一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的核酸组合制造技术

本发明专利技术属于生物医药技术领域，更具体地，涉及一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的核酸组合

【技术实现步骤摘要】
一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的核酸组合、试剂盒及应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，更具体地，涉及一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的核酸组合
、
试剂盒及应用
。

技术介绍

[0002]尿路上皮癌是起源于尿路上皮的一种多源性的恶性肿瘤，包括肾盂癌
、
输尿管癌
、
膀胱癌以及尿道癌，是最常见的泌尿系统肿瘤
。
尿路上皮癌一般可分为非肌层浸润性和肌层浸润性
。WHO2004
新分类法将非浸润性尿路上皮癌分为三级：低度恶性潜能乳头状尿路上皮肿瘤
、
低级别和高级别尿路上皮癌
。
低度恶性潜能乳头状尿路上皮肿瘤定义为乳头状瘤，其细胞形态正常，无恶性肿瘤的细胞学特征，虽然此种尿路上皮肿瘤进展风险小，但其仍不完全属于良性病变，临床将其定义为癌前病变
。
非肌层浸润性尿路上皮癌具有手术
、BCG
灌注
、
化疗等治疗方式，5年生存率为
80
～
90
％，具有较好的预后；而发展为肌层浸润性尿路上皮癌后，肿瘤容易发生转移，5年生存率不到
40
％
。
[0003]目前，尿路上皮癌的检测方法包括影像学技术
(CT
，
MRI
，尿路造影，
B
超
)、
膀胱镜结合尿脱落细胞学和
FISH
检测等
。<br/>然而，
CT、MRI
等影像学检查对于输尿管肿瘤的检出率相对偏低，尿液脱落细胞学检测的阳性率低于
50
％，且对于进展期尿路上皮肿瘤的检出率更低，尿液
FISH
检测也受制于标本条件和肿瘤梗阻水平，输尿管镜
/
软镜镜检是有创检查且可能增加膀胱转移的风险
。
[0004]现有技术公开的一些用于尿路上皮癌的风险判定的引物或探针对尿路上皮癌患者与非尿路上皮癌受试者的检测具有良好的灵敏度和特异性，但目前尚缺乏能够用于诊断病理分期较早的尿路上皮癌的试剂盒，尤其缺乏能够用于尿路上皮癌癌前病变检测的试剂盒
。

技术实现思路

[0005]针对现有技术的缺陷，本专利技术的目的在于提供了一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的核酸组合
、
试剂盒及应用，以改善现有技术对病理分期较早的尿路上皮癌检测灵敏度低，尤其是对尿路上皮癌癌前病变的检测灵敏度低等技术问题
。
[0006]为实现上述目的，本专利技术提供了一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的核酸组合，其为用于检测样本中
MEIS1
基因和
/
或
PITX1
基因的
CpG
岛上的特定区域的甲基化水平的核酸组合
。
[0007]优选地，以
GRCh38.p14
为参考基因组，所述
MEIS1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自
Chr2:66440306
‑
66440490
正链和
/
或
Chr2:66440296
‑
66440461
负链的全长或部分区域；所述
PITX1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自
Chr5:135029763
‑
135029937
正链和
/
或
Chr5:135029758
‑
135029939
负链的全长或部分区域
。
[0008]进一步优选地，所述
MEIS1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自如
SEQ ID NO.1
和
/
或
SEQ ID NO.2
所示的核苷酸序列；所述
PITX1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自如
SEQ ID NO.3
和
/
或
SEQ ID NO.4
所示的核苷酸序列
。
[0009]优选地，所述核酸组合包括用于检测
SEQ ID NO.1
～4所示核苷酸序列中的至少一者的甲基化水平的引物对，和
/
或检测探针
。
[0010]优选地，所述核酸组合选自如下核酸组合中组中的至少一组：
[0011]第一核酸组合，包括用于检测
SEQ ID NO.1
区域内的甲基化水平的第一引物对；优选地，还包括与所述第一引物对对应的第一检测探针；
[0012]第二核酸组合，包括用于检测
SEQ ID NO.2
区域内的甲基化水平的第二引物对；优选地，还包括与所述第二引物对对应的第二检测探针；
[0013]第三核酸组合，包括用于检测
SEQ ID NO.3
区域内的甲基化水平的第三引物对；优选地，还包括与所述第三引物对对应的第三检测探针；
[0014]第四核酸组合，包括用于检测
SEQ ID NO.4
区域内的甲基化水平的第四引物对；优选地，还包括与所述第四引物对对应的第四检测探针
。
[0015]进一步优选地，所述第一引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.9
～
10
所示，所述第一检测探针的核苷酸序列如
SEQ ID NO.11
所示；所述第二引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.12
～
13
所示，所述第二检测探针的核苷酸序列如
SEQ ID NO.14
所示；所述第三引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.15
～
16
所示，所述第三检测探针的核苷酸序列如
SEQ ID NO.17
所示；所述第四引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.18
～
19
所示，所述第四检测探针的核苷酸序列如
SEQ ID NO.20
所示
。
[0016]优选地，所述检测探针的5’
端含有荧光报告基团，3’
端含有荧光淬灭基团
。
[0017]本专利技术还提供了一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的试剂盒，其包括所述核酸组合
。
[0018]优选地，还包括核酸提取试剂
、
核酸纯化试剂
、
甲基化转化试剂
、PCR
反应试剂
、
质控品
、
内参基因的检测引物对
、
内参基因的检测探针中的一种或多种
。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种用于尿路上皮癌或癌前病变检测的核酸组合，其特征在于，其为用于检测样本中
MEIS1
基因和
/
或
PITX1
基因的
CpG
岛上的特定区域的甲基化水平的核酸组合
。2.
如权利要求1所述的核酸组合，其特征在于，以
GRCh38.p14
为参考基因组，所述
MEIS1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自
Chr2:66440306
‑
66440490
正链和
/
或
Chr2:66440296
‑
66440461
负链的全长或部分区域；所述
PITX1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自
Chr5:135029763
‑
135029937
正链和
/
或
Chr5:135029758
‑
135029939
负链的全长或部分区域
。3.
如权利要求2所述的核酸组合，其特征在于，所述
MEIS1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自如
SEQ ID NO.1
和
/
或
SEQ ID NO.2
所示的核苷酸序列；所述
PITX1
基因的
CpG
岛上的特定区域选自如
SEQ ID NO.3
和
/
或
SEQ ID NO.4
所示的核苷酸序列
。4.
如权利要求3所述的核酸组合，其特征在于，所述核酸组合包括用于检测
SEQ ID NO.1
～4所示核苷酸序列中的至少一者的甲基化水平的引物对，和
/
或检测探针
。5.
如权利要求4所述的核酸组合，其特征在于，所述核酸组合选自如下核酸组合中组中的至少一组：第一核酸组合，包括用于检测
SEQ ID NO.1
区域内的甲基化水平的第一引物对；优选地，还包括与所述第一引物对对...

【专利技术属性】
技术研发人员：蔡迪，陈艾敏，万康康，董兰兰，
申请(专利权)人：武汉艾米森生命科技有限公司，
类型：发明
国别省市：