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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物医药,具体涉及一种用于covid-19患者康复1年后中和抗体无创预测的口腔真菌微生物基因标志物及其临床应用。
技术介绍
1、一项随访研究表明,从covid-19中康复的1733名患者中,有76%至少出现了一种在6个月内未消退的症状(lancet,2021)。关注康复者不仅可以改善患者的预后和生活质量,还可能为covid-19的诊断和治疗提供独特的视角。事实上,在从covid-19中恢复的受试者中可以观察到长期微生物群失调和细胞因子改变,这意味着在6个月内未消退的症状的新型冠状病毒感染者的微生物群与免疫状态和身体健康状况的改变密切相关,并且可能是症状的潜在原因。
2、人体微生态是一个复杂而动态的生态系统,在营养代谢、免疫发育和调节方面发挥着至关重要的功能,与hiv、hbv和h7n9等病毒性疾病的发生和发展密切相关。口腔微生态系统作为消化系统的起始端,是人体微生态系统的重要组成部分,与人体健康和疾病密切相关,在对抗传染病方面也发挥了至关重要的作用,毕竟sars-cov-2是一种以口咽为主要复制部位的呼吸道病毒。多项研究证实,covid-19患者的口腔和粪便微生物组发生了显著变化,最显著的是微生物多样性的减少、条件致病菌的富集以及有益共生菌的消耗。这种变化与疾病的严重程度有关,可以通过改善患者微生物组的多样性来促进疾病恢复(gastroenterology,2020;gut,2021)。
3、口腔微生物中的关健功能菌可成为人类疾病的新型生物标志物。口腔微生态的特征或者基于口腔微生物建立的评估模
技术实现思路
1、本专利技术提供了一种用于评估covid-19患者康复1年后中和抗体水平的口腔真菌微生物基因标志物(微生物模型),由seq id no:1-3所示的3种微生物基因组成,所述真菌微生物基因在人体口腔中富集。
2、3种微生物基因序列如下:
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4、gcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatgtgaattgcagaattcagtgaatcatcgaatctttgaacgcaccttgcgccccttggtattccgaggggcatgcctgtttgagtgtcattaaattctcaaactcactttggttttttccaattgtgatgtttggattgttgggggctgctggccttgacaggtcggctcctcttaaatgcattagcaggacttctcattgcctctgcgcatgatgtgataattatcactcatcaatagcacgcatgaatagagtccagc
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9、另外本专利技术还提供了一种用于检测试剂,包括用于检测seq id no:1-3所示的3种微生物基因的引物,所述引物序列为seq id no:4-5。
10、引物primers
11、测序区域its2 region:3f-4r
12、上游引物:3f gcatcgatgaagaacgcagc
13、下游引物:4r tcctccgcttattgatatgc
14、本专利技术还提供了检测试剂在建立一种评估covid-19患者康复1年后中和抗体水平的口腔真菌微生物模型中的应用,所述检测试剂适用于检测seq id no:1-3所示的3种微生物基因。
15、所述口腔真菌微生物模型适用于评估covid-19患者康复1年后中和抗体水平,其中中和抗体抑制率≥70%被认为是高水平,30%≤中和抗体抑制率<70%被认为是低水平,中和抗体抑制率<30%被认为是中和抗体阴性。
16、对所述对象的舌苔进行检测,以便确定该样本是否包含所述的微生物基因,是否可以建立评估covid-19患者康复1年后中和抗体水平的微生物基因模型。
17、通过收集入组对象的舌苔样本,抽提微生物总dna,完成微生物dna的internaltranscribed spacer(its)测序,检测是否存在seq id no:1-3所示3种微生物基因。
18、进一步的,通过收集入组对象的舌苔样本,抽提微生物总dna,进行口腔菌群的internal transcribed spacer(its)测序;基于高通量测序数据,建立covid-19患者康复1年后中和抗体水平的微生物评估模型,建立新型冠状病毒感染康复者1年后中和抗体的患病率(probability of disease,pod)指数。
19、具体包括:
20、(1)收集35例新型冠状病毒感染康复患者出院时的舌苔,按照dna的标准抽提方法完成舌苔样本中微生物总dn本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的口腔真菌微生物基因标志物,其特征在于:由SEQ ID NO:1-3所示的3种微生物基因组成,所述微生物在口腔中富集。
2.一种用于检测权利要求1所述口腔真菌微生物模型的检测试剂,包括用于检测权利要求1所述的SEQ ID NO:1-3所示的3种微生物基因的引物。
3.根据权利要求2所述的检测试剂,其特征在于:所述引物序列为SEQ ID NO:4-5。
4.权利要求2所述检测试剂在制备COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的评估产品中的应用,所述检测试剂适用于检测权利要求1所述的口腔真菌微生物基因。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:所述口腔真菌微生物模型适用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平,其中中和抗体抑制率≥70%被认为是高水平,30%≤中和抗体抑制率<70%被认为是低水平,中和抗体抑制率<30%被认为是中和抗体阴性。
6.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:对所述对象的舌苔进行检测,以便确定该样本是否包含所述的微生物基因,是否可以
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:通过收集入组对象的舌苔样本,抽提微生物总DNA,完成微生物DNA的ITS测序,检测是否存在权利要求1所述的3种微生物基因。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:通过收集入组对象的舌苔样本,抽提微生物总DNA,进行口腔菌群的ITS测序;基于高通量测序数据,建立COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的真菌微生物评估模型,建立新型冠状病毒感染康复者1年后中和抗体的患病率POD指数。
9.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,具体包括:
10.一种用于评估COVID-19患者康复1年后中和抗体水平的口腔真菌微生物模型的评估产品,包括用于检测权利要求1所述的SEQ ID NO:1-3所示的3种微生物基因的引物。
...【技术特征摘要】
1.一种用于评估covid-19患者康复1年后中和抗体水平的口腔真菌微生物基因标志物,其特征在于:由seq id no:1-3所示的3种微生物基因组成,所述微生物在口腔中富集。
2.一种用于检测权利要求1所述口腔真菌微生物模型的检测试剂,包括用于检测权利要求1所述的seq id no:1-3所示的3种微生物基因的引物。
3.根据权利要求2所述的检测试剂,其特征在于:所述引物序列为seq id no:4-5。
4.权利要求2所述检测试剂在制备covid-19患者康复1年后中和抗体水平的评估产品中的应用,所述检测试剂适用于检测权利要求1所述的口腔真菌微生物基因。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:所述口腔真菌微生物模型适用于评估covid-19患者康复1年后中和抗体水平,其中中和抗体抑制率≥70%被认为是高水平,30%≤中和抗体抑制率<70%被认为是低水平,中和抗体抑制率<30%被认为是中和抗体阴性。
6.根据...
【专利技术属性】
技术研发人员:王琼,柳闪烁,任志刚,
申请(专利权)人:郑州大学第一附属医院,
类型:发明
国别省市:
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