基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物制造技术

本发明专利技术公开基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物，相关标志物可作为甲状腺癌无病生存率预测的相关指标

【技术实现步骤摘要】
基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物


[0001]本专利技术涉及甲状腺癌预后预测
，具体涉及基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物
。

技术介绍

[0002]甲状腺癌是世界上最常见的内分泌恶性肿瘤
。
在许多国家，甲状腺癌的发病率逐年上升
。
甲状腺癌的死亡率低，但复发率高，这是困扰甲状腺癌患者的一个重要问题，也是甲状腺癌治疗的一个难点
。
因此，在甲状腺癌的预后指标中，无病生存期
(DFS)
比总生存期
(OS)
具有更大的参考价值
。
[0003]铜和其他微量金属是生命的必需品
。
金属离子的过量积累会危及生命
。
铜死亡是一种新发现的细胞死亡形式，它与其他形式的细胞死亡不同，它依赖于铜离子的积累，并导致细胞程序性死亡
。
然而，在甲状腺癌患者的血清中发现了铜离子和锌离子的含量异常，认为甲状腺癌患者的铜离子代谢紊乱可能是导致肿瘤发生的危险因素之一
。
此外，细胞程序性死亡的类型不止一种，包括坏死
、
凋亡
、
自噬和铁质死亡，各种细胞死亡往往直接相互影响
。
各种细胞死亡之间的潜在关系可能为治疗肿瘤的提供了新思路
。
[0004]目前，现有技术对于铜死亡相关基因
(CRGs)
在甲状腺癌中的作用仍不清楚；探索甲状腺癌中铜死亡相关基因的表达，建立预测甲状腺癌无病生存的预后模型，筛选相关标志物可作为甲状腺癌无病生存率预测的相关指标
。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的在于，公开基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物，相关标志物可作为甲状腺癌无病生存率预测的相关指标
。
[0006]为实现上述技术目的，达到上述技术效果，本专利技术是通过以下技术方案实现基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物，所述生物标志物至少包括以下一种或多种：
BUB1、FDX1、RPL3。
[0007]本专利技术的另一目的在于，提供基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物在甲状腺癌预后模型中的应用
。
[0008]本专利技术的另一目的在于，提供一种甲状腺癌的
CRGs
预后模型，所述预后模型的建立利用
BUB1、FDX1、RPL3
，风险分数计算如下：
[0009]风险分数＝
(0.7896)*BUB1+(
‑
0.0151)*RPL3+(
‑
0.1247)*FDX1。
[0010]本专利技术的另一目的在于，建立一种基于
CRGs
中
BUB1
与临床病理特征
Tstage
的
NOMO
模型，所述模型按照病人疾病特征赋分，并预测其无病生存期
。
[0011]本专利技术的另一目的在于，提供甲状腺癌预后检测产品，所述产品包含与独立的生物标志物
BUB1、FDX1、RPL3
进行特异性结合的抗体
、
试剂或基因芯片
。
[0012]本专利技术的有益效果：
[0013]本专利技术公开基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物，相关标志物
可作为甲状腺癌无病生存率预测的相关指标
。
[0014]本专利技术通过建立甲状腺癌的
CRGs
预后模型，验证了与铜死亡有关的三基因
(BUB1、FDX1、RPL3)
模型可以成为一个强大的甲状腺癌预后模型；
[0015]本专利技术还公开了甲状腺癌预后检测产品，所述产品包含与独立的生物标志物
BUB1、FDX1、RPL3
进行特异性结合的抗体
、
试剂或基因芯片
。
[0016]本专利技术的基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物在甲状腺癌预后模型中的应用
。
[0017]当然，实施本专利技术的任一产品并不一定需要同时达到以上所述的所有优点
。
附图说明
[0018]图1为本专利技术实施例所述两个比较中重叠的
19
个基因的维恩图；
[0019]图2为本专利技术实施例所述肿瘤组织和正常组织的差异基因热图；
[0020]图3为本专利技术实施例所述肿瘤组织和正常组织的差异基因提琴图；
[0021]图4为本专利技术实施例所述免疫组化验证图；
[0022]图5为本专利技术实施例所述
STRING
构建的
PPI
网络；
[0023]图6为本专利技术实施例所述不同基因表达之间的相关性；
[0024]图7为本专利技术实施例所述通过
GO
和
KEGG
数据库分析了基因相关通路；
[0025]图8为本专利技术实施例所述模型最佳性能和最少的独立变量图；
[0026]图9为本专利技术实施例所述
FDX1,RPL3,BUB1
表达情况与死亡患者相关性；
[0027]图
10
为本专利技术实施例所述基于铜死亡相关基因模型评分模型分组与患者预后的
Kaplan
‑
Meier
曲线图；
[0028]图
11
为本专利技术实施例所述模型预测生存时间结果图；
[0029]图
12
为本专利技术实施例所述单变量
cox
回归分析结果显示与甲状腺癌的预后明显相关；
[0030]图
13
为本专利技术实施例所述多变量
cox
回归分析
BUB1
是甲状腺癌的独立危险因素；
[0031]图
14
为本专利技术实施例所述甲状腺癌的
Nomo
图模型；
[0032]图
15
为本专利技术实施例所述甲状腺癌的
Nomo
图模型实践验证结果；
具体实施方式
[0033]为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案，下面将结合附图对实施例对本专利技术进行详细说明
。
[0034]实施例
[0035]材料和方法
[0036]数据收集
[0037]从
TCGA
数据集
(https://portal.gdc.com)
下载甲状腺癌的
RNA
表达序列
(3
级
)
谱和相应的临床信息
。
验证数据集
GTEx
数据集从
GTEx
数据门户网站
(https://www.gtexportal.org/home/datasets)
获得
。
本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物，其特征在于：所述生物标志物至少包括以下一种或多种：
BUB1、FDX1、RPL3。2.
基于铜死亡相关基因的甲状腺癌无病生存率预测标志物在甲状腺癌预后模型中的应用
。3.
一种甲状腺癌的
CRGs
预后模型，其特征在于：所述预后模型的建立利用
BUB1、FDX1、RPL3
，风险分数计算如下：风险分数＝
(0.7896)*BUB1+(
‑
0.0151)*RP...

【专利技术属性】
技术研发人员：梁楠，杜瑞，孙辉，李婧婷，李芳，张大奇，付言涛，周乐，赵诣深，付庆锋，
申请(专利权)人：吉林大学，
类型：发明
国别省市：