一种奶山羊全基因组55K SNP芯片及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种奶山羊全基因组55K SNP芯片及其应用，该芯片共54344个SNP位点。本发明专利技术提供的奶山羊全基因组55K SNP芯片，可用于进口奶山羊和国内培育奶山羊品种的鉴定和亲缘关系分析，也可用于奶山羊全基因组关联分析、全基因组选择育种、群体遗传学分析以及性状相关候选基因和QTL位点分析定位等多个领域，在生产应用和科学研究中均具有较高的价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子生物学、功能基因组学、生物信息学、基因组育种，具体地，涉及奶山羊全基因组55k snp芯片及其应用。

技术介绍

1、snp是单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism)的缩写，指基因组单个核苷酸的变异，是由单碱基的缺失、插入、颠换或置换所形成的变异形式。snp作为遗传标记，具有数量众多、分布密集、易于检测，是较理想的基因分型目标，在复杂性状的遗传变异中发挥着重要作用。尤其在动植物遗传研究中，成为解析质量性状、经济性状以及一些复杂的疾病性状遗传变异机制的重要研究对象之一。

2、全基因组snp芯片是高通量检测snp位点信息的工具，目前主流的形式有固相芯片和液相芯片两种。snp固相芯片是将大量带有荧光标记的dna探针固定在玻璃基片上通过光蚀刻而成，其原理是通过探针dna链与检测目标基因组dna进行杂交、结合，再经染色剂染色后利用激光扫描从而对snp进行基因分型。基于靶向捕获测序的snp液相芯片是一种新兴的基因检测技术，它利用靶向捕获测序技术选择感兴趣的基因组区域，并通过snp液相芯片对这些区域进行高本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于奶山羊全基因组的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记选自表2中所示标记物中的至少一种。

2.一种分子探针，其特征在于，所述分子探针用于特异性识别权利要求1所述的SNP分子标记。

3.一种奶山羊全基因组SNP芯片，其特征在于，所述SNP芯片包括靶向权利要求1所述的SNP分子标记的探针。

4.根据权利要求3所述的奶山羊全基因组SNP芯片，其特征在于，所述分子标记与奶山羊的产奶性能、乳品质性状、乳房形态、肢蹄形态、毛色、体型、褪黑素合成能力和褪黑素昼夜变异率中的一种或多种相关联；

5.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权...

【技术特征摘要】

1.一种用于奶山羊全基因组的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记选自表2中所示标记物中的至少一种。

2.一种分子探针，其特征在于，所述分子探针用于特异性识别权利要求1所述的snp分子标记。

3.一种奶山羊全基因组snp芯片，其特征在于，所述snp芯片包括靶向权利要求1所述的snp分子标记的探针。

4.根据权利要求3所述的奶山羊全基因组snp芯片，其特征在于，所述分子标记与奶山羊的产奶性能、乳品质性状、乳房形态、肢蹄形态、毛色、体型、褪黑素合成能力和褪黑素昼夜变异率中的一种或多种相关联；

5.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求2所述的分子探针，或权利要求3或4所述的snp芯片。

6.权利要求2所述的分子...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘国世，关盛宇，阎来庆，张鲁，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：