用于预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的生物标志物及其应用。所述标志物包括以下SNP位点中的任意一个或多个的组合：SRA1基因Chr 5.140552044位点；APOA5基因Chr11.116790676位点；AIFM2基因Chr 10.70115028位点。通过检测受试者所述SNP位点中的至少一个位点的基因型，从而判断高脂血症型急性胰腺炎的易感性风险和/或复发风险，若所述SNP位点中的至少一个位点发生突变具有危险等位基因，则判断受试者为易感个体或复发高危个体；若所述SNP位点的基因型未发生突变，则判断受试者为耐受个体或复发低危个体。复发低危个体。

【技术实现步骤摘要】
用于预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的生物标志物及其应用


[0001]本专利技术属于生物标志物
，具体涉及单核苷酸多态性(SNP)标志物及其应用，更具体地，涉及用于预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的生物标志物及其应用。

技术介绍

[0002]急性胰腺炎(acute pancreatitis，AP)是消化系统常见急症，其中有10％～30％为复发性急性胰腺炎(recurrent acute pancreatitis，RAP)，高脂血症是急性胰腺炎复发的高危因素。而随着人们生活节奏的不断加快和饮食结构的变化，临床中高脂血症型急性胰腺炎(HLAP)越发普遍。在我国，高甘油三酯血症(HTG)已成为急性胰腺炎发病的第二大主要原因。高脂血症型急性胰腺炎约占全部急性胰腺炎的10％
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15％，在妊娠期急性胰腺炎中占比高达50％，常具有进展迅速、重症率高、尤其是易反复及预后差的特点，给患者的身心造成反复持续的伤害。因此，对高脂血症型急性胰腺炎患者的发生和复发情况进行准确预测将有助于积极的个体化治疗措施的开展，对患者生存质量的提高具有重大意义。
[0003]单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是指染色体基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性，在人群中的频率需>1％。SNPs是双等位基因标记，通过检测受检者SNP位点的基因型可预测个体发生某种疾病的风险。
[0004]综上，本领域亟需寻找并检测一组与高脂血症型急性胰腺炎的发生及复发频率相关的SNP位点，有助于高脂血症型急性胰腺炎患者的早日筛查、诊断，以及了解其疾病复发的风险。

技术实现思路

[0005]为解决上述技术问题，本专利技术提供了一种用于预测高脂血症型急性胰腺炎易感风险和/或复发风险的生物标志物及其应用，本专利技术标志物能够方便地运用于临床并快速有效地预测高甘油三酯血症个体发生高脂血症型急性胰腺炎的风险，以及高脂血症型急性胰腺炎患者的疾病复发风险，可针对高危患者提前采取保护措施，制定个性化的治疗方案，利于患者的治疗并提高患者的生存质量。
[0006]为解决上述问题，本专利技术首先提供了一种用于预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的生物标志物，所述标志物包括以下SNP位点中的任意一个或多个的组合：
[0007]SRA1基因的Chr 5.140552044位点；APOA5基因的Chr 11.116790676位点；AIFM2基因的Chr 10.70115028位点。
[0008]本专利技术另一方面还提供了前面所述的生物标志物在制备预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的产品中的应用。
[0009]优选地，通过检测受试者所述SNP位点中的至少一个位点的基因型，从而判断是否
为高脂血症型急性胰腺炎的易感个体；若所述SNP位点中的至少一个位点发生突变具有危险等位基因，则判断受试者为高脂血症型急性胰腺炎的易感个体，若所述SNP位点的基因型未发生突变，则判断受试者为高脂血症型急性胰腺炎的耐受个体；其中，所述受试者具有高甘油三酯血症。
[0010]优选地，通过检测受试者所述SNP位点中的至少一个位点的基因型，从而判断高脂血症型急性胰腺炎的复发风险；若所述SNP位点中的至少一个位点发生突变具有危险等位基因，则判断受试者为复发高危个体，若所述SNP位点的基因型未发生突变，则判断受试者为复发低危个体。
[0011]优选地，所述SRA1基因的Chr 5.140552044位点的危险等位基因为G；所述APOA5基因的Chr 11.116790676位点的危险等位基因为A；所述AIFM2基因的Chr 10.70115028位点的危险等位基因为T。
[0012]本专利技术另一方面还提供了一种预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括检测受试者样本中如前面所述的SNP位点的基因型的试剂。
[0013]优选地，检测试剂包括：特异性扩增包含权利要求1所述的SNP位点的核苷酸的引物。
[0014]优选地，所述引物包括以下引物组合中的至少一组：
[0015](1)用于扩增SRA1基因的Chr5.140552044位点的引物对，其序列为SEQ ID NO：1至2；
[0016](2))用于扩增APOA5基因的Chr11.116790676位点的引物对，其序列为SEQ ID NO：3至4；
[0017](3)用于扩增AIFM2基因的Chr10.70115028位点的引物对，其序列为SEQ ID NO：5至6。
[0018]优选地，采用所述引物对所述SNP位点进行扩增的PCR反应条件为：95℃3min；25
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30cycles：95℃15s，62℃15
ꢀ‑
25s，72℃30
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60s；72℃5min。
[0019]优选地，所述受试者样本包括组织样本、血液样本。
[0020]相对于现有技术，本专利技术的有益效果至少包括：
[0021](1)本专利技术发现了SRA1基因的Chr 5.140552044多态性位点、APOA5基因的Chr 11.116790676多态性位点以及AIFM2基因的Chr 10.70115028多态性位点与高脂血症型急性胰腺炎患者的复发显著相关，携带前述3个SNP位点中的至少一个SNP突变的个体具有高频率复发的风险。该SNP位点突变可用于预测高脂血症型急性胰腺炎患者的复发风险，有利于提供个性化治疗方案，改善预后，提高生存质量。
[0022](2)本专利技术发现了SRA1基因的Chr 5.140552044多态性位点、APOA5基因的Chr 11.116790676多态性位点以及AIFM2基因的Chr 10.70115028多态性位点与高甘油三酯血症患者是否为高脂血症型急性胰腺炎的易感个体显著相关，携带前述3个SNP位点中的至少一个SNP突变的个体为高脂血症型急性胰腺炎的易感个体，有利于对高危患者提前采取保护措施，提高生存质量。
具体实施方式
[0023]以下将结合实施例对本专利技术的技术方案做进一步的说明。
[0024]如前所述，鉴于现有技术的不足，本专利技术申请人经过大量研究和实验：首先本专利技术基于复发性高脂血症型急性胰腺炎(HTGRAP)和高甘油三酯血症(HTG)两组人群的发现队列和验证队列，采用全外显子测序、一代测序以及一系列生物信息学分析，最终筛选到具有显著差异分析的3个SNP位点：SRA1基因SNP位点Chr 5.140552044、APOA5基因SNP位点Chr11.116790676和AIFM2基因SNP位点Chr 10.70115028，该3个SNP位点有助于判断HTG患者是否为高脂血症型急性胰腺炎的易感个体；随后，还根据这3个SNP位点有无突变，将HTGRAP患者分为突变组及非突变组，用中位数统计HTGRAP复发频率，结果发现本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的生物标志物，其特征在于，所述标志物包括以下SNP位点中的任意一个或多个的组合：SRA1基因的Chr 5.140552044位点；APOA5基因的Chr 11.116790676位点；AIFM2基因的Chr 10.70115028位点。2.权利要求1所述的生物标志物在制备预测高脂血症型急性胰腺炎易感性风险和/或复发风险的产品中的应用。3.如权利要求2所述的应用，其特征在于，通过检测受试者所述SNP位点中的至少一个位点的基因型，从而判断是否为高脂血症型急性胰腺炎的易感个体；若所述SNP位点中的至少一个位点发生突变具有危险等位基因，则判断受试者为高脂血症型急性胰腺炎的易感个体，若所述SNP位点的基因型未发生突变，则判断受试者为高脂血症型急性胰腺炎的耐受个体；其中，所述受试者具有高甘油三酯血症。4.如权利要求2所述的应用，其特征在于，通过检测受试者所述SNP位点中的至少一个位点的基因型，从而判断高脂血症型急性胰腺炎的复发风险；若所述SNP位点中的至少一个位点发生突变具有危险等位基因，则判断受试者为复发高危个体，若所述SNP位点的基因型未发生突变，则判断受试者为复发低危个体。5.如权利要求3或4所述的应用，其特征在于，所述SRA1基因的Chr5.140552044位点的危险等位基因为G；所述APOA5基因的Chr11.116790676位点的危险等位基因为A；所述AIFM2基因的Chr10.70115028...

【专利技术属性】
技术研发人员：曾悦，黄春兰，黄则华，范俊杰，梅启享，殷诺铭，伏扬，许缤强，黄慧珍，秦文飞，肖炜，
申请(专利权)人：上海市第一人民医院，
类型：发明
国别省市：