【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及乳腺癌预后模型的构建方法领域技术，尤其是指一种乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法。
技术介绍
1、乳腺癌依旧是全球女性疾病负担的主要肿瘤因素，发病率仍呈不断上升的趋势且发病年龄越来越低。由于乳腺癌缺乏有效的治疗靶点，传统的治疗方法包括手术、放疗和化疗在内仍然是主要的治疗方法。同时，因为乳腺癌具有多种临床行为和生物学特征，这给乳腺癌的预防、诊断和治疗都带来了一定的挑战。目前，已有一些研究构建了乳腺癌预后相关模型来预测患者生存。现有模型的主要缺陷:(1)构建方法单一,预测效果有限；(2)采用的统计学算法较简单,无法深度挖掘复杂关系；(3)样本量小,不同人群间迁移性差；(4)生物学解释性不足；此外，暂时没有研究建立乳腺癌的线粒体相关基因的预后模型；申请号为202211359084.9的专利技术公开了一种肿瘤恶性细胞基因预后风险模型构建方法；现有技术中的构建方法，对乳腺癌患者预后的评估预测能力有限；未能将线粒体相关的差异表达基因作为独立的预后因素，预后预测的准确度低；未对线粒体相关基因进行更加科学、精准的筛选，乳腺癌的预后准...
【技术保护点】
1.一种乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：包括如下步骤：
2.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：所述步骤三中筛选正常样本和肿瘤样本之间的差异表达基因的条件设置为FDR<0.05、log|FC|>1，通过R语言的“limma”包进行筛选。
3.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：所述步骤五中从线粒体相关差异表达基因中筛选出构建预后预测模型的参数并获取相对应的回归系数具体包括如下步骤：
4.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关...
【技术特征摘要】
1.一种乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：包括如下步骤：
2.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：所述步骤三中筛选正常样本和肿瘤样本之间的差异表达基因的条件设置为fdr<0.05、log|fc|>1，通过r语言的“limma”包进行筛选。
3.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：所述步骤五中从线粒体相关差异表达基因中筛选出构建预后预测模型的参数并获取相对应的回归系数具体包括如下步骤：
4.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：所述步骤六中，基于筛选出来的线粒体相关差异表达基因作为建立乳腺癌预后模型的参数，通过岭回归算法并用交叉验证法根据方差最小确定最优调整参数λ，从而确定用于构建预测模型的最优变量。
5.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：所述步骤一中收集获取乳腺癌的转录组数据和患者的临床数据的数据库包括tcga数据库、geo数据库和ucsc数据库。
6.根据权利要求1所述的乳腺癌的线粒体相关基因预后模型的构建方法，其特征在于：所述步骤二中获取线粒体相关基因的数据库包括mitocarta数据库、gsea数据库和genecards数据库。
7.根据权利要求...
【专利技术属性】
技术研发人员：丁茜，裴可，张梦娜，颉丽英，蔺宝，曾泽皓，何跃腾，蔡车国，胡隽源，
申请(专利权)人：深圳市北科源细胞科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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