一种基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法技术

本发明专利技术涉及药物筛选，具体涉及一种基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法，构建包含药物

【技术实现步骤摘要】
一种基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法


[0001]本专利技术涉及药物筛选，具体涉及一种基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法
。

技术介绍

[0002]药物筛选是药物研发的关键步骤之一，通过药物筛选，可以发掘无副作用的新型药物，降低药物研发成本，确保药物研发的高效性
。
[0003]寄生虫疾病会造成相当高的发病率和死亡率，例如，疟疾每年造成约
50
万人死亡；隐孢子虫病是造成儿童腹泻疾病的一个新病因，据估计仅在亚洲和非洲就造成
20
万2岁以下的儿童死亡
。
这些寄生虫疾病每年都会对数百万的家庭造成严重影响，因此抗寄生虫疾病的药物研发具有十分重大的社会意义
。
[0004]近年来，深度学习的方法得到广泛应用，能够从大规模数据中提取重要的数据特征
。
知识图谱本质上是语义网络，是一种基于图的数据结构，由节点
(Point)
和边
(Edge)
组成
。
在知识图谱中，每个节点表示现实世界中存本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法，其特征在于：包括以下步骤：
S1、
构建包含药物
、
基因
、
疾病三个节点的知识图谱；
S2、
使用知识图谱嵌入模型
KGE
学习知识图谱中实体和关系的低维表示；
S3、
结合知识图谱嵌入模型
KGE
提取出的异质信息，以及分子摩尔指纹和蛋白质描述符表示的结构信息，得到相应的药物筛选预测结果
。2.
根据权利要求1所述的基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法，其特征在于：
S1
中构建包含药物
、
基因
、
疾病三个节点的知识图谱，包括：
S11、
在
KEGG
数据库中搜集与抗寄生虫疾病相关的药物；
S12、
基于搜集到的药物，在
DrugBank
数据库和
NCBI
数据库中找到对应的基因；
S13、
基于找到的基因，在
NCBI
数据库中搜集药物对应的相关的寄生虫
ID。3.
根据权利要求2所述的基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法，其特征在于：
S1
中构建包含药物
、
基因
、
疾病三个节点的知识图谱，包括：对于无法通过基因构建与药物之间关系的寄生虫疾病，通过基因的同源基因，在
NCBI
数据库中获取基因与寄生虫之间的关系
。4.
根据权利要求2所述的基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法，其特征在于：
S2
...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵俊，岳振宇，蒋颖慧，胡航，高皖陵，
申请(专利权)人：安徽农业大学，
类型：发明
国别省市：