预测鼻咽癌患者预后、化疗获益程度的生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了预测鼻咽癌患者预后、化疗获益程度的生物标志物及其应用。本发明专利技术发现了一群尚未在肿瘤免疫微环境中报道的全新B细胞亚群CD19

【技术实现步骤摘要】
预测鼻咽癌患者预后、化疗获益程度的生物标志物及其应用


[0001]本专利技术属于生物医药领域，具体涉及一种预测鼻咽癌患者预后、化疗获益程度的生物标志物及其应用。

技术介绍

[0002]鼻咽癌是一种特殊的头颈部肿瘤。与其他以手术为主的头颈部肿瘤不同，鼻咽癌的主要治疗模式为放疗加化疗的综合治疗。2019年，马骏教授发表于《新英格兰》杂志的一项三期随机对照临床试验，确立了吉西他滨加顺铂序贯同期放化疗系鼻咽癌患者的标准治疗方案。然而，目前尚缺乏有效的分子标志物预测鼻咽癌患者吉西他滨联合顺铂化疗的获益情况。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的在于提供一种可以有效预测鼻咽癌患者预后、化疗获益程度的标志物CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞。
[0004]本专利技术所采取的技术方案是：
[0005]本专利技术的第一方面，提供CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞在制备产品中的应用，所述产品的功能为以下至少一种；
[0006](a1)预测鼻咽癌患者预后；
[0007](a2)预测鼻咽癌患者化疗获益程度；
[0008](a3)预测鼻咽癌患者总生存期；
[0009](a4)预测鼻咽癌患者无病存活期。
[0010]本专利技术的第二方面，提供标志物组合在制备产品中的应用，所述产品的功能为以下至少一种；
[0011](a1)预测鼻咽癌患者预后；
[0012](a2)预测鼻咽癌患者化疗获益程度；
[0013](a3)预测鼻咽癌患者总生存期；
[0014](a4)预测鼻咽癌患者无病存活期；
[0015]所述标志物组合包括MS4A1、ICOSL、CD27、IgD、IgM、CD69、ZFP36L2、CREM、CXCR4、ATP1B3、NR4A2、RGS2、SAT1、EZR、ZNF331、PPP1R14B、GPR183、LY9、YPEL5、JUND和SKIL。
[0016]本专利技术的第三方面，提供定量检测CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞和/或本专利技术第二方面所述标志物组合的试剂在制备产品中的应用，所述产品的功能为以下至少一种；
[0017](a1)预测鼻咽癌患者预后；
[0018](a2)预测鼻咽癌患者化疗获益程度；
[0019](a3)预测鼻咽癌患者总生存期；
[0020](a4)预测鼻咽癌患者无病存活期。
[0021]优选地，所述定量检测为检测待测样品中的CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞比例。
[0022]优选地，所述CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞比例高和/或标志物组合高表达，则鼻咽癌患者预后和/或化疗获益程度和/或总生存期和/或无病存活率越佳，反之，则越差。
[0023]优选地，所述化疗药物包括吉西他滨和/或顺铂。
[0024]优选地，所述试剂包括通过流式细胞术、单细胞测序和免疫荧光染色中的至少一种检测CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞的试剂。
[0025]优选地，所述试剂包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术和免疫测定中的至少一种方法检测标志物组合表达水平的试剂。
[0026]优选地，所述试剂包括抗体、引物、探针中的至少一种。
[0027]优选地，所述产品包括试剂、试剂盒、试纸、芯片中的至少一种。
[0028]优选地，所述样品包括外周血和/或组织。
[0029]本专利技术的第四方面，提供一种系统，包括：
[0030]获取模块：用于检测鼻咽癌患者样本中CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞比例和/或本专利技术第二方面所述的标志物组合；
[0031]分析模块：用于获取上述检测结果，根据检测结果预测鼻咽癌患者预后和/或化疗获益程度和/或总生存期和/或无病存活率。
[0032]优选地，若样本中CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞比例高和/或本专利技术第二方面所述标志物组合高表达，则鼻咽癌患者的预后、化疗获益程度、总生存期、无病存活期较佳；若CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞比例低和/或本专利技术第二方面所述标志物组合低表达，则鼻咽癌患者的预后和/或化疗获益程度和/或总生存期和/或无病存活期较差。
[0033]优选地，所述CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞比例是指CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞占肿瘤浸润B细胞的比例；以中位数为cut off值，将样本划分为比例高组和比例低组。
[0034]其中本专利技术第二方面所述标志物组合通过单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)计算获得相应评分；以中位数为cut off值，将样本划分为高表达组和低表达组。
[0035]本专利技术的第五方面，提供一种计算机可读存储介质，其存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时，可实现如本专利技术第三方面所述的系统的功能。
[0036]本专利技术的有益效果是：
[0037]本专利技术发现了一群尚未在肿瘤免疫微环境中报道的全新B细胞亚群
‑
CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞，发现该细胞亚群与吉西他滨联合顺铂诱导化疗以及肿瘤预后密切相关，可以作为预测鼻咽癌的吉西他滨联合顺铂化疗获益程度和预后的生物标志物，还通过单细胞生物信息学算法计算出该群细胞的特异性基因表达标签，通过检测CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞比例或特异性基因表达标签可以预测鼻咽癌患者的预后、化疗获益程度、总生存期、无病存活期情况；可大幅提高鼻咽癌患者化疗的疗效预测精度。
附图说明
[0038]图1为吉西他滨联合顺铂诱导化疗对鼻咽癌患者肿瘤免疫微环境的影响；图1a为基于10x 本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞在制备产品中的应用，所述产品的功能为以下至少一种；(a1)预测鼻咽癌患者预后；(a2)预测鼻咽癌患者化疗获益程度；(a3)预测鼻咽癌患者总生存期；(a4)预测鼻咽癌患者无病存活期。2.标志物组合在制备产品中的应用，所述产品的功能为以下至少一种；(a1)预测鼻咽癌患者预后；(a2)预测鼻咽癌患者化疗获益程度；(a3)预测鼻咽癌患者总生存期；(a4)预测鼻咽癌患者无病存活期；所述标志物组合包括MS4A1、ICOSL、CD27、IgD、IgM、CD69、ZFP36L2、CREM、CXCR4、ATP1B3、NR4A2、RGS2、SAT1、EZR、ZNF331、PPP1R14B、GPR183、LY9、YPEL5、JUND和SKIL。3.检测CD19
+
CD27
+
IgD
+
IgM
+
B细胞和/或权利要求2所述标志物组合的试剂在制备产品中的应用，所述产品的功能为以下至少一种；(a1)预测鼻咽癌患者预后；(a2)预测鼻咽癌患者化疗获益程度；(a3)预测鼻咽癌癌患者总生存期；(a4)预测鼻咽癌癌患者无病存活期。4.根据权利要求1～3任一项所述的应用，其特征在于，所述化疗药物包括吉西他滨和/或顺铂。5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述检测的样本包括外周血和/或组织。6.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂包括：通过流式细胞术、单细胞测序、免疫荧光染色中的至少一种检测CD19
+<...

【专利技术属性】
技术研发人员：马骏，吕佳蔚，孙颖，邝栋明，柳娜，魏瑗，陈雨沛，周冠群，梁晓雨，
申请(专利权)人：中山大学肿瘤防治中心中山大学附属肿瘤医院，中山大学肿瘤研究所，
类型：发明
国别省市：