【技术实现步骤摘要】
用于分析生物样品的方法
[0001]本专利技术涉及一种用于分析具有多种分析物的生物样品的方法,特别是通过光学读出。
技术介绍
[0002]后生动物诸如脊椎动物或人类的器官由组织组成,而组织本身又由细胞组成。最终,这些细胞都来自同一个卵细胞,并且基本上共享相同的基因组。据估计,人类基因组包含约30,000个基因,这些基因编码大约22,000种蛋白质。令人惊讶的是,小鼠和人类中的蛋白质编码基因数量似乎大致相同,而且小鼠和人类基因组中只有大约1%的基因在其他物种中没有直系同源基因。相比之下,酵母基因组编码的蛋白质数量约为6,250种蛋白质。因此,虽然从单细胞真核生物到后生动物的基因数量明显增加,但后生动物进化枝内的复杂性增加在很大程度上并未伴随基因数量的成比例增加。
[0003]人类的复杂性似乎可归因于更复杂的基因调控以及可变剪接的使用显著增加。在后生动物进化过程中,基本构建块显然被一遍又一遍地重复使用。这对于本公开很重要,因为它表明关于小鼠或其他脊椎动物的某些细胞类型中某些基因表达的观察结果可以在很大程度上转移到人体组织 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于分析具有多种分析物的生物样品(200)的方法,包括以下步骤:确定关于所述生物样品(200)及其分析物的信息,所述分析物由多种标记物标记,基于所确定的信息生成所述生物样品(200)内所述分析物分布的概率模型(400、600),生成所述生物样品(200)的至少一个光学读出,和至少部分地基于所述生物样品(200)内所述分析物分布的概率模型(400、600)确定所述读出中至少一种分析物的存在。2.根据权利要求1所述的方法,其中关于所述样品的信息是从以下来源中的至少一种确定的:通用数据库或从所述生物样品生成的数据。3.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中关于所述样品的信息包括以下类型中的至少一种:基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、互作组学、定位组学或表观基因组学。4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中针对以下水平中的至少一种确定关于所述样品的信息:亚细胞、细胞器、细胞或组织。5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中至少在生成所述一个光学读出之前确定关于所述样品的信息。6.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述至少一个光学读出被分割以便从分割的光学读出确定关于所述样品的信息。7.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中关于所述样品的信息是从所述光学读出逐像素确定的。8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中基于从所述至少一个光学读出确定的关于所述生物样品的信息修改所述概率模型,优选地,基于从多个生成的光学读出确定的关于所述生物样品的信息迭代地修改所述概率模型。9.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中生成至少一个另外的光学读出并且所述分析物由另外的多种标记物标记以用于所述另外的光学读出。10.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中...
【专利技术属性】
技术研发人员:索伦,
申请(专利权)人:莱卡微系统CMS有限责任公司,
类型:发明
国别省市:
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