【技术实现步骤摘要】
本申请涉及数据转换，特别是涉及一种脑影像数据的bids格式自动转换方法和装置。
技术介绍
1、随着医疗技术的发展，出现了脑影像技术，对脑影像技术的研究过程中，不可避免的涉及到大量脑影像数据。目前，采用医疗数字影像传输协定（digital imaging andcommunications in medicine，dicom）来实现脑影像数据的数据传输与获取。dicom是医学图像和相关信息的国际标准，定义了可以与临床使用所需的数据和质量进行交换的医学图像的格式，每一张dicom数据中都存储着大量的信息，包括患者信息（姓名、id、体重等）、检查信息（检查的部位、描述等）、序列信息（序列描述、序列采集日期和时间等）、图像信息（图像类型等），这些信息都是以特定格式保存在dicom数据的dataset中。
2、然而，在获取dicom格式的脑影像数据的过程中，因为受到采集仪器、操作人员等因素的影响，而产生文件夹架构杂乱无序、数据命名方式不统一、多文件类型的复杂数据集等问题。因此，dicom格式的数据在输入脑影像分析平台之前，需要占用大量的计算资源进行数据格式的整理。基于此，有必要将获取到的dicom格式的脑影像数据转化脑影像分析平台直接可以处理的脑影像数据结构（brain imaging data structure，bids）的格式。
3、然而，如何将dicom格式的脑影像数据转换为脑影像分析平台直接可以处理的bids格式，目前仍没有明确方法。
技术实现思路
1、基于
2、第一方面，本申请提供了一种脑影像数据的bids格式自动转换方法。所述方法包括：
3、基于接收到的待转换脑影像数据的文件存储路径，确定所述待转换脑影像数据的架构类型；
4、根据所述待转换脑影像数据的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹，得到所述待转换脑影像数据中的被试文件夹；
5、基于所述被试文件夹，获取所述被试文件夹中的bids格式的被试名称和bids格式的session名称；
6、根据bids格式的所述被试名称、bids格式的所述session名称以及每种模态和数据类型所对应的bids字段，按照预设的命名规则，确定所述被试文件夹中所有序列对应的bids名称；
7、将转换完成的bids文件保存在与所述bids文件的bids名称所对应的文件夹中。
8、在其中一个实施例中，所述根据所述待转换脑影像数据的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹，得到所述待转换脑影像数据中的被试文件夹，包括以下步骤：
9、当所述待转换脑影像数据的架构类型为被试包含序列型时，将所述待转换脑影像数据的非空的一级文件夹确定为当前所述待转换脑影像数据的所述被试文件夹；
10、当所述待转换脑影像数据的架构类型为序列包含被试型时，将所述待转换脑影像数据的非空的二级文件夹确定为当前所述待转换脑影像数据的所述被试文件夹。
11、在其中一个实施例中，所述基于所述被试文件夹，获取所述被试文件夹中的bids格式的被试名称和bids格式的session名称，包括以下步骤：
12、将所述被试文件夹的各个被试名称转换为bids格式的被试名称；
13、筛选出所述被试文件夹中的session文件夹；
14、将所述session文件夹的各个session名称转换为bids格式的session名称。
15、在其中一个实施例中，在根据bids格式的所述被试名称、bids格式的所述session名称以及每种模态和数据类型所对应的bids字段，按照预设的命名规则，确定所述被试文件夹中所有序列对应的bids名称之前，包括：
16、获取每个被试各个序列的序列特征；
17、基于每个所述被试各个序列的所述序列特征，采用多尺度特征融合的方法判断每个所述被试的各个序列的模态和数据类型；
18、根据预设的配置规则，为每个所述被试的各个序列配置与所述模态和所述数据类型所对应的bids字段。
19、在其中一个实施例中，所述获取每个被试各个序列的序列特征，包括以下步骤：
20、根据所述被试文件夹的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹，确定每个所述被试所对应的序列文件夹；
21、基于每个所述被试所对应的序列文件夹中的dicom文件的文件头，获取每个所述被试各个序列的所述序列特征。
22、在其中一个实施例中，在将转换完成的bids文件保存在与所述bids文件的bids名称所对应的文件夹中之前，包括：
23、构建与bids文件所在的被试文件夹的架构所对应的文件夹架构。
24、在其中一个实施例中，在将转换完成的bids文件保存在与所述bids文件的bids名称所对应的文件夹中之前，还包括：
25、采用dcm2niix工具，将所述待转换脑影像数据转换为bids类型的bids文件，得到所述转换完成的bids文件。
26、在其中一个实施例中，在将转换完成的bids文件保存在与所述bids文件的bids名称所对应的文件夹中之后，还包括：
27、生成与所述bids文件所对应的bids格式数据集描述文件。
28、第二方面，本申请还提供了一种脑影像数据的bids格式自动转换装置。所述装置包括：
29、架构类型确定模块，用于基于接收到的待转换脑影像数据的文件存储路径，确定所述待转换脑影像数据的架构类型；
30、被试文件夹获取模块，用于根据所述待转换脑影像数据的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹，得到所述待转换脑影像数据中的被试文件夹；
31、bids格式名称获取模块，用于基于所述被试文件夹，获取所述被试文件夹中的bids格式的被试名称和bids格式的session名称；
32、序列命名模块，用于根据bids格式的所述被试名称、bids格式的所述session名称以及每种模态和数据类型所对应的bids字段，按照预设的命名规则，确定所述被试文件夹中所有序列对应的bids名称；
33、以及bids文件保存模块，用于将转换完成的bids文件保存在与所述bids文件的bids名称所对应的文件夹中。
34、第三方面，本申请还提供了一种计算机设备。所述计算机设备包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述第一方面所述的脑影像数据的bids格式自动转换方法。
35、上述脑影像数据的bids格式自动转换方法、装置和计算机设备，通过接收到的待转换脑影像数据的文件存储路径，确定待转换脑影像数据的架构类型，进而根据待转换脑影像数据的架构类型以及待转换脑影像数据的各级文件夹，得到待转换脑影像数据中的被试文件夹。本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在于，所述根据所述待转换脑影像数据的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹，得到所述待转换脑影像数据中的被试文件夹，包括：
3.根据权利要求1所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在于，所述基于所述被试文件夹，获取所述被试文件夹中的BIDS格式的被试名称和BIDS格式的session名称，包括：
4.根据权利要求1所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在于，在根据BIDS格式的所述被试名称、BIDS格式的所述session名称以及每种模态和数据类型所对应的BIDS字段，按照预设的命名规则，确定所述被试文件夹中所有序列对应的BIDS名称之前，包括：
5.根据权利要求4所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在于，所述获取每个被试各个序列的序列特征，包括：
6.根据权利要求1至权利要求5中任一项所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在
7.根据权利要求1至权利要求5中任一项所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在于，在将转换完成的BIDS文件保存在与所述BIDS文件的BIDS名称所对应的文件夹中之前，还包括：
8.根据权利要求1至权利要求5中任一项所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法，其特征在于，在将转换完成的BIDS文件保存在与所述BIDS文件的BIDS名称所对应的文件夹中之后，还包括：
9.一种脑影像数据的BIDS格式自动转换装置，其特征在于，所述装置包括：
10.一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至权利要求8中任一项所述的脑影像数据的BIDS格式自动转换方法的步骤。
...【技术特征摘要】
1.一种脑影像数据的bids格式自动转换方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的脑影像数据的bids格式自动转换方法，其特征在于，所述根据所述待转换脑影像数据的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹，得到所述待转换脑影像数据中的被试文件夹，包括：
3.根据权利要求1所述的脑影像数据的bids格式自动转换方法，其特征在于，所述基于所述被试文件夹，获取所述被试文件夹中的bids格式的被试名称和bids格式的session名称，包括：
4.根据权利要求1所述的脑影像数据的bids格式自动转换方法，其特征在于，在根据bids格式的所述被试名称、bids格式的所述session名称以及每种模态和数据类型所对应的bids字段，按照预设的命名规则，确定所述被试文件夹中所有序列对应的bids名称之前，包括：
5.根据权利要求4所述的脑影像数据的bids格式自动转换方法，其特征在于，所述获取每个被试各个序列的序列特征，包括：
【专利技术属性】
技术研发人员：张瑜，张春玲，孙超良，李媛媛，方潇宇，范明，蒋田仔，
申请(专利权)人：之江实验室，
类型：发明
国别省市：
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