一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体SSR标记引物及其获取方法技术

本发明专利技术涉及一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体SSR标记引物及其获取方法。该叶绿体SSR标记引物为SSR3、SSR33、SSR37、SSR49、SSR51、SSR59或SSR61中的一种或几种，其获取方法包括：1.检索下载闭鞘姜的叶绿体基因组，预测其SSR位点；2.设计和合成SSR引物；3.提取闭鞘姜及变种的DNA，进行PCR扩增；4.筛选多态性SSR标记，获得用于闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体SSR标记。采用该叶绿体SSR标记引物，可准确地对闭鞘姜及变种进行分子鉴定，鉴定效率高，成本低。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学，具体涉及一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体ssr标记引物及其获取方法。

技术介绍

1、闭鞘姜(hellenia speciosa(j.)govaerts)属于闭鞘姜科(costaceae)大唇闭鞘姜属(hellenia)植物，产于中国台湾、广东、广西、云南、贵州，热带亚洲及大洋洲广布。株高1～3m，顶端分枝常旋卷，叶螺旋排列，花白色，唇瓣喇叭形；株形好，开花繁密，花期长，可用于庭院观赏或鲜切花(高江云，等2006；吴德邻，等2016)。根状茎药用有利水、消肿、解毒等功效(吴德邻，等2016)。

2、由于闭鞘姜及变种植物一般具有叶螺旋状排列的性状，在营养生长期，闭鞘姜及变种植物的分类识别和鉴定一直是植物学研究面临的重大难题和挑战。因此，准确、快速、高效地识别闭鞘姜及变种植物，不仅是植物学研究上的迫切需要，而且对更好地开发和利用闭鞘姜及变种植物资源，更好地将闭鞘姜及变种植物资源服务于社会的发展具有重要意义。

3、叶绿体是植物特有的细胞器，具有自身的dna，并区别于核基因组而呈母系遗传的特点，在植物分子系统进化和物本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体SSR分子标记引物，其特征在于，所述叶绿体SSR标记引物为SSR3、SSR33、SSR37、SSR49、SSR51、SSR59或SSR61中的一种或几种；

2.根据权利要求1所述的一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体SSR标记引物获取方法，其特征在于，包括如下步骤：

3.根据权利要求2所述的一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体SSR标记引物获取方法，其特征在于，所述步骤一中下载的闭鞘姜的叶绿体基因组进行SSR位点的预测，其参数设置为：1个碱基的重复元件重复次数≥10次，2个碱基的重复元件重复次数≥5次，3个至6个碱基的重复元件重复次数≥...

【技术特征摘要】

1.一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体ssr分子标记引物，其特征在于，所述叶绿体ssr标记引物为ssr3、ssr33、ssr37、ssr49、ssr51、ssr59或ssr61中的一种或几种；

2.根据权利要求1所述的一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体ssr标记引物获取方法，其特征在于，包括如下步骤：

3.根据权利要求2所述的一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体ssr标记引物获取方法，其特征在于，所述步骤一中下载的闭鞘姜的叶绿体基因组进行ssr位点的预测，其参数设置为：1个碱基的重复元件重复次数≥10次，2个碱基的重复元件重复次数≥5次，3个至6个碱基的重复元件重复次数≥3次；同时，两个ssr位点间的距离不少于200bp，获得ssr位点。

4.根据权利要求2所述的一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体ssr标记引物获取方法，其特征在于，所述步骤二中，对于鉴定的ssr位点进行批量引物设计，并人工合成ssr引物。

5.根据权利要求2所述的一组闭鞘姜及变种分子鉴定的叶绿体ssr标记引物获取方法，其特征在于，所述步骤三中，dna的提取，采用改良ctab法提取幼嫩叶片的dna，dna的浓度和纯度用超微量分光光度计nanodrop2000检测；pcr扩增反应在96孔的biorad t100tmthe...

【专利技术属性】
技术研发人员：李冬梅，潘彦谷，刘海林，于波，
申请(专利权)人：广东省农业科学院环境园艺研究所，
类型：发明
国别省市：