一种子宫内膜良恶性病变的生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种子宫内膜良恶性病变的生物标志物及其应用，所述生物标志物至少包括GYPC基因至少一个靶区域内甲基化的核酸序列。将上述所述的子宫内膜良恶性病变的生物标志物应用在制备子宫内膜癌诊断产品中。本发明专利技术筛选出GYPC基因为检测目标基因（靶基因），确定了各基因中最佳的甲基化区域，能够相互联合可用于子宫内膜癌的早期检测。由于子宫内膜癌种类多样，选择多基因甲基化区域联合检测，形成功能互补，显著提高对子宫内膜癌的诊断性能。该检测对子宫内膜癌及非典型增生的检出具有临床价值。床价值。床价值。

【技术实现步骤摘要】
一种子宫内膜良恶性病变的生物标志物及其应用


[0001]本专利技术涉及医学检测
，尤其涉及一种子宫内膜良恶性病变的生物标志物及其应用。

技术介绍

[0002]子宫内膜癌（EC，Endometrial carcinoma）在全世界是多见的妇科癌症，在女性生殖系统癌症中发病率居第三，排在宫颈癌和卵巢癌之后。目前子宫内膜癌患病人数逐年增加，发病年龄在趋于年轻化，病死率居高不下。全球每年约有 14.2 万例妇女患子宫内膜癌, 4.2 万人死于该疾病。按照组织病理学特点与发病原因将子宫内膜癌分为Ⅰ型和Ⅱ型。Ⅰ型占子宫内膜癌患病总数的80%以上，多由增生期的内膜组织发展而来，属于激素依赖型，预后较好。Ⅱ型多是由处于分泌期的内膜组织发展而来，属于非激素依赖型，预后较差。子宫内膜非典型增生指的是子宫内膜的腺细胞，目前正处于从单纯性增生向子宫内膜癌发展的中间阶段。一旦女性做刮宫检查结果显示子宫内膜非典型增生，一定要引起重视，提示目前正处于癌前病变的状态。如果治疗不及时很容易发展成子宫内膜癌，危及到女性的生命健康。
[0003]子宫内膜癌诊断的金标准是子宫外转移灶或手术切除组织标本病理学检查，均为侵入式的，对患者造成一定的损伤。目前临床上缺乏早期发现子宫内膜癌的标记物，主要依赖于影像学检查、突变基因和相关蛋白的检测。文献报道，超声诊断对早期子宫内膜癌的灵敏度和特异度不高，假阴性占40%，并且受其他因素的干扰。两种类型子宫内膜癌致癌所涉及的基因突变包括数十种，最有效的检测方法是高通量测序，操作复杂，成本高，不适合子宫内膜癌的早期检测。蛋白的检测项目主要是糖链抗原CA125和人附睾蛋白HE4等等。许多妇科良性疾病会造成血清中CA125增加，造成过度诊疗；而仅11%
‑
33%的子宫内膜癌患者血清CA125升高，容易漏诊。HE4除了在生殖系统的上皮中表达，也在呼吸系统等其他组织正常腺上皮中标的，所以HE4的特异性差。另外，早期的子宫内膜癌CA125和HE4表达不会发生改变，只有中晚期癌症中才表达水平增加。所以这些方法难以做到子宫内膜癌的早期检测。另外，子宫内膜的癌前病变状态非典型增生更是无有效的生物标记物。如果未早发现早治疗，错过最佳预防时机，容易发展成子宫内膜癌，甚至危及到女性的生命健康。国内子宫内膜癌发病率高，亟需高效早期检测的手段。
[0004]近年来的研究表明，表观遗传修饰最主要的形式DNA甲基化可以参与调控细胞的分化、增殖、侵袭等癌症发生相关的生命活动。子宫内膜癌早期往往伴随着相关基因的甲基化改变。基因启动子区域甲基化水平低，基因正常表达；甲基化水平高，基因表达抑制，甚至沉默。肿瘤抑制基因的甲基化水平在癌症早期就表达降低，可以实现早期子宫内膜癌的检测。
[0005]现有技术中针对子宫内膜癌早期检测存在以下不足：
①
忽视子宫内膜非典型增生：子宫内膜非典型增生是子宫内膜癌前病变的状态，大约14%
‑
30%左右的机率转化为子宫内膜癌。
[0006]②
忽视子宫内膜癌不同类型：子宫内膜癌按组织病理学特点与发病原因将子宫内膜癌分为Ⅰ型和Ⅱ型。
[0007]③
对子宫内膜的正常、非典型增生和内膜癌没有预测性的评估。

技术实现思路

[0008]本专利技术提供了一种子宫内膜良恶性病变的生物标志物及其应用，所述生物标志物包括GYPC基因至少一个靶区域内甲基化的核酸序列，其中，所述靶区域选自GYPC基因中以下任一一段甲基化序列及区域：GYPC基因的Chr2: 127413772
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127413893区域；GYPC基因的Chr2: 127413870
‑
127413996区域。
[0009]如上述所述的子宫内膜良恶性病变的生物标志物在制备子宫内膜癌诊断产品中的应用。
[0010]可选的，所述诊断产品包括试剂盒、制剂和芯片中的任意一种。
[0011]可选的，所述试剂盒至少包括用于检测GYPC基因的第二引物对和第二探针，所述第二引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示，所述第二探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；或者，所述第二引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示，所述第二探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。
[0012]可选的，应用所述诊断产品对子宫内膜良恶性病变的生物标志物进行检测过程中，对基因甲基化诊断子宫内膜癌及非典型增生的结果判读的方式如下：用ΔCp值反应特定基因靶区的甲基化水平，其ΔCp值为：ΔCp(GYPC[1])= Cp(GYPC[1])
‑ꢀ
Cp(COL2A1)，ΔCp(GYPC[2])= Cp(GYPC[2])
‑ꢀ
Cp(COL2A1)；因甲基化的ΔCp≤k则判读为甲基化阳性，即表示受检样本是子宫内膜癌及非典型增生或子宫内膜癌；基因甲基化的ΔCp＞k则判读为甲基化阴性，即表示受检样本不是子宫内癌及非典型增生或子宫内膜癌；其中k为一个特定的数值。
[0013]可选的，应用所述诊断产品对子宫内膜良恶性病变的生物标志物进行检测过程中，对子宫内膜病变预测判读的方式如下：。
[0014]与现有技术相比，本专利技术具有以下有益效果：本专利技术筛选出GYPC基因为检测目标基因（靶基因），确定了各基因中最佳的甲基化区域，能够相互联合可用于子宫内膜癌的早期检测。由于子宫内膜癌种类多样，选择多基因
甲基化区域联合检测，形成功能互补，显著提高对子宫内膜癌的诊断性能。该检测对子宫内膜癌及非典型增生的检出具有临床价值。
[0015]除了上面所描述的目的、特征和优点之外，本专利技术还有其它的目的、特征和优点。下面将参照图，对本专利技术作进一步详细的说明。
附图说明
[0016]构成本申请的一部分的附图用来提供对本专利技术的进一步理解，本专利技术的示意性实施例及其说明用于解释本专利技术，并不构成对本专利技术的不当限定。在附图中：图1（a）是本专利技术实验例1中ZBTB38[1] (Chr3: 141130440
‑
141130560)甲基化值ΔCp在良性病变、子宫内膜非典型增生、子宫内膜癌的箱线图；图1（b）是本专利技术实验例1中ZBTB38 [2] (Chr3: 141122572
‑
141122691)甲基化值ΔCp在良性病变、子宫内膜非典型增生、子宫内膜癌的箱线图；图1（c）是本专利技术实验例1中GYPC [1] (Chr2: 127413772
‑
127413893)甲基化值ΔCp在良性病变、子宫内膜非典型增生、子宫内膜癌的箱线图；图1（d）是本专利技术实验例1中GYPC [2] (Chr2: 127413870
‑
127413996)甲基化值ΔCp在良性病变、子宫内膜非典型增生、子宫内膜癌的箱线图；图1（e）是本专利技术实验例1中ZSCAN12 [1] (Chr6: 28367484
‑
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种子宫内膜良恶性病变的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物包括GYPC基因至少一个靶区域内甲基化的核酸序列，其中，所述靶区域选自GYPC基因中以下任一一段甲基化序列及区域：GYPC基因的Chr2: 127413772
‑
127413893区域；GYPC基因的Chr2: 127413870
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127413996区域。2.权利要求1所述的子宫内膜良恶性病变的生物标志物在制备子宫内膜癌诊断产品中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述诊断产品包括试剂盒、制剂和芯片中的任意一种。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂盒至少包括用于检测GYPC基因的第二引物对和第二探针，所述第二引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示，所述第二探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；或者，所述第二引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.10和SEQ ID N...

【专利技术属性】
技术研发人员：陶红，甘鹏，方锦程，裴潇竹，李弘韬，汤红，
申请(专利权)人：湖南宏雅基因技术有限公司，
类型：发明
国别省市：