一种双端标签序列混合测序方法及其在MGI测序平台中的应用技术

技术编号:40006886 阅读:67 留言:0更新日期:2024-01-16 14:39
本申请实施例属于测序领域,涉及一种双端标签序列混合测序方法及其在MGI测序平台中的应用,包括确定待检DNA样本的数量;根据所述待检DNA样本的数量,配置相应的标签组的数量,并将配置的每组所述标签组与所述待检DNA样本一一单独混合,获得各自对应的接头连接产物;将每组所述接头连接产物进样至已设置好工艺参数的MGI高通量测序仪中,进行测序检测分析,获得DNA的测序结果。本申请满足少量样本碱基平衡的同时,提高样本测序后的数据有效拆分率。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及测序,尤其涉及一种双端标签序列混合测序方法及其在mgi测序平台中的应用。


技术介绍

1、肿瘤分子诊断技术按照样本的来源不同,分为传统的“组织活检”和新型的“液体活检”。组织活检通常需要外科手段进行组织的获取,在获取组织的同时,可能存在出血、疼痛、感染、肿瘤播散等风险。另外,对于有些位置较为特殊或者不能耐受的患者,组织活检风险更大。相比于组织活检,液体活检最显而易见的优势就是无创,对位置要求低,可操作性强,痛苦小,能重复取样等特点,能够解决临床取样的难题,满足对患者高频检测的需求,与组织或穿刺活检比较,成本更低。

2、循环肿瘤dna(circulating tumor dna,ctdna),是一种存在于血浆或血清、脑脊液等体液中的细胞外dna,是游离dna(cell-free dna,cfdna)中的一类,占比约为0.1%-1%,主要来自于坏死或凋亡的肿瘤细胞、肿瘤细胞分泌的外排体及循环肿瘤细胞。在血液中半衰期2小时,携带有snp(点突变)、indel(插入缺失)、cnv(拷贝数)、fusion(融合基因)等突变信息,在人体血液循环系统本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种双端标签序列混合测序方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,包括:在每个通道的待测样本的数量为1时,配置4标签组或8标签组,并使用所述4标签组或所述8标签组与所述待测样本进行混合,其中,所述4标签组和所述8标签组均碱基平衡。

3.根据权利要求2所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,所述配置4标签组或8标签组,并使用所述4标签组或所述8标签组与所述待测样本进行混合的步骤包括:

4.根据权利要求1所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,包括:在每个通道的待测样本的数量为2时,配置4标...

【技术特征摘要】

1.一种双端标签序列混合测序方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,包括:在每个通道的待测样本的数量为1时,配置4标签组或8标签组,并使用所述4标签组或所述8标签组与所述待测样本进行混合,其中,所述4标签组和所述8标签组均碱基平衡。

3.根据权利要求2所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,所述配置4标签组或8标签组,并使用所述4标签组或所述8标签组与所述待测样本进行混合的步骤包括:

4.根据权利要求1所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,包括:在每个通道的待测样本的数量为2时,配置4标签组或8标签组,并使用所述4标签组或所述8标签组与所述待测样本进行混合,其中,所述4标签组和所述8标签组均碱基平衡。

5.根据权利要求4所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,所述配置4标签组或8标签组,并使用所述4标签组或所述8标签组与所述待测样本进行混合的步骤包括:

6.根据权利要求1所述的双端标签序列混合测序方法,其特征在于,包括:在每个通道的待测样本的数量为3时,配置4标签组或8标签组,并使用所述4标签组或所述8标签组与所述待测样本进行混合,其中,所述4标签组和所述...

【专利技术属性】
技术研发人员:梁志坤蒋析文方鹏羊兰桂郑春婷
申请(专利权)人:广州达安基因股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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