于结直肠癌的筛查，所述的标志物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，以及癌症患者的预后检测，降低了侵入性检测造成的危害，并且具有更高的灵敏度和准确性。
2、本申请具体技术方案如下：
3、1.一种用于检测结直肠癌的标志物，其特
4、2.根据项1所述的标志物，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如seq idno:1-44所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物。
5、3.一种探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含靶向项1或2所述标志物甲基化的探针。
6、4.根据项3所述的探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的低甲基化的区域杂交；
7、优选地，所述第一探针组合物包括n个探针，所述n个探针与经重亚硫酸盐转化的高甲基化的区域的正义链和/或反义链的每个核苷酸杂交；
8、优选地，所述第二探针组合物包括m个探针，所述m个探针与经重亚硫酸盐转化的低甲基化的区域的正义链和/或反义链的每个核苷酸杂交；
9、优选地，n和m均是1-10中的任意整数；
10、优选地，第n-1个探针和第n个探针之间有x1个核苷酸重叠，优选地，x1为0-100中的任意整数；
11、优选地，第m-1个探针和第m个探针之间有x2个核苷酸重叠，优选地，x2为0-100中的任意整数；
12、进一步优选地，所述第一探针组合物包括如seq id no:45-132中的一种或两种，所述第二探针组合物包括如seq id no:133-220中的一种或两种。
13、5.标志物在制备用于检测结直肠癌的试剂盒中的用途，其特征在于，所述标志物对应的基因选自下述中的一种：ankrd20a12p、c1orf127、hspa7、adra2a、mtrnr2l8、mus81、rimbp2、wnk1、eddm3a、tbpl2、arnt2、mir1282、fzd2、loc339166、ankrd62、isoc2、leng9、abcg8、cdrt15p3、cdrt15p3、laptm4a、adamts5、mir3648、rfpl2、ankrd18dp、fam86hp、dux4l8、kiaa0825、pcbd2、pcdhb3、pcdhga1、psors1c2、linc02902、luaris、atad2、nat1、cacna1b和uck1。
14、6.根据项5所述的用途，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如seq id no:1-44所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物；
15、优选地，所述探针组合物用于靶向结直肠癌的甲基化后的标志物；
16、优选地，所述探针组合物为项3或4所述的探针组合物。
17、7.一种用于结直肠癌检测的组合物，其特征在于，所述组合物包括用于检测选自下述标志物对应的基因中的任一种甲基化的核酸：ankrd20a12p、c1orf127、hspa7、adra2a、mtrnr2l8、mus81、rimbp2、wnk1、eddm3a、tbpl2、arnt2、mir1282、fzd2、loc339166、ankrd62、isoc2、leng9、abcg8、cdrt15p3、cdrt15p3、laptm4a、adamts5、mir3648、rfpl2、ankrd18dp、fam86hp、dux4l8、kiaa0825、pcbd2、pcdhb3、pcdhga1、psors1c2、linc02902、luaris、atad2、nat1、cacna1b和uck1。
18、8.根据项7所述的组合物，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如seq idno:1-44所示的一种。
19、9.根据项7或8所述的组合物，其特征在于，所述核酸包括项3或4所述的探针组合物；
20、优选地，所述核酸包括：
21、引物，所述引物为所述标志物的靶序列中的至少9个核苷酸的片段，所述片段包含至少一个cpg二核苷酸序列；
22、优选地，所述核酸还包括：
23、探针，所述探针为在中等严紧或严紧条件下与所述标志物的靶序列中的至少15个核苷酸片段杂交，所述片段包含至少一个cpg二核苷酸序列；
24、优选地，所述组合物还包括将标志物的靶序列的5位未甲基化胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶的试剂；
25、优选地，所述用于检测标志物的靶序列甲基化的核酸还包括：
26、优先与处于非甲基化状态的靶序列结合的阻断剂。
27、10.一种试剂盒，其特征在于，其包含用于检测项1或2所述的标志物的试剂或者项3或4所述的探针组合物或者项7-9中任一项所述的组合物。
28、11.一种芯片，其特征在于，其包含项1或2所述的标志物或者本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于检测结直肠癌的标志物，其特征在于，所述标志物对应的基因选自下述中的一种：ANKRD20A12P、C1orf127、HSPA7、ADRA2A、MTRNR2L8、MUS81、RIMBP2、WNK1、EDDM3A、TBPL2、ARNT2、MIR1282、FZD2、LOC339166、ANKRD62、ISOC2、LENG9、ABCG8、CDRT15P3、CDRT15P3、LAPTM4A、ADAMTS5、MIR3648、RFPL2、ANKRD18DP、FAM86HP、DUX4L8、KIAA0825、PCBD2、PCDHB3、PCDHGA1、PSORS1C2、LINC02902、LUARIS、ATAD2、NAT1、CACNA1B和UCK1。
2.根据权利要求1所述的标志物，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如SEQ IDNO:1-44所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物。
3.一种探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含靶向权利要求1或2所述标志物甲基化的探针。
4.根据权利要求3所述的探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含高
5.标志物在制备用于检测结直肠癌的试剂盒中的用途，其特征在于，所述标志物对应的基因选自下述中的一种：ANKRD20A12P、C1orf127、HSPA7、ADRA2A、MTRNR2L8、MUS81、RIMBP2、WNK1、EDDM3A、TBPL2、ARNT2、MIR1282、FZD2、LOC339166、ANKRD62、ISOC2、LENG9、ABCG8、CDRT15P3、CDRT15P3、LAPTM4A、ADAMTS5、MIR3648、RFPL2、ANKRD18DP、FAM86HP、DUX4L8、KIAA0825、PCBD2、PCDHB3、PCDHGA1、PSORS1C2、LINC02902、LUARIS、ATAD2、NAT1、CACNA1B和UCK1。
6.根据权利要求5所述的用途，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如SEQ IDNO:1-44所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物；
7.一种用于结直肠癌检测的组合物，其特征在于，所述组合物包括用于检测选自下述标志物对应的基因中的任一种甲基化的核酸：ANKRD20A12P、C1orf127、HSPA7、ADRA2A、MTRNR2L8、MUS81、RIMBP2、WNK1、EDDM3A、TBPL2、ARNT2、MIR1282、FZD2、LOC339166、ANKRD62、ISOC2、LENG9、ABCG8、CDRT15P3、CDRT15P3、LAPTM4A、ADAMTS5、MIR3648、RFPL2、ANKRD18DP、FAM86HP、DUX4L8、KIAA0825、PCBD2、PCDHB3、PCDHGA1、PSORS1C2、LINC02902、LUARIS、ATAD2、NAT1、CACNA1B和UCK1。
8.根据权利要求7所述的组合物，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如SEQ IDNO:1-44所示的一种。
9.根据权利要求7或8所述的组合物，其特征在于，所述核酸包括权利要求3或4所述的探针组合物；
10.一种试剂盒，其特征在于，其包含用于检测权利要求1或2所述的标志物的试剂或者权利要求3或4所述的探针组合物或者权利要求7-9中任一项所述的组合物。
11.一种芯片，其特征在于，其包含权利要求1或2所述的标志物或者权利要求3或4所述的探针组合物或者权利要求7或8所述的组合物。
...【技术特征摘要】
1.一种用于检测结直肠癌的标志物，其特征在于，所述标志物对应的基因选自下述中的一种：ankrd20a12p、c1orf127、hspa7、adra2a、mtrnr2l8、mus81、rimbp2、wnk1、eddm3a、tbpl2、arnt2、mir1282、fzd2、loc339166、ankrd62、isoc2、leng9、abcg8、cdrt15p3、cdrt15p3、laptm4a、adamts5、mir3648、rfpl2、ankrd18dp、fam86hp、dux4l8、kiaa0825、pcbd2、pcdhb3、pcdhga1、psors1c2、linc02902、luaris、atad2、nat1、cacna1b和uck1。
2.根据权利要求1所述的标志物，其特征在于，所述标志物的核苷酸序列选自如seq idno:1-44所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物。
3.一种探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含靶向权利要求1或2所述标志物甲基化的探针。
4.根据权利要求3所述的探针组合物，其特征在于，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的低甲基化的区域杂交；
5.标志物在制备用于检测结直肠癌的试剂盒中的用途，其特征在于，所述标志物对应的基因选自下述中的一种：ankrd20a12p、c1orf127、hspa7、adra2a、mtrnr2l8、mus81、rimbp2、wnk1、eddm3a、tbpl2、arnt2、mir1282、fzd2、loc339166、ankrd62、isoc2、leng9、abcg8、cdrt15p3、cdrt15p3、laptm4a、adamts5、mir3...
【专利技术属性】
技术研发人员：李永君，魏闯，王秀秀，吴宁宁，杨亚东，郭媛媛，刘栓平，王翠翠，周光朋，吴振，
申请(专利权)人：博尔诚北京科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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