信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品制造方法及图纸

技术编号:39146137 阅读:9 留言:0更新日期:2023-10-23 14:56
本申请公开了一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品,该方法包括:获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,其中,每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值;针对每组第一电信号集,对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集;基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集。以提升对纳米孔测序所采集的信号的后续处理的精确性。后续处理的精确性。后续处理的精确性。

【技术实现步骤摘要】
信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品


[0001]本申请涉及数据处理
,具体涉及一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品。

技术介绍

[0002]跨膜孔,也称为纳米孔,其作为用于聚合物和各种小分子的直接的、电生物传感器,具有很大的潜力。特别是,利用纳米孔测序采集的信号进行后续测序研究是目前研究的热点话题。
[0003]目前在利用纳米孔测序所采集的信号进行后续处理时,存在后续处理精确性低的问题。

技术实现思路

[0004]本申请实施例的目的是提供一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品,以提升对纳米孔测序所采集的信号的后续处理的精确性。
[0005]本申请的技术方案如下:第一方面,提供了一种信号处理方法,该方法包括:获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,其中,每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值;针对每组第一电信号集,对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集;基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集。
[0006]第二方面,提供了一种信号处理装置,该装置包括:获取模块,用于获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,其中,每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值;信号增强模块,用于针对每组第一电信号集,对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集;确定模块,用于基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集。r/>[0007]第三方面,本申请实施例提供了一种电子设备,该电子设备包括处理器、存储器及存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的程序或指令,所述程序或指令被所述处理器执行时实现本申请实施例任一所述的信号处理方法的步骤。
[0008]第四方面,本申请实施例提供了一种可读存储介质,所述可读存储介质上存储程序或指令,所述程序或指令被处理器执行时实现本申请实施例任一所述的信号处理方法的步骤。
[0009]第五方面,本申请实施例提供了一种计算机程序产品,所述计算机程序产品中的
指令由电子设备的处理器执行时,使得所述电子设备能够执行本申请实施例任一所述的信号处理方法的步骤。
[0010]本申请的实施例提供的技术方案至少带来以下有益效果:在本申请实施例中,通过获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,然后针对每组第一电信号集,对第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集,如此对纳米孔测序采集的第一电信号集进行信号增强,可减少第一电信号集中信号值的噪声,然后基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集,如此可基于去除噪声后的目标电信号集进行后续的电信号处理,而非是仅利用纳米孔测序采集的电信号集进行后续的电信号处理,提升后续电信号处理的精确性。
[0011]应当理解的是,以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的,并不能限制本申请。
附图说明
[0012]此处的附图被并入说明书中并构成本说明书的一部分,示出了符合本申请的实施例,并与说明书一起用于解释本申请的原理,并不构成对本申请的不当限定。
[0013]图1是本申请第一方面实施例提供的一种信号处理方法的流程示意图;图2是本申请第一方面实施例涉及的第一电信号集的示意图;图3是本申请第一方面实施例涉及的对第一电信号集进行带通滤波后所得到的第二电信号集的示意图;图4是本申请第一方面实施例涉及的对第一电信号集进行低通滤波后所得到的第二电信号集的示意图;图5是本申请第一方面实施例涉及的采用插值方式对第一目标电信号集进行上采样和下采样后所得到的第二电信号集的示意图;图6是本申请第一方面实施例涉及的采用自编码

解码器方式对第一目标电信号集进行上采样和下采样后所得到的第二电信号集的示意图;图7是本申请第一方面实施例涉及的对第一电信号集中的电信号值进行差值计算后所得到的第二电信号集的示意图;图8是本申请第一方面实施例涉及的对第一电信号集中的电信号值进行滤波后的电信号值进行差值计算后所得到的第二电信号集的示意图;图9是本申请第一方面实施例提供的一种信号处理方法的流程示意图;图10是本申请第二方面实施例提供的一种信号处理装置的结构示意图;图11是本申请第三方面实施例提供的一种电子设备的结构示意图。
具体实施方式
[0014]为了使本领域普通人员更好地理解本申请的技术方案,下面将结合附图,对本申请实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。应理解,此处所描述的具体实施例仅意在解释本申请,而不是限定本申请。对于本领域技术人员来说,本申请可以在不需要这些具体细节中的一些细节的情况下实施。下面对实施例的描述仅仅是为了通过示出本申请的示例来
提供对本申请更好的理解。
[0015]需要说明的是,本申请的说明书和权利要求书及上述附图中的术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象,而不必用于描述特定的顺序或先后次序。应该理解这样使用的数据在适当情况下可以互换,以便这里描述的本申请的实施例能够以除了在这里图示或描述的那些以外的顺序实施。以下示例性实施例中所描述的实施方式并不代表与本申请相一致的所有实施方式。相反,它们仅是与如所附权利要求书中所详述的、本申请的一些方面相一致的例子。
[0016]在介绍本申请实施例提供的技术方案之前,首先介绍一下本申请实施例的
技术介绍
:目前在利用纳米孔测序所采集的信号进行后续处理时,存在后续处理精确性低的问题,例如利用纳米孔信号对应的纳米孔碱基解读模型basecall模型对纳米孔信号进行解读时,输入至basecall模型的信号是基于某一特定的测序方式采集的信号,即不论测序方式如何更改,对碱基进行解读时利用的信号均为该特定测序方式所采集的信号,但是不同的测序方式其对应的信号是会有所变化的,例如可以是测序时电压值的变化或电流值的变化等会造成采集的信号有所变化,此时若还是利用上述特定测序方式所采集的信号输入至basecall模型中进行碱基解读,则解读精度会有影响。
[0017]为了解决上述问题,本申请实施例提供了一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品,通过获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,然后针对每组第一电信号集,对第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集,如此对纳米孔测序采集的第一电信号集进行信号增强,然后基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集,如此可基于目标电信号集进行后续的信号处理,而非是仅利用纳米孔测序采集的原始信号集进行后续的信号处理,提升后续信号处理的精确性。
[0018]下面结合附图,通过具体的实施例及其应用场景对本申请实施例提供的信号处理方法进行详细地说明。
[0019]图1是本申请实施例所提供的一种信号处理方法的流程示意图,如图1所示,本申请实施例提供的信号处理方法可以包括步骤110

...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种信号处理方法,其特征在于,所述方法包括:获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,其中,每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值;针对每组第一电信号集,对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集;基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集,包括:针对每组第一电信号集,将所述第一电信号集,以及经过至少一种信号增强方式对所述第一电信号集增强后得到的第二电信号集拼接成二维信号组,得到目标电信号集。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集,包括:将所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值由时域信号转换为频域信号;滤除所述频域信号中频率不在预设频域范围内的频域信号,得到目标频域信号;将所述目标频域信号转换为时域信号,得到第二电信号集。4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集,包括:对所述第一电信号集中的第一目标电信号集进行下采样,得到第三电信号集,其中,所述第一目标电信号集为所述第一电信号集中的部分或全部电信号集;对所述第三电信号集进行上采样,得到第四电信号集;基于所述第四电信号集,得到第二电信号集。5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述第一电信号集中每个时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集,包括:计算所述第一电信号集中每相邻两个采集时刻中后一采集时刻的电信号值与前一采集时刻的电信号值的差值;基于所述差值,得到第二电信号集。6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述第一电信号集中每个时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集,包括:将所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值由时域信号转换为频域信号;滤除所述频域信号中频率不在预设频域范围内的频域信号,得到目标频域信号;将...

【专利技术属性】
技术研发人员:李锐郝俊龙卓远魏强王聪
申请(专利权)人:成都齐碳科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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