用于预测脑卒中复发的标志物及其用途制造技术

本申请提供了一种用于预测脑卒中复发的标志物及其用途

【技术实现步骤摘要】
用于预测脑卒中复发的标志物及其用途


[0001]本申请属于分子生物学领域，涉及基因检测，具体的是涉及一种用于预测脑卒中复发的标志物及其用途
。

技术介绍

[0003]DNA
甲基化是表观遗传修饰的主要机制之一，在维持正常细胞功能
、
遗传印记
、
胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，随着技术的发展，针对甲基化研究的方法几乎涵盖了单个基因到基因组各个层次水平
。
在哺乳动物细胞中，
DNA
甲基化的特征是在
DNA
甲基转移酶
(DNMT)
的作用下，胞嘧啶嘧啶环
(5
‑
甲基胞嘧啶；
5mC)
第5位碳原子上添加上甲基基团
(
‑
CH3)
，并且甲基的共价加成通常发生在
CpG
二核苷酸中的胞嘧啶中，该二核苷酸集中在称为
CpG
岛的部分中，
CpG
位点成簇的以预期频率出现
。
异常甲基化与大多数疾病有关，包括癌症
、
神经退行性疾病
、
心血管疾病和自身免疫性疾病等
。
分析
DNA
甲基化模式对于理解这些疾病的潜在分子机制至关重要
。
此外，
DNA
甲基化模式可作为临床管理的依据，如诊断
、
预后和治疗反应
。
[0004]脑卒中是重要的致死
、
致残原因，且发病人数逐年上升，发病年龄逐步年轻化
。
临床数据显示，进展性卒中
(PS)
在急性缺血性卒中患者中占比可达
26.4
％
‑
34
％，且无有效的诊疗手段，可导致更高的致残率和死亡率，为家庭及临床工作带来沉重的负担
。
对于卒中患者，如果可以及时预测患者是否复发，能有效减少卒中患者的死亡或者致残
。
目前在临床上关于卒中复发诊断主要是利用临床数据进行评估，未有明确的分子标志物
。

技术实现思路

[0005]基于现有脑卒中复发检测中存在的问题，本申请的目的在于提供一种用于预测脑卒中复发的标志物
、
组合物
、
试剂盒及其用途
。
[0006]本申请具体技术方案如下：
[0007]1.
一种用于预测脑卒中复发的甲基化标志物，其包括人类参考基因组
hg38
上的
13
号染色体的
60727176
至
60733176
位的基因组区域
。
[0008]2.
根据项1所述的甲基化标志物，其中所述甲基化标志物的靶序列如
SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、
或
SEQ ID NO:6
所示
。
[0009]3.
根据项1或2所述的甲基化标志物，其中所述脑卒中选自大动脉粥样硬化性卒中
、
心源性脑栓塞
、
小动脉闭塞性脑卒中
、
缺血性脑卒中和脑梗死中的一种或两种以上
。
[0010]4.
根据项1‑3中任一项所述的甲基化标志物，其中所述脑卒中复发为三个月之内的脑卒中复发
。
[0011]5.
项1‑4中任一项所述的甲基化标志物在制备预测脑卒中复发的试剂盒中的用途
。
[0012]6.
项1‑4中任一项所述的甲基化标志物在制备预防脑卒中复发的药物中的用途，优选地，所述药物是基于所述甲基化标志物设计的靶向药物
。
[0013]7.
一种用于预测脑卒中复发的组合物，所述组合物包括：
[0014]用于检测项1‑4中任一项所述的甲基化标志物的甲基化状态的核酸，
[0015]其中，所述甲基化标志物的甲基化状态由所述甲基化标志物的靶序列的甲基化来表征
。
[0016]8.
一种试剂盒，其包括用于检测项1‑4中任一项所述的甲基化标志物的试剂
。
[0017]9.
根据项8所述的试剂盒，其中，所述试剂盒用于检测的样本包括：细胞系
、
组织学切片
、
组织活检
/
石蜡包埋的组织
、
体液
、
粪便
、
结肠流出物
、
尿
、
血浆
、
血清
、
全血
、
分离的血细胞
、
从血液中分离的细胞，或其组合
。
[0018]10.
一种核酸，其用于靶向项1‑4中任一项所述的甲基化标志物
。
[0019]本申请具有以下有益效果：
[0020]本申请的甲基化标志物能够准确预测卒中患者复发的风险，并且可以通过对个体既往基本信息
、
流调信息
、
检测结果的系统性分析，对患者可能性复发时间点给予精准提示，进而为精准治疗和健康管理提供指导，具有重要的临床应用价值
。
[0021]本申请的其他特点和优势将由下面的具体说明和权利要求书作详细的描述
。
[0022]专利技术的效果
[0023]本申请基于大量的脑卒中样本，筛选得到本申请的用于预测脑卒中复发的甲基化标志物
。
本申请的标志物能够灵敏和特异地预测脑卒中复发，从而评估首次发生脑卒中患者的三个月内的卒中复发风险，以至于更好提前进行相应的预防和治疗
。
[0024]本申请的组合物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，降低了侵入性检测造成的危害，所述的组合物具有更高的灵敏度和准确度，能够实现实时监测
。
附图说明
[0025]图1为5折分组示意图；
[0026]图2为实施例3的标志物的5组测试集的
AUC
曲线；
[0027]图3为实施例4的标志物的5组测试集的
AUC
曲线
。
具体实施方式
[0028]下面对本申请做以详细说明
。
虽然显示了本申请的具体实施例，然而应当理解，可以以各种形式实现本申请而不应被这里阐述的实施例所限制
。
相反，提供这些实施例是为了能够更透彻地理解本申请，并且能够将本申请的范围完整的传达给本领域的技术人员
。
[0029]除非另有说明，本申请的实施将采用常规的分子生物学
(
包括重组技术
)、
微生物学
、
细胞生物学本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种用于预测脑卒中复发的甲基化标志物，其包括人类参考基因组
hg38
上的
13
号染色体的
60727176
至
60733176
位的基因组区域
。2.
根据权利要求1所述的甲基化标志物，其中所述甲基化标志物的靶序列为如
SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、
或
SEQ ID NO:6
所示的序列或者为包含
SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、
或
SEQ ID NO:6
所示的序列
。3.
根据权利要求1或2所述的甲基化标志物，其中所述脑卒中选自大动脉粥样硬化性卒中
、
心源性脑栓塞
、
小动脉闭塞性脑卒中
、
缺血性脑卒中和脑梗死中的一种或两种以上
。4.
根据权利要求1‑3中任一项所述的甲基化标志物，其中所述脑卒中复发为三个月之内的脑卒中复发
。5.
权利要求1‑4中任一项...

【专利技术属性】
技术研发人员：田继超，杨亚东，叶建伟，王小奇，彭勇飞，户秋稳，叶志海，韩晓亮，王建铭，
申请(专利权)人：博尔诚北京科技有限公司，
类型：发明
国别省市：