用于检测尿路上皮癌的标志物、试剂盒和装置制造方法及图纸

技术编号:38994019 阅读:13 留言:0更新日期:2023-10-07 10:25
本发明专利技术涉及用于检测尿路上皮癌的标志物,包括ZNF551和/或CYTH2基因的CpG岛。本发明专利技术公开的用于检测尿路上皮癌的标志物,包括ZNF551和/或CYTH2基因的CpG岛,根据检测样本目标基因的CpG岛的甲基化水平,区分尿路上皮癌症样本和健康样本,在实现无创检测的同时,提高尿路上皮癌检测的灵敏度和特异性。路上皮癌检测的灵敏度和特异性。路上皮癌检测的灵敏度和特异性。

【技术实现步骤摘要】
用于检测尿路上皮癌的标志物、试剂盒和装置
[0001]本申请是申请日为2021年12月23日、申请号为202111588302.1、专利技术名称为“用于检测尿路上皮癌的标志物、试剂盒和装置”的专利技术专利申请的分案申请。


[0002]本专利技术涉及癌症领域,具体而言,涉及一种用于检测尿路上皮癌的标志物、试剂盒和装置。

技术介绍

[0003]尿路上皮癌是一种源于肾、输尿管、膀胱和尿道尿路内衬上皮的肿瘤,主要包括上尿路尿路上皮癌(输尿管癌和肾盂癌)和膀胱癌,其中前者的发病率占5%

10%,后者的发病率占90%

95%。膀胱癌的发病率为死亡率的3倍,是治愈率较高的癌症,约70%的患者经尿道电切术后复发,早期发现膀胱癌可以增加手术保留膀胱的机会,并提高患者总体生存率,早发现和早诊断是提高膀胱癌治愈率的关键。
[0004]目前针对膀胱癌的检测和诊断已开发出多种方法,膀胱镜组织活检是膀胱癌诊断的金标准,但由于是侵入性的有创检测,患者接受程度较低。
[0005]针对尿液或膀胱冲洗标本的尿细胞学检查是膀胱癌诊断和术后随诊的主要方法之一,尿脱落细胞学检查敏感度约为13%

75%,特异度约为85%

100%。
[0006]由于尿液细胞学的敏感度低,目前研究出多种尿液膀胱肿瘤标志物检查技术,美国FDA批准的膀胱癌尿液标志物检测方法包括核基质蛋白22(NMP22)、膀胱肿瘤抗原(BTA)、免疫

细胞检查(ImmunoCyt)、纤维蛋白原降解产物(FB/FDP)和荧光原位杂交(FISH)等。其他包括:端粒酶、存活素、微卫星分析、细胞角蛋白检查等,上述肿瘤标志物在检测膀胱癌的临床研究中显示了较高的敏感度,但是特异度均低于尿细胞学检查。
[0007]因此,同时保证无创检测膀胱癌的灵敏度和高特异性是膀胱癌检测的难点。

技术实现思路

[0008]为了解决上述问题,本专利技术的第一目的在于提供一种用于检测尿路上皮癌的标志物,包括NBR1、ZNF551、CYTH2和ARL5C至少一个基因的CpG岛,以解决现有无创膀胱癌检测方法灵敏度低或者特异性低的问题。
[0009]本专利技术的一种实现方式中,以GRCh38.p13为参考基因组,NBR1基因的CpG岛包括Chr17:43211709

43212254区域的序列,ZNF551基因的CpG岛包括Chr19:57708822

57709149区域的序列,CYTH2基因的CpG岛包括Chr19:48480306

48480918区域的序列,ARL5C基因的CpG岛包括Chr17:39165230

39165846区域的序列。
[0010]本专利技术的一种实现方式中,NBR1基因的CpG岛包括Chr17:43211712

43211925区域的正链、Chr17:43212002

43212173区域的正链、Chr17:43212230

43212079区域的负链和Chr17:43212042

43211875区域的负链序列;
[0011]ZNF551基因的CpG岛包括Chr19:57708924

57709057区域的正链和Chr19:
57709100

57708959区域的负链序列;
[0012]CYTH2基因的CpG岛包括Chr19:48480372

48480527区域的正链、Chr19:48480517

48480664区域的正链、Chr19:48480899

48480743区域的负链和Chr19:48480624

48480446区域的负链序列;
[0013]ARL5C基因的CpG岛包括Chr17:39165294

39165443区域的正链、Chr17:39165465

39165635区域的正链、Chr17:39165768

39165591区域的负链和Chr17:39165534

39165295区域的负链序列。
[0014]本专利技术的第二目的在于提供用于检测上述标志物甲基化水平的试剂在制备用于检测尿路上皮癌的试剂盒中的用途。
[0015]本专利技术的第三目的在于提供一种用于检测尿路上皮癌的试剂盒,包括用于检测上述标志物甲基化水平的试剂。
[0016]本专利技术的一种实现方式中,试剂包括用于检测标志物甲基化水平的引物对和探针中的至少一种。
[0017]本专利技术的一种实现方式中,引物对包括用于扩增NBR1基因CpG岛的SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2,SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5,SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8,SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11,用于扩增ZNF551基因CpG岛的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14,SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.17,用于扩增CYTH2基因CpG岛的SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20,SEQ ID NO.22和SEQ ID NO.23,SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26,SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29,以及用于分别扩增ARL5C基因CpG岛的SEQ ID NO.31和SEQ ID NO.32,SEQ ID NO.34和SEQ ID NO.35,SEQ ID NO.37和SEQ ID NO.38,SEQ ID NO.40和SEQ ID NO.41中的至少一组序列。
[0018]本专利技术的一种实现方式中,探针包括用于检测NBR1基因CpG岛的SEQ ID NO.3,SEQ ID NO.6,SEQ ID NO.9,SEQ ID NO.12,用于检测ZNF551基因CpG岛的SEQ ID NO.15,SEQ ID NO.18,用于检测CYTH2基因CpG岛的SEQ ID NO.21,SEQ ID NO.24,SEQ ID NO.27,SEQ ID NO.30,以及用于检测ARL5C基因CpG岛的SEQ ID NO.33,SEQ ID NO.36,SEQ ID NO.39,SEQ ID NO.42中的至少一条序列。
[0019]本专利技术的一种实现方式中,试剂盒还包括核酸提取试剂、核酸转化试剂、PCR反应试剂、阳性对照样本和阴性对照样本中的至少一种。
[0020]本专利技术的一种实现方式中,尿路上皮癌包括肾盂癌、输尿管癌和膀胱癌中的至少一种。
[0021]本专利技术的第四目的在于提供一种用于检测尿路上皮癌的装置,包括:
[0022]甲基化信息获取模块:用于获取待测样本中NBR1、ZN本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于检测目标基因甲基化水平的试剂在制备用于检测尿路上皮癌的试剂盒中的用途,所述目标基因包括CYTH2基因和/或ZNF551基因。2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于,所述目标基因还包括ARL5C基因。3.根据权利要求1或2所述的用途,其特征在于,所述试剂包括用于检测所述目标基因甲基化水平的引物对和探针中的至少一种。4.根据权利要求3所述的用途,其特征在于,所述引物对包括用于扩增CYTH2基因CpG岛和/或扩增ZNF551基因CpG岛的引物对;所述扩增CYTH2基因CpG岛的引物对选自SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.22和SEQ ID NO.23、SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29中的至少一组;所述扩增ZNF551基因CpG岛的引物对选自SEQ ID NO.13和SEQ IDNO.14、SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.17中至少一组。5.根据权利要求4所述的用途,其特征在于,所述探针包括用于检测CYTH2基因CpG岛和/或用于ZNF551基因CpG岛的探针,其中,所述检测CYTH2基因CpG岛的探针选自SEQ ID NO.21、SEQ IDNO.24、SEQ ID NO.27、SEQ ID NO.30所示的至少一种;所述检测ZNF551基因CpG岛的探针选自SEQ ID NO.15,SEQ ID NO.18所示的至少一种。6.根据权利要求4
...

【专利技术属性】
技术研发人员:蔡迪陶祥郭洪
申请(专利权)人:武汉艾米森生命科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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