【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物中一种基于acox2基因snp标记检测奶牛产奶性状的方法及应用。
技术介绍
1、acox2基因位于牛22号染色体上，有15个外显子，基因全长30897bp，是脂酰辅酶a氧化酶2的编码基因，属于酰基辅酶a氧化酶家族。该基因家族包含acox1、acox2和acox3共3种亚型，均参与过氧化物酶代谢及糖代谢过程。acox2基因通过氧化胆汁酸的辅酶a酯中间体，催化胆固醇转化为胆汁酸，从而影响组织内脂肪酸的含量，是脂肪酸代谢过程中重要的调控基因。研究表明，acox2基因参与d-型氧化体系、支链脂肪酸的降解，影响酰基辅酶a脱氢酶的脂肪酸β-氧化，进而调控脂肪酸代谢。
2、acox2基因缺乏会造成胆汁酸合成缺陷疾病，多发于青少年群体中。研究证实，缺乏该基因将会阻碍胆固醇转化为胆汁酸，积聚毒性c27胆汁酸中间体，从而减少c24胆汁酸的合成。在对肝癌的研究中，通过实验表明acox2过表达对肿瘤具有抑制作用，并证实其通过pparα途径减少了体内外肝癌的增殖和转移。此外，王小骊等对番鸭回肠进行转录组差异表达分析，发现acox2基因与腹脂重和腹脂率呈显著正相关。
3、dna的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链dna在多种酶的作用下可以变性解旋成单链，在dna聚合酶的参与下，根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现，dna在高温时也可以发生变性解链，当温度降低后又可以复性成为双链。因此，通过温度变化控制dna的变性和复性，加入设计引物，dna聚合酶、dntp就可以完成特定基因的体外复制
技术实现思路
1、本专利技术所要解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定奶牛的乳成分性状或如何进行奶牛育种。
2、为了解决上述技术问题，本专利技术首先提供了一种应用，所述应用为下述p1或p2：
3、所述p1为检测所述snp1的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状中的应用；
4、所述p2为检测所述snp2的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状中的应用；
5、所述snp1是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.1的第561位核苷酸，其为c或t；所述snp2是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.2的第170位核苷酸，其为c或t。
6、上述snp1和snp2两个单核苷酸多态性位点分别位于奶牛基因组第22号染色体上的acox2基因的上游5’调控区和下游3’调控区，所述acox2基因位于奶牛第22号染色体第42,836,492-42,867,389位，与奶牛产奶性状相关，其核苷酸序列为序列表中序列a第2,001-32,898位所示dna分子。
7、为了解决上述技术问题，本专利技术还提供了一种应用，所述应用为q1或q2：
8、所述q1为检测所述snp1的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状产品中的应用；
9、所述q2为检测所述snp2的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状产品中的应用；
10、所述snp1是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.1的第561位核苷酸，其为c或t；所述snp2是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.2的第170位核苷酸，其为c或t。
11、为了解决上述技术问题，本专利技术还提供了一种应用，所述应用为e1或e2：
12、所述e1为检测所述snp1的多态性或基因型的物质在奶牛育种或制备奶牛育种产品中的应用；
13、所述e2为检测所述snp2的多态性或基因型的物质在奶牛育种或制备奶牛育种产品中的应用；
14、所述snp1是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.1的第561位核苷酸，其为c或t；所述snp2是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.2的第170位核苷酸，其为c或t。
15、所述奶牛乳成分可为产奶量、乳脂量、乳脂率、乳蛋白量和乳蛋白率中的任一和/或多种的组合。
16、所述snp1的基因型(即等位基因)可为基因型cc、基因型tt或基因型tc，基因型cc是snp1为c的纯合型，基因型tt是snp1为t的纯合型，基因型tc是snp1为t和c的杂合型；所述snp2的基因型(即等位基因)可为基因型cc、基因型tt或基因型tc，基因型cc是snp2为c的纯合型，基因型tt是snp2为t的纯合型，基因型tc是snp2为t和c的杂合型。
17、为解决上述技术问题，本专利技术还提供了一种产品，所述产品含有上述检测奶牛基因组snp1多态性或基因型的物质或含有上述检测奶牛基因组snp2多态性或基因型的物质，且可为下述g1)-g3)中的任一种：
18、g1)检测奶牛乳成分性状相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；
19、g2)鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状的产品；
20、g3)用于奶牛育种的产品。
21、为了解决上述技术问题，本专利技术还提供了鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状的方法，包括检测待测奶牛上述snp1的基因型，根据所述待测奶牛的所述snp1的基因型鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状：所述snp1的基因型为cc或tc的奶牛的乳成分性状高于或候选高于基因型为tt的奶牛；所述cc是snp1为c的纯合型；所述tt是snp1为t的纯合型；所述tc是snp1为c和t的杂合型。
22、为了解决上述技术问题，本专利技术还提供了一种鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状的方法，包括检测待测奶牛上述snp2的基因型，根据所述待测奶牛的所述snp2的基因型鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状：所述snp2的基因型为cc或tc的奶牛的乳成分性状高于或候选高于基因型为tt的奶牛；所述cc是snp2为c的纯合型；所述tt是snp2为t的纯合型；所述tc是snp2为c和t的杂合型。
23、本专利技术还提供了一种奶牛育种的方法，包括选择snp1的基因型为cc或tc的奶牛作为亲本进行育种；所述snp1是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.1的第561位核苷酸，其为c或t；所述cc为所述snp1为c的纯合型；所述tc是snp1为c和t的杂合型。
24、本专利技术还提供了一种奶牛育种的方法，包括选择snp2的基因型为cc或tc的奶牛作为亲本进行育种；所述snp2是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq id no.2的第170位核苷酸，其为c或t；所述cc为所述snp2为c的纯合型；所述tc是snp2为c和t的杂合型。
25、上文所述奶牛育种为培育高乳成分的奶牛品种。
26、上文所述乳成分具体可为乳成分量、乳脂量、乳脂率、本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.应用，其特征在于：所述应用为下述P1或P2：
2.应用，其特征在于：所述应用为Q1或Q2：
3.应用，其特征在于：所述应用为E1或E2：
4.产品，其特征在于：所述产品含有权利要求1中所述检测奶牛基因组SNP1多态性或基因型的物质或含有权利要求1中所述检测奶牛基因组SNP2多态性或基因型的物质，且可为下述G1)-G3)中的任一种：
5.奶牛育种的方法，其特征在于：所述方法包括选择SNP1的基因型为CC或TC的奶牛作为亲本进行育种；所述SNP1是奶牛基因组的一个SNP，为序列表中SEQ IDNo.1的第561位核苷酸，其为C或T；所述CC为所述SNP1为C的纯合型；所述TC是SNP1为C和T的杂合型。
6.奶牛育种的方法，其特征在于：所述方法包括选择SNP2的基因型为CC或TC的奶牛作为亲本进行育种；所述SNP2是奶牛基因组的一个SNP，为序列表中SEQ IDNo.2的第170位核苷酸，其为C或T；所述CC为所述SNP2为C的纯合型；所述TC是SNP2为C和T的杂合型。
7.根据权利要求1-3任一权利要求所
8.根据权利要求1-3任一权利要求所述的应用、权利要求4所述的产品、或权利要求5或6所述的方法，其特征在于：所述检测SNP1和SNP2这两个SNP的多态性或基因型的物质，或所述检测单倍型的物质，或检测SNP1多态性或基因型性的物质，或检测SNP2多态性或基因型性的物质，为如下D1)、D2)或D3)：
9.根据权利要求8所述的应用或产品或方法，其特征在于：所述PCR引物为由序列表中SEQ ID No.1的第1-19位所示的单链DNA和与SEQ ID No.1的第726-744位反向互补的单链DNA组成的引物组，和/或由序列表中SEQ ID No.2的第1-20位位所示的单链DNA和与SEQ IDNo.2的第381-400位反向互补的单链DNA组成的引物组。
10.根据权利要求8或9所述的应用或产品或方法，其特征在于：所述奶牛为中国荷斯坦牛。
...【技术特征摘要】
1.应用，其特征在于：所述应用为下述p1或p2：
2.应用，其特征在于：所述应用为q1或q2：
3.应用，其特征在于：所述应用为e1或e2：
4.产品，其特征在于：所述产品含有权利要求1中所述检测奶牛基因组snp1多态性或基因型的物质或含有权利要求1中所述检测奶牛基因组snp2多态性或基因型的物质，且可为下述g1)-g3)中的任一种：
5.奶牛育种的方法，其特征在于：所述方法包括选择snp1的基因型为cc或tc的奶牛作为亲本进行育种；所述snp1是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq idno.1的第561位核苷酸，其为c或t；所述cc为所述snp1为c的纯合型；所述tc是snp1为c和t的杂合型。
6.奶牛育种的方法，其特征在于：所述方法包括选择snp2的基因型为cc或tc的奶牛作为亲本进行育种；所述snp2是奶牛基因组的一个snp，为序列表中seq idno.2的第170位核苷酸，其为c或t；所述cc为所述snp2为c的纯合型；所述tc是snp2为c和t的杂合型。
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