【技术实现步骤摘要】
甲状腺乳头状癌的术前诊断和/或风险评估的组合物、应用和系统
[0001]本专利技术涉及甲状腺乳头状癌的诊断和风险评估
,尤其涉及一种用于甲状腺乳头状癌的术前诊断和
/
或风险评估的组合物
、
应用和系统
。
技术介绍
[0002]甲状腺癌是内分泌系统最常见的恶性肿瘤,全球发病率以每年
3.6%
的增幅上升,成为增长速度最快的恶性肿瘤之一
。2020
年全球癌症统计数据显示
,
甲状腺癌新增病例高达
58.6
万,在全球癌症发病率中排名第9位,其中女性甲状腺癌发病率
10.1/10
万,为全球女性第5大高发癌症,占全部恶性肿瘤新发人数的
3.8%。2018
年全国肿瘤登记年报显示,我国甲状腺癌发病率为
13.17/10
万,女性发病率为
20.28/10
万,在恶性肿瘤和女性恶性肿瘤中分别是第7位和第4位,是增长速度最快的恶性肿瘤之一
。
因此,甲状腺癌逐渐成为我国公共卫生健康方面的一个亟需解决的问题
。
[0003]甲状腺癌常见的病理类型有甲状腺乳头状癌(
papillary thyroid carcinoma, PTC
)
、
甲状腺滤泡状癌(
follicular thyroid carcinoma, FTC
)
、
甲状腺髓样癌(
med ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种用于甲状腺乳头状癌的术前诊断和
/
或风险评估的组合物,其特征在于,该组合物包括用于测量
CLAUDIN
‑
16
蛋白(
NCBI Gene: 10686
)表达水平,和
/
或编码
CLAUDIN
‑
16
蛋白的基因的
mRNA
表达水平的试剂
。2.
根据权利要求1所述的组合物,其特征在于,该组合物还包括用于测量
BRAF 基因
V600E
位点的突变的试剂
。3.
根据权利要求1或2所述的组合物,其特征在于,所述用于测量蛋白表达水平的试剂包含抗体
、
寡肽
、
配体
、PNA
或适体,所述试剂可特异性结合至所述蛋白;和
/
或,所述用于测量
mRNA
表达水平的试剂包含引物
、
探针或反义核苷酸,所述试剂可特异性结合至编码所述标记物蛋白的基因的
mRNA
;测试方法包括
PCR、
基因芯片
、
二代高通量测序中的任意一种或至少两种的组合
。4.
权利要求1‑3中任意一项权利要求所述的组合物在制备用于甲状腺乳头状癌的术前诊断和
/
或风险评估的试剂中的应用
。5.
一种用于甲状腺乳头状癌的术前诊断和
/
或风险评估的系统,该系统包括:1)权利要求1‑3中任意一项权利要求所述的组合物;2)采用所述的组合物进行蛋白表达水平和
/
或编码蛋白的基因的
mRNA
表达水平测试的设备;3)计算机设备,所述计算机设备包括存储器和处理器,存储器存储甲状腺乳头状癌的术前诊断模型和
/
或风险评估模型;处理器执行通过所述的术前诊断模型和
/
或风险评估模型对甲状腺乳头状癌的原发灶和转移灶进行精准的诊断,和
/
或对甲状腺乳头状癌的疾病风险进行精准预测
。6.
根据权利要求5所述的系统,其特征在于,受试者样品是血液
、
血清或血浆
。7.
根据权利要求5所述的系统,其特征在于,蛋白表达水平的测量或比较通过使用选自以下的至少一种来进行:蛋白芯片测定
、
免疫测定
、
配体结合测定
、MALDI
‑
TOF(
基质辅助激光解吸
/
电离飞行时间质谱
)、SELDI
‑
TOF(
表面增强激光解吸
/
电离飞行时间质谱
)、
补体结合试验
、2
‑
D
电泳
、
液相色谱
‑
质谱
(LC
‑
MS)、
液相色谱
‑
质谱
/
质谱
(LC
‑
MS/MS)
;和
/
或,
mRNA
表达水平的测量通过使用反转录聚合酶链式反应
(RT
‑
PCR)、
核糖核酸酶保护测定
、RNA
印迹法
、DNA
芯片或二代高通量测序方法来进行;作为优选,编码
CLAUDIN
‑
16
蛋白的基因的
mRNA
表达水平的测量采用二代高通量测序方法,包括以下的步骤:1)将
mRNA
打断成
200nt
至
700nt
的短片段后以
mRNA
为模板,用六碱基随机引物合成第一条
eDNA
链;2)加入缓冲液
、dNTPs、RNaseH
和
DNA
聚合酶
I
合成第二条
eDNA
链;3)在经过
QiaQuickPCR
试剂盒纯化并加
EB
缓冲液洗脱之后做末端修复,加
polyA
并连接测序接头,然后采用琼脂糖凝胶电泳进行片段大小选择,最后进行
PCR
扩增建立测序文库;4)构建转录组文库,凝胶电泳进行质检后上机,进行测序得到测序序列;5)在测序后过滤掉原始数据中不合格的序列,得到有效数据用于后续分析
。8.
根据权利要求7所述的系统...
【专利技术属性】
技术研发人员:葛明华,蔡业丰,郑国湾,宋法寰,朱磊,郭雅文,段艳婷,蒋烈浩,胡逸群,马文丽,丁玲玲,梁瑞敏,华特波,
申请(专利权)人:浙江省人民医院,
类型:发明
国别省市:
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