一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物及其应用、试剂盒和用于检测胃癌的系统技术方案

本申请提出了一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物及其应用、试剂盒和用于检测胃癌的系统，涉及胃癌生物标志物应用技术领域。本申请提供的标志物为miR

【技术实现步骤摘要】
一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物及其应用、试剂盒和用于检测胃癌的系统


[0001]本申请涉及胃癌生物标志物应用
，具体而言，涉及一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物及其应用、试剂盒和用于检测胃癌的系统。

技术介绍

[0002]胃癌是起源于胃粘膜上皮的恶性肿瘤，由于饮食结构的改变、工作压力增大以及幽门螺旋菌的感染等原因，使得胃癌呈现年轻化倾向，胃癌可发生于胃的任何部位，其半数以上发生于胃窦部、胃大弯、胃小弯及前后壁均可受累。绝大多数胃癌属于腺癌，早期无明显症状，或出现上腹不适、嗳气等非特异性症状，常与胃炎、胃溃疡等胃慢性疾病症状相似，易被忽略，因此，我国胃癌的早期诊断率较低。而导致胃癌高死亡率的重要因素便是早期胃癌的确诊率低。早期胃癌的治愈率远高于中晚期，但是由于早期胃癌缺乏明显和特异的症状，绝大部分患者确诊时已经发展进入中晚期。临床研究发现，癌症从病灶开始形成到患者出现临床症状的过程平均需要数年时间；这为发现早期胃癌、提高早期胃癌的确诊率提供了一个有效的窗口期。充分利用这个窗口期，有望提高胃癌治疗效果、降低胃癌死亡率。
[0003]近年的研究显示表观遗传学在癌症的发生、发展中起着重要作用。虽然已经发现了一些肿瘤标志物，如癌胚抗原(CEA)和糖类抗原(如CA19
‑
9、CA74
‑
2等)，但对胃癌诊断的敏感度和特异度均有限，尤其发现早期胃癌和鉴别侵袭性无痛性肿瘤方面，因此寻找特异性好和敏感度高的胃癌标志物越来越受到重视。
[0004]作为表观遗传学的一种重要机制，多种癌症的miRNA调控得到了深入研究。研究数据显示：miRNA通过基因表达调控与炎症、血管生成、细胞侵袭、细胞增殖等生物学机制相关；miRNA的变化发生在肿瘤形成的早期，并贯穿癌症的发生和发展过程；但是目前缺乏针对胃癌miRNA的检测技术、方法和产品。因此，当前对用于胃癌检测的敏感性高和特异性高的miRNA标记物存在需求。

技术实现思路

[0005]本申请的目的在于提供一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物，这些标志物作为肿瘤抑制因子或致癌基因，具有癌症诊断和治疗检测标志物的潜能，同时它们具有明显的组织特异性，能够明确追溯到发生部位，作为胃癌诊断相关的标志物。
[0006]在本申请的另一目的在于提供与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物在制备诊断胃癌试剂盒中的应用。由于上述标志物具有高的灵敏性和特异性，将其运用于制备诊断胃癌试剂盒中也能够具有更好的诊断判定效果。
[0007]本申请的另一目的在于提供一种试剂盒，其中包括检测上述miRNA标志物表达水平的试剂，能够通过非侵入的方式进行检测上述miRNA标志物的表达水平，适用于大规模无症状人群的早期筛选和预后检测。
[0008]本申请的另一目的在于提供一种用于检测胃癌的系统，上述系统能够利用生物信
息学方法和机器学习方法，通过分析胃癌血清样本的miRNA表达数据，并利用该miRNA组学数据构建了一套基于miRNA表达数据的早期胃癌判别模型，系统中所采用的miRNA标志物均代表血清中游离肿瘤miRNA的检测信号值，对于分类早期胃癌具有更高的准确性。
[0009]本申请解决其技术问题是采用以下技术方案来实现的。
[0010]一方面，本申请实施例提供一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物，上述标志物为miR
‑
5100、miR
‑
6511b
‑
5p、miR
‑
4787
‑
3p和miR
‑
1343
‑
3p中的一种或任意几种。
[0011]其中，miRNA是一类非编码小RNA，其成熟体的长度约22nt。miRNA主要在转录后通过调节基因表达行使其功能。许多研究已发现miRNA参与到各种癌症的发病和进展过程中，包含细胞内的miRNA和血液中的游离状miRNA。它们作为肿瘤抑制因子或致癌基因，具有癌症诊断和治疗检测标志物的潜能。miRNA具有明显的时空特异性，利用血液中游离miRNA的表达水平可用于癌症的早期检测，同时根据miRNA的组织特异性可追溯到癌症的原发部位。4个miRNA的AUC值分别为miR
‑
6511b
‑
5p，AUC＝0.960；miR
‑
5100，AUC＝0.989；miR
‑
4787
‑
3p，AUC＝0.943；miR
‑
1343
‑
3p，AUC＝0.988，均表现出优秀的诊断能力。其中同时使用4个miRNA诊断模型的具有最优的诊断能力，AUC＝0.998。
[0012]另一方面，本申请实施例提供一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物在制备诊断胃癌试剂盒中的应用。由于上述标志物具有高的灵敏性和特异性，将其运用于制备诊断胃癌试剂盒中也能够具有更好的诊断判定效果。
[0013]另一方面，本申请实施例提供一种试剂盒，其中包括检测上述miRNA标志物表达水平的试剂，能够通过非侵入的方式进行检测上述miRNA标志物的表达水平，适用于大规模无症状人群的早期筛选和预后检测。
[0014]另一方面，本申请实施例提供一种用于检测胃癌的系统，上述系统包括：样品采集模块，用于采集受试者的样品；数据采集模块，用于获取上述样品的miR
‑
5100、miR
‑
6511b
‑
5p、miR
‑
4787
‑
3p和miR
‑
1343
‑
3p的浓度信号值；计算患胃癌概率的模块，用于根据上述样品的标志物表达水平计算受试者患胃癌的概率。
[0015]上述系统能够利用生物信息学方法和机器学习方法，通过分析胃癌血清样本的miRNA表达数据，并利用该miRNA组学数据构建了一套基于miRNA表达数据的早期胃癌判别模型，系统中所采用的miRNA标志物均代表血清中游离肿瘤miRNA的检测信号值，对于分类早期胃癌具有更高的准确性。
[0016]相对于现有技术，本申请的实施例至少具有如下优点或有益效果：
[0017]1、鉴于目前临床面临的巨大需求以及现有技术存在的问题，本申请利用生物信息学方法和机器学习方法，通过分析胃癌血清样本的miRNA表达数据，寻找到了一组与早期胃癌相关的miRNA组合物，每个标志物与胃癌的关联性都在94％以上，能够作为高灵敏性和特异性的生物标志物。
[0018]2、本申请利用该miRNA组学数据构建了一套基于血清miRNA表达数据的早期胃癌判别模型。本申请的标志物包含多个miRNA标志物，作为试剂盒检测指标，可以通过非侵入性的方式进行检测，降低了侵入性检测造成的危害，适用于大规模无症状人群的早期筛选和预后检测。
[0019]3、本申请提供的系统是基于胃癌血清miRNA数据建立的，系统中所采用的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与胃癌辅助诊断相关的miRNA标志物，其特征在于，所述标志物为miR
‑
5100、miR
‑
6511b
‑
5p、miR
‑
4787
‑
3p和miR
‑
1343
‑
3p中的一种或任意几种。2.根据权利要求1所述的标志物在制备诊断胃癌试剂盒中的应用。3.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括检测如权利要求1所述的任意一种标志物表达水平的试剂。4.一种用于检测胃癌的系统，其特征在于，所述系统包括：样品采集模块，用于采集受试者的样品；数据采集模块，用于获取所述样品的如权利要求1所述的标志物的浓度信号值；计算患胃癌概率的模块，用于根据所述样品的标志物表达水平计算受试者患胃癌的概率。5...

【专利技术属性】
技术研发人员：高国生，王涛，郝少东，李彦谕，蔡挺，
申请(专利权)人：宁波市第二医院，
类型：发明
国别省市：