针对TP53基因R249S突变的肿瘤新抗原多肽及其应用制造技术

本发明专利技术属于肿瘤免疫治疗技术领域，具体涉及针对TP53基因R249S突变的肿瘤新抗原多肽及其应用。本发明专利技术要解决的技术问题是提供一种基于MHC

【技术实现步骤摘要】
针对TP53基因R249S突变的肿瘤新抗原多肽及其应用


[0001]本专利技术属于肿瘤免疫治疗
，具体涉及针对TP53基因R249S突变的肿瘤新抗原多肽及其应用。

技术介绍

[0002]肿瘤免疫治疗是一种新型的肿瘤治疗方法，被认为是继手术、放疗、化疗和小分子靶向治疗之后的下一代治疗手段。相较于传统治疗方法，免疫治疗注重于通过增强患者自身的免疫细胞来治疗肿瘤，而非靠药物直接杀伤肿瘤细胞。这种治疗方式具有许多优势，如治疗精准、副作用小和效果持久等。此外，机体免疫系统还具有免疫记忆的特性，因此免疫治疗可以帮助患者形成记忆型免疫，避免肿瘤的复发和转移。免疫治疗的方法之一是基于肿瘤新抗原肽的疫苗治疗。基于肿瘤新抗原肽的疫苗可提供肿瘤突变肽给MHC分子，从而诱导产生特异性和长期记忆T细胞，以对抗肿瘤，达到治疗肿瘤的目的。肿瘤抗原通常被认为是内源性抗原，与MHC I类分子结合，刺激CD8+细胞毒性反应。此外，还有一小部分较大的多肽与MHC II分子结合，专门刺激CD4 + T辅助细胞。
[0003]TP53是体细胞突变最为常见的抑癌基因，它可以编码p53蛋白质，而p53蛋白具有多种生物学功能，包括调控细胞周期、诱导细胞凋亡和抑制血管新生等。在各类肿瘤中，超过一般的肿瘤患者存在TP53基因突变。TP53基因突变可导致p53蛋白功能丧失，使细胞失去对细胞周期的调控和凋亡的诱导能力，从而促使肿瘤的发生和发展。此外，部分突变型p53蛋白还具有增强肿瘤细胞生长、侵袭和转移能力的作用。此外，TP53基因突变与患者的生存预后也存在显著相关性。携带TP53基因突变的肿瘤患者预后往往较差，如肝癌、肺癌、乳腺癌、食管癌、胰腺癌、膀胱癌、肠癌、胃癌、卵巢癌等。
[0004]鉴于TP53在多种癌症中存在较高的突变频率，使该基因可以成为肿瘤新抗原治疗的潜在靶点。在此前的研究（Hsiue et.al,Science. 2021 Mar 5;371(6533)）中，研究者针对TP53基因的R175H位点突变设计了肿瘤新抗原多肽（HMTEVVRHC，SEQ ID No.14），并发现该新抗原多肽与 HLA
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A*02:01 分子存在很强的亲和力。另一项研究（Malekzadeh et.al, J Clin Invest. 2019 Mar 1;129(3):1109
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1114.）中，研究者对R175H，Y220C，G245S，R248Q，R248W等多个体细胞突变进行了肿瘤新抗原的研究，发现部分特定的携带有突变氨基酸的多肽序列可以有效地激活患者体内的T细胞并对肿瘤进行杀伤。而TP53还有另一个高频突变TP53
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R249S，目前未见有针对该突变的有效肿瘤新抗原的报道。

技术实现思路

[0005]本专利技术要解决的技术问题是针对现有技术中的不足，提供一种基于MHC
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II类分子的针对肿瘤驱动基因TP53上R249S突变的特异性免疫治疗方案。
[0006]本专利技术解决上述技术问题的技术方案是提供针对TP53基因R249S突变的肿瘤新抗原多肽。
[0007]其中，上述肿瘤新抗原多肽的氨基酸序列为MGGMNRSPILTIITL(SEQ ID No.11)或
者SSCMGGMNRSPILTI(SEQ ID No.13)所示。或者，为上述各多肽的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加至少一个氨基酸所得的功能相同或者相似的多肽。
[0008]其中，上述的相同或相似的功能是指基于氨基酸序列为MGGMNRSPILTIITL(SEQ ID No.11) 的抗原多肽能激活的HLA分型为HLA
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DRB1*07:01且伴随有TP53的 R249S突变的患者产生特异性的针对具有TP53的R249S突变的肿瘤的T细胞；或者，基于氨基酸序列为SSCMGGMNRSPILTI(SEQ ID No.13)的抗原多肽能激活HLA分型为HLA
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DQA1*02:01/DQB1*03:01；且伴随有TP53的 R249S突变的患者产生特异性的针对具有TP53的R249S突变的肿瘤的T细胞。
[0009]本专利技术还提供了上述肿瘤新抗原多肽在制备可诱导产生特异性细胞毒性T细胞克隆的免疫活性调节剂中的应用。
[0010]本专利技术还提供了上述肿瘤新抗原多肽在制备存在TP53高频突变的肿瘤风险干预和/或治疗剂中的应用。其中，上述的TP53高频突变为R249S突变。
[0011]基于上述方案，本专利技术还进一步提供了一种DC细胞。该DC细胞为经上述的肿瘤新抗原多肽刺激而得。进一步的，上述的DC细胞中所述的刺激方式为DC细胞与肿瘤新抗原多肽进行共孵育。
[0012]其中，上述的DC细胞为成熟的DC细胞。
[0013]其中，上述的DC细胞为TP53发生 R249S突变的患者的离体DC细胞。
[0014]进一步的，上述的DC细胞为含有人类白细胞的HLA分型为HLA
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DRB1*07:01或HLA
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DQA1*02:01/DQB1*03:01的患者的离体DC细胞。
[0015]本专利技术也提供了上述肿瘤新抗原多肽和上述的DC细胞在制备伴随TP53突变的肿瘤的免疫治疗药物中的应用。
[0016]其中，上述应用中所述的伴随TP53突变的肿瘤为TP53发生R249S突变的肿瘤。
[0017]其中，上述应用中所述的肿瘤为肝癌。
[0018]其中，上述应用中所述的肿瘤为含有人类白细胞的HLA分型为HLA
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DRB1*07:01或HLA
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DQA1*02:01/DQB1*03:01的患者所患肿瘤。
[0019]此外，本专利技术也提供了抗上述肿瘤新抗原多肽的抗体。
[0020]其中，所述的抗体为多克隆抗体或单克隆抗体。
[0021]进一步的，上述的抗体还可与偶联部分形成偶联物。所述偶联部分为选自放射性核素、药物、毒素、细胞因子、酶、荧光素、载体蛋白或生物素中的至少一种。
[0022]本专利技术也提供了编码上述肿瘤新抗原多肽或上述的抗体的基因。
[0023]同时，本专利技术还提供了装载有上述的基因的载体。进一步的，所述载体为表达载体，表达载体可在质粒载体、腺病毒载体、慢病毒载体或腺相关病毒载体等常用载体中选择。当使用腺病毒载体时，一般采用复制缺陷型腺病毒载体。
[0024]本专利技术的有益效果在于：本专利技术的抗原肽能够显著激活人体特异性针对TP53突变的T细胞，以增加T细胞对TP53突变的肿瘤细胞的杀伤能力，能够制备预防和治疗TP53突变肿瘤的药物。而经本专利技术抗原肽刺激的TP53突变肿瘤患者的DC细胞，回输回患者体内后，能够激活特异性针对TP53突变肽的 T 细胞，以增加 T 细胞对存在TP53突变的癌细胞的杀伤能力。本专利技术的抗原肽弥补了个体化抗原肽在同时具有TP53
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R249S体细胞突变和HLA
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.针对肿瘤驱动基因TP53的R249S突变相关的肿瘤新抗原多肽，其特征在于：所述新抗原多肽的氨基酸序列为MGGMNRSPILTIITL(SEQ ID No.11)或者SSCMGGMNRSPILTI(SEQ ID No.13)所示；或者，为上述各多肽的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加至少一个氨基酸所得的功能相同或者相似的多肽。2.根据权利要求1所述的肿瘤新抗原多肽，其特征在于：所述的功能相同或者相似的多肽是指能激活HLA分型为HLA
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DRB1*07:01 或者HLA
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DQA1*02:01/ DQB1*03:01且伴随有TP53的 R249S突变的患者产生特异性的针对具有TP53的 R249S突变肿瘤的T细胞的多肽。3.权利要求1或2所述的肿瘤新抗原多肽在制备存在TP53高频突变的肿瘤风险干预和/或治疗剂中的应用，其特征在于：所述的TP53高频突变为R249S突变。4.权利要求1或2所述的肿瘤新抗原多肽在制备可诱导产生特异性细胞毒性T细胞克隆的免疫活性调节剂中的应用。5.一种经权利要求1或2所述的肿瘤新抗原多肽刺激而得的DC细胞，其特征在于：所述的刺激方式为DC细胞与肿瘤新抗原多肽进行共孵育。6.根据权利要求5所述的DC细胞，其特征在于：所述的DC细胞为成熟的DC细胞。7.根据权利要求5所述的DC细胞，其特征在于：所述的DC细胞为TP53发生 R249S突变的患者的离体...

【专利技术属性】
技术研发人员：许恒，舒洋，毛洧，蒿青，吴秋吉，李秋，丁振宇，杨莉，魏于全，
申请(专利权)人：成都朗谷生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：