小麦总根长制造技术

本发明专利技术公开了小麦总根长

【技术实现步骤摘要】
小麦总根长QTL QTRL.caas
‑
4AL的分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，具体涉及小麦总根长
QTL QTRL.caas
‑
4AL
的分子标记及其应用
。

技术介绍

[0002]普通小麦
(Triticumaestivum L.)
是世界上最重要的主食作物之一
。
小麦生产很大程度上受到各种非生物胁迫的限制，因此选育在非生物胁迫下高产稳产品种是小麦育种重要目标
。
根系不仅对从土壤中获取养分和水分很重要，而且对环境胁迫的耐受性也至关重要
。
小麦根长在植株生长和发育中发挥着重要作用，直接影响根表面积，与养分和水分吸收显著相关
。
由于难以在田间条件下对根长进行评价，传统育种多侧重于地上部性状，而忽略了对根长的选择
。
[0003]小麦根系总长受微效基因控制，受环境条件显著影响
。
发掘小麦根系总长控制基因，并开发可用
KASP
标记对于小麦的高产和稳产育种具有重要意义
。KASP
标记已广泛应用于检测小麦
、
水稻和玉米等作物的
SNP
位点，可实现高通量基因分型
。
利用小麦
SNP
芯片的基因型数据进行
QTL
定位，将连锁
SNP
转化为
KASP
标记，可直接应用于分子标记辅助选择育种
。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供小麦总根长
QTL QTRL.caas
‑
4AL
的分子标记及其应用
。
[0005]第一方面，本专利技术要求保护小麦基因组上特定
SNP
位点的单核苷酸多态性作为标记物在如下任一中的应用：
[0006](A1)
鉴定或辅助鉴定小麦的总根长；
[0007](A2)
制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的产品；
[0008](A3)
比较待测小麦的总根长长短；
[0009](A4)
制备用于比较待测小麦的总根长长短的产品；
[0010](A5)
选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种；
[0011](A6)
制备用于选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种的产品；
[0012](A7)
筛选剔除总根长相对较短的小麦单株；
[0013](A8)
制备用于筛选剔除总根长相对较短的小麦单株的产品；
[0014]所述特定
SNP
位点位于小麦
4A
染色体上
SEQ ID No.4
的第
36
位，该
SNP
位点处的核苷酸为
A
或
G。
所述特定
SNP
位点对应于小麦参考基因组
Chinese Spring RefSeqv1.0
的物理位置
713523267bp(https://urgi.versailles.inra.fr/blast_iwgsc/)(
下同
)。
[0015]第二方面，本专利技术要求保护用于检测小麦基因组上特定
SNP
位点的单核苷酸多态性的物质在如下任一中的应用：
[0016](A1)
鉴定或辅助鉴定小麦的总根长；
[0017](A2)
制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的产品；
[0018](A3)
比较待测小麦的总根长长短；
[0019](A4)
制备用于比较待测小麦的总根长长短的产品；
[0020](A5)
选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种；
[0021](A6)
制备用于选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种的产品；
[0022](A7)
筛选剔除总根长相对较短的小麦单株；
[0023](A8)
制备用于筛选剔除总根长相对较短的小麦单株的产品；
[0024]所述特定
SNP
位点位于小麦
4A
染色体上
SEQ ID No.4
的第
36
位，该
SNP
位点处的核苷酸为
A
或
G。
[0025]其中，用于检测小麦基因组上所述特定
SNP
位点的单核苷酸多态性的物质可为后文第三方面中所述的
KASP
引物或后文第四方面中所述的试剂或试剂盒
。
[0026]第三方面，本专利技术要求保护用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的
KASP
引物
。
[0027]本专利技术要求保护的用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的
KASP
引物，由引物
1、
引物2和引物3组成；所述引物1为自5’
端到3’
端依次为荧光标签序列
A
和
SEQ IDNo.1
的第
22
‑
39
位的单链
DNA
；所述引物2为自5’
端到3’
端依次为荧光标签序列
B
和
SEQ ID No.2
的第
22
‑
39
位的单链
DNA
；所述引物3为核苷酸序列如序列表中
SEQID No.3
所示的单链
DNA。
[0028]其中，所述荧光标签序列
A
为荧光标签序列
FAM
，其核苷酸序列为
SEQ ID No.1
的第1‑
21
位；所述荧光标签序列
B
为荧光标签序列
HEX
，其核苷酸序列为
SEQ ID No.2
的第1‑
21
位
。
[0029]进一步地，所述引物1为核苷酸序列如
SEQ ID No.1
所示的单链
DNA
；所述引物2为核苷酸序列如
SEQ ID No.2
所示的单链
DNA。
[0030]第四方面，本专利技术要求保护用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的试剂或试剂盒
。
[0031]本专利技术所要求保护的试剂盒含有所述试剂；所述试剂含有前文第三方面中所述的
KASP
引物
。
[0032]第五方面，本专利技术要求保护一种特异性
DNA
分子
。
[0033]本专利技术所要求保护的特异性
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
小麦基因组上特定
SNP
位点的单核苷酸多态性作为标记物在如下任一中的应用：
(A1)
鉴定或辅助鉴定小麦的总根长；
(A2)
制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的产品；
(A3)
比较待测小麦的总根长长短；
(A4)
制备用于比较待测小麦的总根长长短的产品；
(A5)
选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种；
(A6)
制备用于选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种的产品；
(A7)
筛选剔除总根长相对较短的小麦单株；
(A8)
制备用于筛选剔除总根长相对较短的小麦单株的产品；所述特定
SNP
位点位于小麦
4A
染色体上
SEQ ID No.4
的第
36
位，该
SNP
位点处的核苷酸为
A
或
G。2.
用于检测小麦基因组上特定
SNP
位点的单核苷酸多态性的物质在如下任一中的应用：
(A1)
鉴定或辅助鉴定小麦的总根长；
(A2)
制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的产品；
(A3)
比较待测小麦的总根长长短；
(A4)
制备用于比较待测小麦的总根长长短的产品；
(A5)
选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种；
(A6)
制备用于选育总根长相对较长的小麦单株或株系或品系或品种的产品；
(A7)
筛选剔除总根长相对较短的小麦单株；
(A8)
制备用于筛选剔除总根长相对较短的小麦单株的产品；所述特定
SNP
位点位于小麦
4A
染色体上
SEQ ID No.4
的第
36
位，该
SNP
位点处的核苷酸为
A
或
G。3.
根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：用于检测小麦基因组上所述特定
SNP
位点的单核苷酸多态性的物质为权利要求4或5中所述的
KASP
引物或权利要求6或7所述的试剂或试剂盒
。4.
用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的
KASP
引物，由引物
1、
引物2和引物3组成；所述引物1为自5’
端到3’
端依次为荧光标签序列
A
和
SEQ ID No.1
的第
22
‑
39
位的单链
DNA
；所述引物2为自5’
端到3’
端依次为荧光标签序列
B
和
SEQ ID No.2
的第
22
‑
39
位的单链
DNA
；所述引物3为核苷酸序列如序列表中
SEQ ID No.3
所示的单链
DNA。5.
根据权利要求4所述的
KASP
引物，其特征在于：所述荧光标签序列
A
为荧光标签序列
FAM
，其核苷酸序列为
SEQ ID No.1
的第1‑
21
位；所述荧光标签序列
B
为荧光标签序列
HEX
，其核苷酸序列为
SEQ ID No.2
的第1‑
21
位；进一步地，所述引物1为核苷酸序列如
SEQ ID No.1
所示的单链
DNA
；所述引物2为核苷酸序列如
SEQ ID No.2
所示的单链
DNA。6.
用于鉴定或辅助鉴定小麦的总根长的试剂或试剂盒，其特征在于：所述试剂盒含有所述试剂；所述试剂含有权利要求4或5中所述的
KASP
引物
。7.
特异性
DNA
分子，如
SEQ ID No.4
所示
。8.
权利要求4或5所述的
KASP
...

【专利技术属性】
技术研发人员：靳义荣，刘鹏，邱晓东，王富延，王雅美，刘金栋，
申请(专利权)人：德州市农业科学研究院，
类型：发明
国别省市：