【技术实现步骤摘要】
一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗COVID
‑
19作用机制的方法
[0001]本专利技术属于生物信息学
,具体涉及一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗
COVID
‑
19
作用机制的方法
。
技术介绍
[0002]网络药理学是利用数据库技术,从分子层面对药物的作用机理进行研究
。
网络药理学能够利用分子网络
、
网络靶点等信息来发现生物体系和药物
。
在发现生物活性物质
、
机理研究和新药研发等方面,尤其在传统药物的“多成分,多靶点”的机制作用和复杂关系的研究上,为我们提供了新的思路
。
技术实现思路
[0003]本专利技术目的在于提出了一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗
COVID
‑
19
作用机制的方法,该方法能通过网络药理学方法结合多种数据库进行大数据分析,快速
、
高效的筛选出抗
COVID />‑
19本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗
COVID
‑
19
作用机制的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1
:“三药三方”成分数据库建立:以“三药三方”中各味草药中文名称及拉丁文名称为关键词,在各数据库收集数据,并获取成分信息,收集成分结构;
S2
:获取核心活性成分和筛选潜在靶点:依据
OB
和
DL
值筛选,选取“三药三方”中的共有成分为核心活性成分,使用基于加权系综相似度算法
(WES)
对核心活性成分进行靶点预测;
S3
:构建成分
‑
靶点网络图:以
Cytoscape
软件构建核心活性成分和潜在靶点之间网络图,并通过网络分析;
S4
:
GO
富集分析和
KEGG
富集分析:对靶点进行
GO
富集分析以及
KEGG
信号通路富集分析,并依据
P
值筛选进行可视化分析;
S5
:构建成分
‑
靶点
‑
通路网络图:以
Cytoscape
软件构建活性成分
、
潜在靶点和
KEGG
富集的通路之间的网络,通过网络分析通路作用;
S6
:关键靶点分子对接结果验证:选取临床上用于治疗
COVID
‑
19
的西药,在
GeneCards
数据库以“COVID
‑
19”、“SARS
‑
Cov
‑
2”和“SARS”为关键词,筛选受体蛋白,利用
PDB
数据库获得受体蛋白的三维结构,将步骤
S2
得到的核心活性成分的
mol2
格式
、
治疗
COVID
‑
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的西药分别与受体蛋白在
Autodock
中进行分子对接
。2.
根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗
COVID
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作用机制的方法,其特征在于,所述步骤
S1
所述的草药数据库为
HERB
本草组鉴数据库
、ETCM
数据库
、BATMAN
‑
TCM
数据库
、
以及中药系统药理学数据库及分析平台
TCMSP。3.
根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗
COVID
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作用机制的方法,其特征在于,所述步骤
S2
中的筛选条件分别为
OB≥30
%
、DL≥0.18。4.
根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗
COVID
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作用机制的方法,其特征在于,步骤
S4
中的
GO
富集分析仅选择
P
值<
0.0006
的条目,对
KEGG
富集分析仅选择
P
<
0.005
进行可视化分析
。5.
根据权利要求1所述的一种基于网络药理学分析“三药三方”治疗
COVID
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19<...
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