一种用于多组学联合分析展示的方法和装置及其应用制造方法及图纸

本发明专利技术公开了一种用于多组学联合分析展示的方法和装置及其应用

【技术实现步骤摘要】
EpiGenome Browser
都需要使用浏览器进行分型展示，而如果用户上传数据量较大的数据，会产生处理速度慢和上传失败等问题
。

技术实现思路

[0007]针对上述现有技术存在的仅能在
Mac
端本地使用，或者仅能在浏览器上进行分析展示，当数据量大时存在处理速度慢或分析失败的问题，本专利技术提供一种新的用于多组学联合分析展示的方法和装置，本专利技术的方法和装置为基于
linux
服务器运行的工具，运用资源更灵活，支持多样本，大数据量处理和可视化，界面更友好，应用更广泛
。
[0008]具体来说，本专利技术涉及如下用于多组学联合分析展示的方法和装置及其应用
。
[0009]1、
一种用于多组学联合分析展示的方法，该方法包括如下步骤：
[0010]步骤
1、
获取原始下机数据；
[0011]步骤
2、
将所述原始下机数据的
Hi
‑
C
部分进行第一数据整理；将所述原始下机数据的r/>Hi
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种用于多组学联合分析展示的方法，该方法包括如下步骤：步骤
1、
获取原始下机数据；步骤
2、
将所述原始下机数据的
Hi
‑
C
部分进行第一数据整理；将所述原始下机数据的
Hi
‑
C
以外部分进行第二数据处理；其中，所述第一数据处理的步骤包括：步骤
3.1、
在服务器上，采用
Hic
‑
Pro
进行基因比对，并对比到到酶切片段，生成
vaildpairs
数据；步骤
3.2、
在服务器上，采用
juicerpre
将所述
vaildpairs
数据生成
.hic
文件；步骤
3.3、
在服务器上，用
juicer dump
读取
.hic
文件；步骤
3.4、
在服务器上，用
HiCCUPs
进行
call loop
处理
。2.
根据权利要求1所述的方法，其特征在于，
Hi
‑
C
以外部分选自
ATAC、CHIP
和
RNA
中的一种或多种
。3.
根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第二数据处理的步骤包括：步骤
4.1、
在服务器上，采用
Hic
‑
Pro
进行基因比对，并获得
bam
文件；步骤
4.2、
在服务器上，采用
deeptools
解释
bam
文件，读取信号值并绘图
。4.
根据权利要求1‑3中任一项所述的方法，其特征在于，所述服务器为
Linux。5.
根据权利要求1‑3中任一项所述的方法，其特征在于，在步骤1之后且步骤2之前，所述方法还包括：进行数据拆分；优选地，所述数据拆分的方法为
bcl2fastq。6.
一种用于多组学联合分析展示的装置，包括：数据获取单元
、
第一数据处理单元和第二数据处理单元，其中，所述数据...

【专利技术属性】
技术研发人员：佟馨宇，苑赞，刘涛，李志民，王娟，
申请(专利权)人：北京安诺优达医学检验实验室有限公司浙江安诺优达生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：