一种抑制胡萝卜抽薹基因及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种抑制胡萝卜抽薹基因及其应用，属于分子生物学领域，该基因的核苷酸序列如

【技术实现步骤摘要】
一种抑制胡萝卜抽薹基因及其应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学领域，特别是涉及一种抑制胡萝卜抽薹基因及其应用
。

技术介绍

[0002]胡萝卜
(Daucus carotaL.)
是一种多年生经济作物，具有广阔的应用前景
。
胡萝卜以其特有的味道被誉为“土人参”和“金笋”，其高营养
、
高品质被广泛认可
。
目前，我国胡萝卜的种植面积达到
48
万
hm2，占世界总量的
42
％，是世界上最大的胡萝卜种植国
。
抽薹开花是胡萝卜在生产中的重要的农艺性状，在气候冷凉
、
日照时间较长的地方如青海等地，胡萝卜易受到气候的影响发生先期抽薹现象
。
而先期抽薹会对肉质根的膨大产生抑制作用，从而导致肉质根木质化，会对胡萝卜的产量和品质造成巨大的影响，制约胡萝卜产业发展
。
目前对胡萝卜抽薹现象的相关报道中，认为培育耐抽薹品种是解决这难题最有效的途径之一
。
因此，挖掘与抽薹开花相关的调控位点和基因
、
培育耐抽薹品种是提高胡萝卜的品质
、
产量和降低损失的重要手段
。
[0003]近年来，全基因组关联分析
(Genome
‑
Wide Association Study,GWAS)
分析作为发掘影响农艺性状的关键基因的重要手段，并被广泛应用于多种农作物<br/>。
这种分析方法是通过将需要关注的表型和基因型数据进行关联分析，以获得与该性状有关的位点
。
运用
GWAS
分析已经定位到玉米
、
萝卜
、
白菜等作物的抽薹开花相关基因和位点，为胡萝卜先期抽薹研究打下基础
。
如在小麦种定位到与开花期相关的基因有
qFL
‑3，
qCulmL
‑3，
qPH
‑3；在玉米中鉴定到
RAP2.7
基因是开花期的关联基因；在大豆中寻找到的与花期相关基因
GmSOC1
，
Dt1
；在大白菜中找到耐抽薹显著关联5个
SNP
；在萝卜中找到
253
个抽薹开花相关的基因
。
虽然
GWAS
分析已广泛应用于农作物中，但有关胡萝卜先期抽薹研究尚未涉足
。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供一种抑制胡萝卜抽薹基因及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，本专利技术发现
gene
‑
LOC108205243
为胡萝卜抗抽薹相关重要基因，为后续挖掘耐抽薹数量性状位点和胡萝卜耐抽薹品种的选育奠定基础
。
[0005]为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
[0006]本专利技术提供一种抑制胡萝卜抽薹基因
gene
‑
LOC108205243
，其核苷酸序列如
SEQ ID NO
：1所示
。
[0007]本专利技术还提供一种检测所述抑制胡萝卜抽薹基因
gene
‑
LOC108205243
的引物对，所述引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO
：3‑4所示
。
[0008]本专利技术还提供一种所述的引物对在制备鉴别胡萝卜抽薹性状的产品中的应用
。
[0009]进一步地，所述产品包括试剂或试剂盒
。
[0010]本专利技术还提供一种所述的抑制胡萝卜抽薹基因
gene
‑
LOC108205243
在鉴别胡萝卜抽薹性状中的应用
。
[0011]本专利技术还提供一种鉴别胡萝卜抽薹性状的方法，包括以下步骤：以胡萝卜
DNA
为待
测样本，采用权利要求2所述的引物对进行
PCR
扩增，根据扩增结果鉴别胡萝卜抽薹性状
。
[0012]进一步地，若扩增结果显示扩增产物显著高表达，则胡萝卜为耐抽薹性状；若扩增结果显示扩增产物显著低表达，则胡萝卜为易抽薹性状
。
[0013]本专利技术还提供一种所述的抑制胡萝卜抽薹基因
gene
‑
LOC108205243
在胡萝卜分子育种
、
培育转基因胡萝卜或胡萝卜种质资源改良中的应用
。
[0014]本专利技术公开了以下技术效果：
[0015]本专利技术利用
240
份胡萝卜种质资源构建的群体，调查其抽薹性状，并鉴定耐抽薹优异种质，利用全基因组关联分析检测获得与抽薹时间
、
抽薹率等相关性状显著关联的
SNP
位点和候选基因，通过关联
BLUE
值共筛选出3个候选抑制抽薹基因，并对这3个基因进行
RT
‑
qPCR
验证，根据检测结果显示出
gene
‑
LOC108205243
在3个品种间的差异与性状趋势相一致，说明这个基因为胡萝卜抗抽薹相关重要基因，为后续挖掘耐抽薹数量性状位点
(Quantitative Trait Loci
，
QTL)
和胡萝卜耐抽薹品种的选育奠定基础
。
附图说明
[0016]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图
。
[0017]图1为本专利技术的技术路线图；
[0018]图2为胡萝卜质量性状统计频次分布图；
[0019]图3为胡萝卜抽薹相关性状的相关性分析；
[0020]图4为抽薹性状
BLUE
值的频率分布直方图；
[0021]图5为抽薹相关性状的聚类分析；
[0022]图6为供试胡萝卜群体结构分析；
A
：
K
值；
B
：群体结构分析；
[0023]图7为主成分分析结果；
[0024]图8为群体系统进化树；
[0025]图9为连锁不平衡分析结果；
[0026]图
10
为
2021
年抽薹相关性状的
GWAS
分析结果；
A
：抽薹时间的
GWAS
分析结果；
B
：抽薹率的
GWAS
分析结果；
C
：薹高的
GWAS
分析结果；
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种抑制胡萝卜抽薹基因
gene
‑
LOC108205243
，其特征在于，其核苷酸序列如
SEQ ID NO
：1所示
。2.
一种检测权利要求1所述抑制胡萝卜抽薹基因
gene
‑
LOC108205243
的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO
：3‑4所示
。3.
一种如权利要求2所述的引物对在制备鉴别胡萝卜抽薹性状的产品中的应用
。4.
根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述产品包括试剂或试剂盒
。5.
一种如权利要求1所述的抑制胡萝卜抽薹基因
gene
‑...

【专利技术属性】
技术研发人员：孔小平，严湘萍，刘思思，徐少南，张倩，周红伟，张生田，
申请(专利权)人：西宁市蔬菜技术服务中心，
类型：发明
国别省市：